Аденозин фосфат конформация

Рис. 7 [31]. Конформация ри-бофосфатных остатков а — цитидин-З -фосфат б — аденозин-З -фосфат

Сравним теперь конформацию цепи — Сз —Оз —Р—О—Н в молекулах аденозин-З -фосфата [31] и цитидин-З -фосфата [14] (рис. 7). Ориентация связей О3 —Рз и О/—Н в обоих [c.176]

Двугранный угол Сз —О3 — Р—О т в аденозин-З -фосфате равен—77° (гош), а в цитидин-3 -фосфате 4-171° транс). Таким образом, конформацию можно в первом случае представить как гош-гош, а во втором — как гош-транс. Оказалось, что структура всех фосфатных групп описывается одной 3 этих двух конформаций [31]. [c.176]

Для большинства рибонуклеозидов и нуклеотидов найдена транс-гош-кон-формация связей Сг —О2 и Сз —Оз, т. е. транс-расположтш связи О—Н относительно связи Сг —Сз и гош-от-носительно связи Сг —С/. Однако в аденозин-5- -фосфате гидроксильная группа находится в ориентации гош-гош. В молекуле цитозин-З-фосфата связь Оз —Р находится в транс-ориен-тации относительно связи Сг —С з и гош — относительно С4 —Сз. Возможно, существование такой конформации связи Сз —Оз обязано наличию водородных связей между гидроксильной группой Ог—Нг и атомами кислорода фосфатной группы. [c.172]

Экспериментальные данные, полученные с помощью рентгеноструктурного анализа, показывают, что остаток рибозы в нуклеозидах и нуклеотидах имеет обычно конформацию V . Такая конформация углеводного остатка была, например, показана рентгеноструктурным исследованием кристаллов цитидина уридина уридин-5 -фосфата аденозина и комплекса аденозин-5-бромуридин 5. Более точные рентгеноструктурные исследования (табл. 2.3) показывают, что наряду со значительным отклонением (0,5—0,6 А) З -углеродного атома остатка рибозы от плоскости кольца, соседний (С-2 ) углеродный атом также выведен из этой плоскости на 0,10—0,15 А в ту же самую или противоположную сторону. Остаток рибозы, таким образом, имеет при этом конформацию, промежуточную между идеализированными конформациями, рассмотренными выше. Так, конформация остатка рибозы в аденозин-З -фосфате является промежуточной между конформа-циями V и V (ближе к первой), а в аденозин-б -фосфате — между конформациями и Тг> [c.131]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология