Кольцевые замкнутые ДНК седиментация

Одним из наиболее основательно изученных ДНК-содержащих вирусов является вирус полиомы [93—95]. Ее ДНК, содержащую в сумме 48% гуанина и цитозина [99], можно разделить на три компонента, различающихся по константе седиментации. Компоненты I и II соответствуют двум конфигурациям одной и той же молекулы. Тогда как компонент I, быстрее оседающий, имеет замкнутое или кольцевое строение (стр. 72), цепь компонента II открыта [96—98, 146, 147]. Оба компонента характеризуются одинаковыми величинами плотности и молекулярного веса (3,5-10 ). Компонент I превращается в компонент II в результате одного-единственного разрыва цени, вызванного ДНК-азой. Как кольцевая, так и открытая формы видны на электронных микрофотографиях [98]. Природа компонента III еще не выяснена. [c.156]

В природе найдено уже большое число кольцевых ДНК к ним относятся многие ДНК животного происхождения, а также бактериальные и вирусные, плазмидные и митохондриальные ДНК. Большинство из них не являются одноцепочечными (как ДНК фХ174), не имеют разрывов в одиночных цепях и неспособны находиться в равновесии с линейными формами (как ДНК фага X). Напротив, они представляют собой кольцевые двухцепочечные ДНК с совершенно целыми цепями. Такие структуры называют замкнутыми кольцевыми двухцепочечными всякую кольцевую форму с одним разрывом или более в одиночных цепях называют открытой кольцевой двухиепочечной формой. Замкнутую и открытую структуры нетрудно различить опытным путем (рис. 24.2). Допустим, что мы поместили нашу ДНК в щелочной раствор. В любой открытой структуре при высоком значении pH связи между цепями ДНК разорвутся. Даже при наличии одного разрыва в одной из цепей концы последней смогут вращаться относительно другой цепи, и в результате эти две одиночные цепи разойдутся. При центрифугировании в щелочном растворе кольцевой двухцепочечной молекулы с разрывом в одной из цепей мы обнаружим линейную цепь и одноцепочечное кольцо. При высоком значении pH может произойти разрыв водородных связей между основаниями и в замкнутой двойной спирали, но в этом случае два образовавшихся одноиепочечных кольца не смогут разделиться. Действительно, как мы увидим далее, они остаются настолько переплетенными, что образуется клубок из спутанных одиночных цепей ДНК. Такой весьма компактной структуре отвечает большой коэффициент седиментации, и ее легко отличить от любых свободных одноцепочечных форм. [c.387]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология