Цепь конформации

Экспериментальные методы исследования структуры полимеров. Можно сказать, что методологической основой методов исследования молекулярной структуры вещества является принцип наблюдения реакции после подачи импульса. Иначе говоря, тот или иной импульс (например, излучение) подается на исследуемое вещество, и по характерной реакции последнего можно судить о его строении. Характер реакции при таких исследованиях, начиная от метода дифракции рентгеновского излучения и кончая методами исследования реологических свойств, после соответствующей обработки, например с помощью преобразований Фурье, дает информацию о целом спектре структурных уровней вещества. Следовательно, изучение всего спектра структурных уровней данного полимерного образца, в том числе строения повторяющихся элементов цепи, конформации макромолекулы и характера молекулярной агрегации [c.161]

Если макромолекула построена из звеньев, вращение которых вокруг направления соединяющих их связей невозможно, а ориентация этих связей обусловлена ориентацией соседних связей (как, например, в случае лестничных полимеров), то ее характеризуют как предельно жесткую цепь, конформация которой моделируется жестким стержнем. [c.80]

В высокомолекулярных соединениях различают уровни упорядоченности, как-то упорядоченность в цепи (конфигурация элементарных звеньев цепи. конформация, число идентичных мономерных звеньев, расположенных между звеньями другого мономера, и т. д.) упорядоченность отрезков цепи (кристаллическая решетка, ближний порядок в аморфных областях и т. д.) надмолекулярная упорядоченность (величина и форма кристаллической и аморфной области, вид и расположение морфологических форм) [c.414]

Статистические веса г " и г — значения вероятности того, что данный остаток принимает в основной цепи конформацию, находящуюся соответственно в ау -, - и -(растянутая цепь)-областях. Эти области определены на рис. 2.3. [c.136]

Спектры растворенных веществ используют в основном для идентификации функциональных групп (в частности, транс-двой-ных связей), тогда как спектры веществ в твердом состоянии дают информацию о структурных особенностях, полиморфизме, упаковке цепей, конформации и т. д. [c.33]

Заметно различающиеся структурные характеристики молекулы полимера в кристаллическом и жидком состояниях должны проявляться в увеличении конфигурационной энтропии при плавлении. В жидком состоянии молекулы полимера могут приобретать самые различные конформации, от беспорядочно свернутого клубка до удлиненной стержневидной частицы, в зависимости от типа полимера. Приписываемая конкретным цепям конформация зависит от природы мономерных звеньев и характера их взаимодействия. Тормозящие потенциалы, препятствующие свободному вращению мономерных звеньев относительно друг друга, определяются стерическими отталкиваниями и притяжениями между соседними радикалами. [c.136]

П. кристаллизуется в моноклинной ячейке, включающей четыре цепи, конформация — спираль /а плотность полностью кристаллич. полимера 1330 кг/л 3 5 (1,33 г/сж ). Степень [c.213]

Подбирая соответствующие растворители, можно повлиять на степень упорядоченности полимерных цепей, конформацию и конфигурацию макромолекул и др. Так, при синтезе полиарилатов в растворителе, к-рый хорошо растворяет мономеры, но плохо — полимер, происходит сворачивание образующихся макромолекул в глобулы. Напротив, синтез полиарилатов в растворителе, к-рый хорошо растворяет образующийся полимер, приводит к возникновению фибриллярных макромолекул, что обусловливает лучший комплекс физико-механич. свойств полимера. [c.433]

Молекулу, свернутую в беспорядочный клубок, невозможно изобразить с помощью таких сплошных фигур. Вместо этого ее следует рассматривать как множество отдельных массивных точек, связанных в цепь, конформация которой определяется исключительно на основании соображений статистики. [c.152]

Отсюда следует вывод, что, хотя строение полимера, наличие и расположение заместителей в основной цепи, конформация макромолекул, надмолекулярная структура и т. д. являются определяющим фактором в формировании углеродистой структуры и ее свойств, условия карбонизации играют существенную роль. Это можно показать на примере пиролиза полистирола, который почти нацело разлагается до мономера и низкомолекулярных осколков при температуре 350—420° С в высоком вакууме [101 ] и образует около 60% кокса в инертной атмосфере в условиях теплового удара при 1100° С (скорость нагрева до 100 град сек). Основным газообразным продуктом деструкции в последнем случае является водород [102]. [c.181]

В соответствии с результатами рентгенографического исследования Тернер-Джонс предлагает схемы упаковок гребнеобразных макромолекул. В полимерах формы I, которую образуют все изотактические поли-а-олефины, боковые ветви располагаются под прямым углом к основной цепи (конформация которой может быть спиральной) и величина большого периода, найденная экспериментально, хорошо совпадает с рассчитанным значением (табл. 2, рис. 4). Автор предполагает, что при образовании кристаллической формы I преобладает кристаллизация основных цепей, имеющих спиральную конформацию, и осуществляется лишь ограниченная упаковка боковых цепей подобного типа упаковка в некоторой степени соответствует триклинной форме полиэтилена (рис. 4, а). [c.136]

Несмотря на то что полипептидная главная цепь протеинов является полярной (см. сходные с ними полиамиды, описанные в гл. 4), тем не менее полярность значительно изменяется как внутри данного протеина, так и от одной молекулы протеина к другой. Это обусловлено различным характером складывания цепей (конформации), так и разной гидрофобностью аминокислотных групп, в результате чего протеины склонны к уменьшению полярности по сравнению с водорастворимыми глобулярными протеинами. [c.326]

Достигнутое разрешение не позволяет визуализировать вторичную структуру полипептидной цепи. Конформация а-спирали была показана с помощью рентгеновской дифракции. [c.201]

При последующем рассмотрении конформационной статистики мы не будем принимать во внимание эффект исключенного объема, который состоит в физическом ограничении, в силу которого два сегмента цепи не могут одновременно находиться в одном месте пространства. В случае реальных цепей конформации, при которых происходит пространственное перекрывание соседних вдоль цепи элементов, должны быть исключены из рассмотрения, для чего им приписывается очень большая энергия. Однако взаимодействие между удаленными вдоль цепи сегментами обычно трудно поддается последовательному учету. Поэтому излагаемая здесь конформационная статистика ограничивается анализом размеров цепей, не возмущенных эффектами исключенного объема. Эти эффекты [c.127]

Полинг и Кори определили наиболее устойчивые конформации полипептидной цепи, основываясь на данных рентгеноструктурных исследований и на рассмотрении плотной упаковки цепей с максимальным числом водородных связей. Таких конформаций три. Это, во-первых, а-спираль, показанная на рис. 4.2. Она характеризуется поворотом вокруг оси на 100° и перемещением вдоль оси на 0,15 нм на каждое пептидное звено. Соответственно на один полный виток спирали приходится 3,6 пептидной единицы и смещение вдоль оси на 0,54 нм. Водородные связи образованы между С=0-группой данной единицы и Н—N-гpyппoй четвертой предшествующей единицы. Такие связи реализуются между всеми аминокислотными остатками, за исключением пролила (Про), не содержащего К—Н-группы. а-Спираль может быть правой и левой. В первом случае Ф = 132°, г = 123°, во втором — Ф = 228°, ф = 237° (углы отсчитываются от плоской транс-конформации цепи). Конформация а-спирали определяется, в частности, плоским расположением атомов —СО—NH —. [c.89]

Антиклинные энантиоморфные цепи конформация цепи А соответствует последовательности связей типа (ТО )п (правовращающая спираль). Конформация цепи В соответствует последовательности связей типа (0 Т) (левовращающая спираль). [c.569]

П. кристаллизуется в моноклинной ячейке, включающей четыре цепи, конформация — спираль /а плотность полностью кристаллич. полимера 1330 кг/.м (1,33 г1см ). Степень кристалличности полпмеров достигает, по дан- [c.215]

В полном соответствии с этими предсказаниями теории, синдиотактический полипропилен кристаллизуется в виде спиралей, соответствующих чередованию конформаций (0°, 0°) и (—120°—120°), а синдиотактический поли-1,2-бутадиен — в виде плоских цепей (конформации (О", 0°)). В случае синдиотактических полимеров с полярными привесками, например полихлорвинила, разность энергий электростатического взаимодействия связей С—С1 между конформациями (—120°, —120°) и (0°, 0°) составляет по оценке Фордхэма [>31] более 1,5 ккал/моль, что объясняет плоскую структуру этих цепей в кристаллическом состоянии. [c.112]

Мы будем рассматривать ниже преимущественно полимеры, несущие массивные привески у каждого второго атома цепи, например, полимеры ти11а (— lij- Rj—)л —СНз— RR —) . В таких цепях конформации мономерных единиц определяются главным образом взаимодействием соседних массивных привесков (см. гл. 3), так что в качестве первого приближения для таких цепей разумно рассмотреть независимые конформации соседних мономерных единиц. В этом случае, пользуясь общей формулой (5.16) и подставляя в нее матрицу 5 = S (2 ), элементы которой определяются формулами (6.5), и векторы г, вычисленные по формулам (6.6) и (6.7), получаем выражения для hP- и различных типов макромолекул, сведенные в табл. 9 [c.199]

Будут ли протекать реакции на полимерах быстрее или медленнее, чем у их низкомолекулярных аналогов, зависит от доступности групп, тактичности цепи, конформации, влияния соседних групп и т.д. Однако примечательно то, что почти во всех случаях мак-ромолекулярные реакции протекают медленнее и что только при автокатализе или при каталитическом воздействии других функциональных групп происходит ускорение реакции. [c.28]

Рис. и. Период идентичности цепи поли-п-фенилентерефталамида (стрелками указаны возможные направления вращения в цепи конформация коленчатого [c.26]

Так как внутренняя вязкость должна проявляться лищь при деформациях макромолекулы и не должна сказываться при поступательных и вращательных движениях ее как целого, то для учета чисто деформационных движений в цепи Серф вводит систему координат, начало которой совмещено с центром гидродинамического сопрот]1вления макромолекулы в потоке и которая вращается вместе с молекулой. За угловую скорость вращения системы в данный момент времени принимается угловая скорость такой абсолютно жесткой молекулярной цепи, конформация и положение в пространстве которой совпадают с мгновенной конформацией и положением истинной (деформируемой) макромолекулы. [c.565]

Во многих случаях желательно определять молекулярный вес, измеряя только 5 или [ ]. Если произведение. ь-[ ] не зависит от структуры данного образца ДНК и от условий эксперимента, то значения 5 и [г ], взятые в отдельности, могут варьировать в широких пределах в завпси-мости от таких свойств ДНК, как количество цепей, конформация и нуклеотидный состав, а таюке от свойств растворителя (pH, температура, концентрация и вид противоионов, примеси других веществ). Очевидно поэтому, что если для определения М пспользуются только 5 или [т]], мы должны располагать определенными сведениями о препарате ДНК и подбирать такой растворитель, поведение ДНК в котором известно. Для нативной линейной ДНК был нредлон ен целый ряд эмпирических уравнений, связывающих 5 или [г]] с М. Оказалось, что некоторые из них не соответствуют современным данным, применение других ограничено очень узким диапазоном величин молекулярного веса. Из предложенных ранее соотношений между 8 ж М дольше других использовалось уравнение Доти [c.219]

Хотя прочность связи 51—о высока (энергия разрыва связи равна 452 кДж/моль, тогда как для связи 51—51 она составляет 226 кДж/моль, а для связи 51—С 333 кДж/моль), что приводит к высокой термостабильности полиорганосилоксанов [6], потенциал вращения вокруг связи 51—О низкий. В результате этого, а также из-за слабого межмолекулярного взаимодействия, обусловленного экранирующим влиянием органических групп основной цепи, конформация основной цепи может легко изменяться, чему способствует способность валентного угла связи 51—О—51 меняться в щироких пределах. Эти эффекты в иолисилоксанах выражены значительно сильнее, чем в полимерах с основной углеводородной цепью. [c.145]

Последовательность аминокислот, входящих в поли-пептидную цепь, составляет ее первичную структуру. Но критическое значение для каждого белка имеет его способность складываться в определенную конформацию, что сопровождается образованием активных центров или других особенностей структуры, необходимых для выполнения специфической функции в клетке. Формирование вторичной структуры происходит в результате свободного вращения относительно химических связей в первичной структуре полипептидной цепи. Термины конформация и вторичная структура отражают пространственную организацию полипептидного остова. Под третичной структурой понимают законченную трехмерную организацию всех атомов полипептидной цепи, включая боковые группы и полипептидный остов. Следующий уровень организации белков-это мультимерные белки, состоящие из агрегатов нескольких полипептидных цепей. Конформацию мультимерных белков принято называть четвертичной структурой. [c.55]

Главной целью исследователей, изучающих структуру белка, является предсказание трехмерной конформации молекулы по ее аминокислотной последовательности. Из всего сказанного выше ясно, что это чрезвычайно трудная задача. Например, для белка, состоящего всего из 100 аминокислотных остатков в одной полипептидной цепи, конформацию с минимальной свободной энергией необходимо искать (если пренебречь концевыми эффектами) в 200-мерном пространстве, т.е. одновременно изменять 100 углов и 100 углов ф. Даже если мы ограничимся только стерически разрешенными углами фкф, число возможных конформаций такого белка будет равно З = 10 , так как большинству остатков, обладающих боковой группой (таких, как L-аланин), соответствуют три различные области в плоскости [ф, ф] (см. рис. 5.8). [c.277]

Структура кристаллов этидий-иод-ирА однозначно указывает на то, что интеркаляция лигандов вполне возможна. Она позволяет также сделать весьма интересные предположения о природе эффекта исключения мест связывания. Кольцо сахара в В-форме двойной спирали находится в конфигурации 2 -эндо (гл. 3), а в А-форме ДНК и в РНК-11 — в конфигурации Ъ -эндо. Однако в комплексе этидия с 5-иод-ирА (рис. 23.30,/ )сахар находится в конформации У-эндо у нуклеозидов, присоединенных через З -атом, и в конформации 2 -эндо у нуклеозидов, присоединенных через 5 -атом (т.е. структура соответствует 2 -эндо-иод-ир-3 -эндо-А). Такая структура наблюдалась только в динуклеотидах и может быть обусловлена концевыми эффектами, но, если предположить, что она имеет место и в полимерах, можно прийти к весьма интересным выводам. В каждой из цепей конформации сахара 2 - и У-эндо могут чередоваться (рис. 23.30, Г). и это имеет два следствия. Из-за такого чередования оказывается нарушенной симметрия относительно оси вращения второго порядка, лежащей в плоскости пары оснований. Однако ось симметрии С2, расположенная между соседними парами оснований, может сохраняться, и эта ось будет проходить теперь чдзез центр кольца связанного этидия. [c.376]

Поперечнополосатая мышца позвоночных состоит из белковых нитей двух типов, которые взаимодействуют друг с другом. Толстые нити содержат миозин, а тонкие-актин, тропомиозин и тропонин. Гидролиз АТР актомиозином вызывает скольжение указанных нитей относительно друг друга. Миозин представляет собой очень большой по массе белок (500 ьДа), состоя-гций из двух основных цепей и четырех легких цепей. Конформация основных цепей такова, что опи содержат две глобулярные области (головки 81) и присоединенный к ним длинный а-спирализованный стержень. Головки 81 и часть стержня образуют поперечные мостики, которые взаимодействуют с актином, генерируя силу сокращения. Остальная часть молекулы миозина создает скелет толстой нити. Актин - основной компонент тонких нитей - представляет собой глобулярный белок (42 ьДа), который полимеризуется с образованием нитей диаметром 70 А. Толстые и тонкие нити определенным образом направлены, причем посе- [c.279]

КИХ биологически важных веществ, какхоле-стерол, пенициллин и витамин B 2. Инсулин оказался компактным трехмерным образованием (рис. 35.14), из которого торчат только N- и С-концы В-цепи. Между этими двумя вытянутыми ветвями В-цепи располагается А-цепь. Структура имеет неполярную сердцевину, образованную обращенными внутрь алифатическими боковыми цепями остатков аминокислот, принадлежащих А- и В-цепям. Помимо дисульфидных мостиков, инсулин стабилизирован несколькими солевыми связями, а также водородными связями между определенными группами А- и В-цепей. Конформация проинсулина еще не исследована, но, судя по данным спектроскопии, она очень сходна с конформацией инсулина. Об этом же свидетельствует способность проинсулина кристаллизоваться вместе с инсулином. [c.293]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология