Нуклеотидные последовательности различных комбинаций

ДНК-зонды применяют для поиска родственных генов в реакциях гибридизацрш с РНК — для выявления экспрессии данного гена в различных клетках. Для вьывления молекул нуклеиновых кислот, комплементарных всему зонду (или его участку), ДНК-зонды часто сочетают с методом гель-электрофореза, что позволяет получать информацию о размерах гибридизируемых молекул ДНК. Эффективное использование современных приборов, способных автоматически синтезировать любые нуклеотидные последовательности за короткий промежуток времени, дало возможность перестраивать гены, что представляет собой один из важных аспектов генной инженерии. Обмен генами, а также введение в клетку гена другого вида организма осуществляют посредством генетической рекомбинации in vitro. Этот подход был разработан на бактериях, в частности на Е. соИ. Он основан на важном свойстве ДНК — способности к перестройкам, изменяющим комбинацию генов в геноме и их экспрессию. Такая уникальная способность ДНК позволяет приспосабливаться данному виду к изменяющейся среде. Генетическую рекомбинацию подразделяют на два больших класса общую рекомбинацию и сайт-специфическую рекомбинацию. В процессе общей рекомбинации генетический обмен в ДНК происходит между гомологичными нуклеотидными последовательностями, например между двумя копиями одной и той же хромосомы в процессе мейоза (кроссинговера), или при скрещивании и перегруппировке генов у бактерий. [c.112]

Что касается геномной ДНК, то ситуация с теоретической представленностью в ней участков из различных комбинаций даже 15 нуклеотидов несколько сложнее. Так, например, вероятность присутствия в геноме человека, имеюгцего размер около 3 млрд 200 млн пн какого-то одного конкретного 15-нуклеотидного мотива равна всего 3 случаям на каждую цепь. В почти 17-ти млрд пн геноме мягкой гексаплоидной пгпеницы такой мотив может встретиться уже соответственно 32 раза. В то же время, необходимо помнить, что это только теоретически, а на самом деле в этих геномах такой мотив реально может встретиться как множество раз (например, если окажется составной частью повторяюгцейся ДНК), так и ни разу, и очень многое зависит от последовательности нуклеотидов в нем. [c.38]

Представление о том, что первичная структура каждого белка в организме кодируется определенным геном, приводит к весьма существенным выводам. Известно, что в состав белков входит 20 различных аминокислот, в то время как в ДНК содержатся нуклеотиды только четырех видов. Следовательно, соответствие между нуклеотидными и аминокислотными последовательностями не может быть построено по принципу один к одному . Таким образом, необходимо предположить существование такого кода, в котором каждой данной аминокислоте соответствовала бы комбинация из нескольких н)тслеотидов. [c.34]

Рост объема баз данных первичных структур биополимеров немедленно вовлек в сферу изучения генетических текстов традиционные для генетиков методы теории вероятностей и математической статистики. Статистический анализ генетических последовательностей выявил большое количество аномальных характеристик (например, обога-щенность геномов различными повторами, блоками), которые еще предстоит объяснить на функциональном уровне. Это наблюдение показало, что необходимы специальные усилия для того, чтобы корректно описать генетические тексты с помощью математических моделей, в частности с помощью аппарата теории марковских цепей. Такие модели необходимы для оценки статистической значимости гомологий, вычисления компактных информационных характеристик текстов (энтропии, избыточности и т.д.), предсказания частот встречаемости нуклеотидных "слов". В свою очередь, изучение наиболее (или наименее) распространенных слов, выявление участков генома различающихся по частоте использования некоторых "стандартных" комбинаций нуклеотидов, позволяет выдвигать новые гипотезы о функциональной роли фрагментов генетического текста и их эволюционной истории. Перечисленным вопросам посвящена гл. 2 (Бородовский М.Ю. и Певзнер П.А.). [c.6]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология