Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Беспорядочный клубок, спектр

    Потенциальные возможности метода ЯМР позволяют извлекать большое количество информации о структуре белка, так как параметры спектров чувствительны к изменениям как последовательности, так и конформации. Например, в отсутствие всякого взаимодействия спектр полипептида или белка был бы суммой спектров составляющ их аминокислот, каждый из которых хорошо известен. Однако этого не происходит, как видно из рис. 17-11, на котором изображен спектр фермента лизоцима в нативной и денатурированной (беспорядочный клубок) формах и спектр, рассчитанный по аминокислотному составу. Ясно, что суш ествует много различий между наблюдаемым и рассчитанным спектрами — это обычная ситуация. Хотя эти различия меняются от белка к белку, в спектрах имеется несколько обш.их черт, которые, по-видимому, являются характерными для большинства белков. Например, как правило, большие химические сдвиги наблюдают- [c.500]


    В спектрах ЯМР клубка должно наблюдаться дипольное уширение линий из-за того, что большой жесткий клубок может совершать медленное беспорядочное движение, однако здесь мы пренебрежем этим эффектом. [c.241]

    Для белков главными стандартами являются три формы по-ли-L -лизина а-спираль, р-форма и беспорядочный клубок, спектры ДОВ и КД которых показаны на рис. 16-10, Л. Если допустить, что не существует других конформаций и что боковые цепи аминокислот не оказывают влияния на спектры, тогда путем простого графического сложения можно рассчитать ожидаемую кривую для белка, содержащего смесь этих трех конформаций. Пример показан на рис. 16-10, , где изображены наблюдаемая и рассчитанная кривая КД миоглобина (структура которого точно известна из данных рентгеноструктурного анализа). Как можно видеть, анализ является достаточно хорошим, хотя и нет полного совпадения. Такое графическое сложение просто выполнить для расчета кривой белка с известной струк-турой. Однако более интересная проблема — определение вклада трех форм в случае белка с неизвестной структурой — является серьезной задачей, которая решается путем подбора кривых с помощью ЭВМ. Для этого осуществляют неггрерывную подгонку, изменяя долю каждой кривой, и проводят суммирование, пока не будет получена наблюдаемая кривая. [c.467]

    Переход от этой в основном упорядоченной конформации к отдельным цепям беспорядочного клубка приводит к изменению молекулярных размеров, которые проявляются в изменении светорассеяния или свойств, основанных на внутреннем трении макромолекул. За изменениями кажущейся плотности и двукратным уменьшением кажущегося молекулярного веса ДНК за счет диссоциации двойной спирали можно проследить при помощи ультрацентрифугирования в градиенте плотности (гл. IV). Наиболее наглядным доказательством существования перехода спираль — клубок в ДНК является значительное изменение ультрафиолетового спектра поглощения (гл. V). Кроме этих физико-химических методов, однозначным критерием целостности нативной спиральной структуры служит биологическая активность некоторых препаратов ДНК. Авери и др. [3411 обнаружили, что контакт некоторых бактерий с растворами ДНК может привести к трансформации наследственных характеристик микроорганизмов. Эта трансформирующая активность , которая исчезает после денатурации нуклеиновой кислоты, может быть использована в качестве наиболее чувствительного средства определения доли молекул, присутствующих в нативной двойной спирали [342, 343]. [c.127]



Смотреть страницы где упоминается термин Беспорядочный клубок, спектр: [c.34]    [c.27]   
Биофизическая химия Т.2 (1984) -- [ c.117 ]




ПОИСК







© 2025 chem21.info Реклама на сайте