Изошизомеры

Известно уже несколько сотен рестриктаз. Часто выделяемые из разных источников ферменты проявляют одинаковую специфичность. Такие ферменты называют изошизомерами. [c.310]

Среди изошизомеров есть ферменты, которые узнают одни и те же последовательности, но разрезают их по-разному. Такие рестриктазы иногда называют гетерошизомерами. Например, рест- [c.55]

Так, для ВатШ найдено 20 изомеров, из них четыре изошизомера, у Рхй описано 42 изомера, из них девять изошизомеров и т. д. [c.168]

Рестриктазы BamHI и BglW не являются изошизомерами, но образуют одинаковые липкие концы Возможно ли ковалентное объединение разноименных рестриктов в присутствии ДНК-лигазы [c.267]

Относительно качественной стороны распространения рестриктаз выявления каких-то генетических связей между спектром вариантов последовательностей нуклеотидов, узнаваемых рестриктазами, и их таксономической принадлежностью, Робертсом [312] никакие обобщения не были предприняты. Это вполне объяснимо, так как в то время была охарактеризована субстратная специфичность только 47 рестриктаз. Однако, было обращено внимание на тот факт, что имеются ферменты, узнающие одинаковые последовательности нуклеотидов (изошизомеры), содержащиеся у представителей различных, иногда очень отдаленных таксонов. Обнаружение явления изо-шизомерии указывало на то, что если имеется таксоноспеци-фичность рестриктаз, то она не выражена в явной форме. [c.16]

В первую очередь эти трудности связаны с тем, что для экспериментов по поиску рестриктаз характерна целенаправленность в стремлении выявить новые по специфичности ферменты или высокопродуктивные штаммы изошизомеров, сопровождающаяся определенной стихийностью в отношении выбора объекта работ. Сложившаяся ситуация находит объяснение в превалировании в этих исследованиях прикладного аспекта над теоретическим. Вопросы, связанные с целенаправленным изучением закономерностей распространения рестриктаз, прак- [c.16]

Имевшиеся к началу рассматриваемых исследований литературные сведения о распространенности рестриктаз [312], как уже отмечалось, мало что давали для обобщений, касающихся качественных ее аспектов. Однако, уже в то время было отмечено наличие ферментов, обладающих идентичной субстратной специфичностью (изошизомеры), у представителей различных, иногда отдаленных таксонов прокариотических микроорганизмов. Обнаружение явления изошизомерии было принято как указание на отсутствие строгой таксоноспецифичности рестриктаз [312]. Под этим термином подразумевается такой вариант таксоноспецифичности, когда рестриктаза определенной субстратной специфичности имеется только в штаммах одного вида. [c.25]

Если вернуться к вопросу о строгой таксоноспецифичности некоторых рестриктаз, представляющей другой аспект обсуждаемой проблемы, то следует отметить, что он еще более трудно доказуем, чем вопрос об ограниченной вариабильности субстратной специфичности. В 1976 г. были охарактеризованы 22 рестриктазы с различной субстратной специфичностью [312]. Среди них 14 прототипов встречались только в одном штамме. К концу 1988 г. из прототипов, обнаруженных в 1976 г., только один (Нае I) не имел изошизомера [319]. Таким образом, существующая тенденция появления рано или поздно изошизомеров прототипов говорит в пользу предположения об отсутствии (или по меньшей мере ограниченности) строгой таксоноспецифичности рестриктаз и скорее всего можно говорить о разной распространенности изошизомеров определенных типов специфичности. [c.30]

В настоящее время охарактеризована субстратная специфичность более чем тысячи рестриктаз (табл. 8). Среди них имеются 143 фермента, узнающих различающиеся нуклеотидные последовательности (прототипы). Остальные специфические эндонуклеазы, узнающие участки ДНК, идентичные таковому одного из прототипов, входят в группу так называемых изошизомеров [312]. [c.33]

Вариация характера расщепления участков узнавания внесла некоторые поправки и в понятие изошизомерии. Были выявлены рестриктазы, узнающие идентичные последовательности, но различающиеся по месту их расщепления. Например, рестриктазы Sma I и Xma I узнают одинаковые последовательности нуклеотидов, но первая из них при разрыве ДНК образует фрагменты с тупыми концами [319], а вторая расщепляет узнаваемый участок с образованием 5 -выступающих тетрануклеотидных концов [132]. Такие изощизомеры было предложено называть ложными [49], [c.43]

Думается, что для обозначения рестриктаз, узнающих одинаковые последовательности нуклеотидов, но расщепляющих их в разных местах, вполне приемлемым является термин альтернативные прототипы (alter — один из двух) [102]. Он позволяет подчеркнуть прототипность таких ферментов как в отношении функционального проявления, так и следующих из этого различных возможностей в случае их применения в качестве аналитических реагентов. Наличие в термине ложный изошизомер (изос — равный, схизос—расщепляю) [49] последнего слова как бы стушевывает эту разницу. [c.44]

Рассмотрение литературных данных убеждает, что истинные изошизомеры встречаются чаще, чем альтернативные прототипы. Последние перечислены в табл. 11. [c.44]

Чувствительность изошизомеров к местоположению метилированного основания [c.57]

Изошизомеры могут отличаться по чувствительности в отношении местоположения метилированного основания в узнаваемой последовательности нуклеотидов. Среди исследованных в этом аспекте ферментов удалось выявить 15 пар ферментов по разному реагирующих на метилирование одного и того же основания в узнаваемом участке (табл. 13 в таблице не приведены ферменты-изошизомеры, обладающие такой же чувствительностью к модификациям субстрата). Кроме того рестриктазы SauSA I, Mbo I и Dpn I различаются не только по чувствительности к модификации аденина в узнаваемом участке 5 G AT , но в случае Dpn I именно только такой (модифицированный) субстрат и расщепляется этим ферментом. [c.57]

Название фермента (изошизомеры) Специфичность Название фермента (изошизомеры) Специфичность [c.61]

Источником специфических эндонуклеаз являются штаммы микроорганизмов, каждый из которых, учитывая исключительную пестроту таксономической их принадлежности (см. разд. 2, 1-ая часть), в общем случае содержит уникальную композицию белков и других растворимых клеточных компонентов. Рестриктазы а priori отличаются по физико-химическим свойствам. Это утверждение предположительно справедливо и в отношении многих изошизомеров. Поэтому очевидно, что в общем случае выделение и очистка каждого отдельно взятого фермента является индивидуальной задачей. Однако, рассмотрение литературных данных позволяет выделить некоторые общие используемые с этой целью методические приемы. [c.143]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология