Протонирование нуклеиновых кислот оснований

Расчеты электронной плотности сделаны также для оснований, входящих в состав нуклеиновой кислоты,— аденина и гуанина [2, 7]. Данные расчетов по методу молекулярных орбиталей, выполненные Нагата с сотр. [17] для аденина, предполагают следующий порядок изменения величин электронной плотности у атомов N1 > N3 > N7, тогда как Вейллард и-Пюльман [18] дают иную последовательность N7 > N1 > N3. Так как известно, что протонирование аденина проходит по атому азота в положении 1 [19, 20], как и образование окиси [21], то данные Нагата с сотр., по-видимому, лучше согласуются с экспериментом. [c.213]

Фосфодиэфирные связи в нуклеиновых кислотах также подвижны (рис. 1-7). Однако, поскольку основания представляют собой систему плоских сильно гидрофобных колец, окруже11ных лишь небольшим числом способных к протонированию и депротонированию групп, они имеют тенденцию к межплоскостным взаимодействиям (гл. 16), уменьшая при этом до минимума контакт с водой. Это в свою очередь приводит к увеличению жесткости структуры, даже в случае одноцепочечного полинуклеотида. [c.17]

Спектры компонентов нуклеиновых кислот зависят от pH поскольку переход от нейтральной формы основания к протонированной или депротонированной сказывается на распределении электронной плотности в гетероциклических ядрах, а соотношение форм является функцией pH раствора. Протонирование свободной пары электронов атома азота гетероциклического ядра, естественно, сильно сказывается пап — я -электронных переходах (см. гл.З). Сольватация, особенно в полярных растворителях, также существенно влияет на п — я -переходы, вследствие чего плечи на кривых поглощения, соответствующие п — я -переходам, проявляются более четко в неполярных растворителях 2 . Важные изменения спектров происходят, кроме того, при межплоскостных и комплемен-гационных взаимодействиях оснований в полинуклеотидах (см. гл. 4). [c.619]

Спектры всех четырех нуклеозидов чувствительны к pH. Протонирование С и G приводит к значительному сдвигу поглощения в сторону ббльщих длин волн (красное смещение). Депротонирование U или Т при щелочных pH также приводит к существенному красному смешению максимума поглощения. Протонирование А сопровождается гораздо меньщими, но вполне поддающимися регистрации спектральными изменениями. Все эти эффекты весьма полезны для определения степени ионизации отдельных составляющих нуклеиновых кислот, однако в полимерах они становятся более сложными из-за сильного электронного взаимодействия между основаниями. Позже мы обсудим эту проблему. Присутствие фосфатных групп, по-видимому, не сказывается сколько-нибудь заметно на молярной экстинкции различных составляющих нуклеиновых кислот. Например, значения и для АТР, ADP, АМР, аденозина и 3 - или 2 -адениловой кислоты оказываются в пределах ощибки эксперимента одинаковыми. [c.40]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология