Вторичная структура тРНК

Рис. 3-17. Вторичная структура тРНК из дрожжей (структура клеверного листа).

Вторичная структура тРНК формируется за счет образования максимального числа водородных связей между внутримолекулярными комплементарными парами азотистых оснований. В результате образования этих связей полинуклеотидная цепь тРНК закручивается с образованием спирализованных ветвей, заканчивающихся петлями из неспаренных нуклеотидов. Пространственное изображение вторичных структур всех тРНК имеет форму клеверного листа (рис. 14.7). [c.186]

Конформация тРНК. Транспортные РНК выполняют в клетках разнообразные функции. Однако основная их задача заключается в осуществлении трансляции. В 1965 г. Р. Холли установил первичную структуру тРИК из дрожжей. Тогда же, исходя из представления, что наиболее стабильное состояние тРНК соответствует образованию максимально возможного количества водородно-связанных пар оснований, а также основываясь на экспериментальных данных по неравномерному гидролизу молекулы рибонуклеазами, Р. Холли предложил модель вторичной структуры тРНК необычной формы — с чередующимися одно- и двухцепочечными участками — и назвал эту структуру клеверным листом (рис. 197). [c.343]

В структурном отношении спаренная (двутяжевая) часть каждой шпильки и черешка представляет собой двойную спираль. Двойная спираль РНК характеризуется 11 парами нуклеотидных остатков на виток. Параметры этой спирали близки к таковым А-формы ДНК Это и есть основной элемент вторичной структуры тРНК (рис. 18). Кроме канонических (Уотсон —Криковских) пар оснований О С и А и, в двуспиральных участках тРНК нередко реализуется пара О и, наиболее близкая по пространственным параметрам к каноническим парам (рис. 19 см. цветную вкладку). [c.35]

Что касается вторичной структуры тРНК, то, как покаэал Эйген, она иожет быть найдена с помощью игровой модели. [c.270]

С наибольшей скоростью модифицируются редкие компоиенты нуклеиновых кислот — инозин и псевдоуридин. Реакиия с карбодиимидом практически не идет с двухцепочечными полинуклеотидами. В нуклеиновых кислотах, содержащих как двухцепочечные, так и одиоцепочечные участки, модифицируются только последние, что используется при исследованиях вторичной структуры тРНК. [c.389]

Как уже отмечалось (см. гл. 1), тРНК представляют собой, по-видимому, наиболее короткие из известных до сих пор природных полинуклеотидов. Кроме того, они отличаются от других полинуклеотидов наличием большего количества редких компонентов. Эти два обстоятельства позволили установить для ряда тРНК первичную структуру, что, в свою очередь, дало возможность построить конкретные модели их вторичной структуры. Однако еще до установления последовательности нуклеотидов был сделан ряд выводов о некоторых общих чертах вторичной структуры тРНК (обзор —см. 2 . 245) [c.285]

Задавшись определенной моделью вторичной структуры тРНК с определенным содержанием комплементарных пар аденин урацил и гуанин цитозин, можно рассчитать соответствующую этой модели дисперсию оптического вращения, если известны изменения, вносимые в картину дисперсии односпиральной молекулы при образовании пар оснований. Величину этих изменений можно приближенно оценить, сопоставляя кривые дисперсий оптического вращения двухспиральных комплексов (поли-А) (поли-Н) и (поли-О) (поли-С) и односпиральных молекул поли-А, поли-и, поли-О и поли-С 2 Такое сопоставление, вообще говоря, дает принципиальную возможность выбора наиболее вероятных типов [c.292]

Подводя итоги, следует сказать, что в настоящее время пока не существует ни одного убедительного доказательства в пользу существования той или другой выдвинутой модели вторичной структуры тРНК. Пользующаяся в настоящее время наибольшей популярностью модель клеверного листа также экспериментально мало обоснована. [c.294]

Как видно из приведенных данных, модификация нуклеозидов под действием акрилонитрила весьма специфична и протекает в мягких условиях, исключающих разрыв фосфодиэфирной связ.ч. Это позволяет применить рассматриваемую реакцию для изучения вторичной структуры тРНК и для функциональных исследований. [c.382]

Однако теперь уже стало ясно, что ь е водородные связи между основаниями являются определяющими для макроструктуры полинуклеотидов, как считали Уотсон и Крик. Поэтому истинным критерием для нахождения вторичной структуры тРНК и иРНК должна стать максимальная длина регулярного комплементарного участка, в котором основания располагаются стопкообразно (критерий максимального спаривания дает для случайных последовательностей весьма дефектные структуры, как это видно, в частности, из рис. 9.7а). Еще лучше, если эти критерии войдут в комбинаторные расчеты с соответствующими весами. [c.415]

Анализ кинетики формирования вторичной структуры тРНК. Наиболее удобным объектом для проверки методов предсказания вторичных структур РНК являются транспортные РНК, вторичные структуры которых хорошо известны и экспериментально подтверждены. Рассмотрим для примера процесс образования вторичной структуры предшественника тРНК из Bombix mor i в процессе транскрипции. Молекула предшественника состоит из 98 нукле- [c.215]

Длина цепи достигает 80 нуклеотидов примерно через 2 с после началя синтеза. Появилась возможность образоваться спирали IV. Таким образом, формируется структура Е, когда к структуре D пристраивается спираль IV. Возможен также другой путь процессинга - непосредственно из структуры С формируется структура F, соответствующая канонической структуре "клеверного" листа. Однако к этому моменту времени вероятность образования структуры F очень мала (0,12) и уступает вероятности образования структуры Е (0,18). По-видимому, этот прямой путь формирования вторичной структуры тРНК не является основным. Должны произойти значительные структурные перестройки, чтобы эта наиболее энергетически выгодная структура стала преобладающей. Заметим, что в это время существует довольно большое количество структур, маловероятных и поэтому не указанных на рис. 6.10. [c.216]

Вторичная структура тРНК , соответствующая модели клеверного листа, содержит 20 пар оснований, образующих 52 водородные связи. В третичной структуре к ним добавляется по крайней мере 40 дополнительных водородных связей. Больщая часть из них не соответствует обычной уотсон-криковской схеме спаривания оснований. Важная роль третичных взаимодействий подтверждается тем фактом, что они всегда затрагивают или неизменные для всех известных последовательностей звеньев, или звеньев, которые меняются координированно в различных последовательностях, сохраняя возможность третичного спаривания. Таким образом, имеются веские основания считать, что главные [c.181]

Нуклеотидные последовательности А- и В-боксов не только существенны для транскрипции, но и необходимы для формирования вторичной структуры тРНК А-бокс кодирует часть О-стебля и петли, а В-бокс-Т1 /иС-петлю и стебель (рис. 8.63). Участие обеих последовательностей в транскрипции генов тРНК и формировании правильной структуры молекул тРНК, которые нужны для синтеза белка, [c.93]

Вторичная структура тРНК ясна из рассмотрения рис. 75. Ее характерной особенностью является спирализация полинуклеотидной цепочки самой на себя в строго фиксированных комплементарных зонах. [c.214]

Смотреть страницы где упоминается термин Вторичная структура тРНК: [c.110] [c.269] [c.570] [c.186] [c.553] [c.391] [c.285] [c.289] [c.289] [c.292] [c.292] [c.319] [c.517] [c.43] [c.299] [c.278] [c.279] [c.89] [c.197] [c.160] [c.311] [c.409] [c.416] [c.144] [c.35] [c.111]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология