Вторичная структура конформация рассеяния

Интенсивное изучение пространственного строения синтетических полипептидов продолжалось в течение 1950-х и первой половины 1960-х годов. Были привлечены практически все известные физические и физикохимические методы, позволяющие получать информацию о строении молекул в твердом состоянии и в растворах. Наибольшее количество данных было получено с помощью рентгеноструктурного анализа, методов рассеяния рентгеновских лучей под малыми углами, дисперсии оптического вращения, кругового дихроизма и дейтерообмена, с помощью обычных и поляризованных инфракрасных спектров. Из полученного при исследовании синтетических полипептидов огромного экспериментального материала, однако, не удалось сделать обобщающих заключений о причинах стабильности регулярных структур и сказать что-либо определенное на этой основе о принципах структурной организации белков. И тем не менее, результаты исследования повсеместно были восприняты как подтверждающие ставшее общепринятым представление о том, что пространственное строение белковой глобулы представляет собой ансамбль унифицированных регулярных блоков вторичных структур, прямую информацию о геометрии которых дают высокомолекулярные синтетические пептиды. а-Спиральная концепция Полинга не только не была поставлена под сомнение, но еще более утвердилась. В 1967 г. Г. Фасман писал "Общепризнано, что лишь несколько конформаций, благодаря своей внутренней термодинамической стабильности, будут встречаться наиболее часто и, по-видимому, именно они составляют общую основу белковой структуры" [5. С. 255]. Между тем, в то время уже были известны факты, настораживающие от безусловного принятия а-спиральной концепции Полинга. Но они выпадали из множества других фактов, согласующихся с традиционным представлением, казавшимся логичным и правдоподобным, к тому же не имевшим альтернативы. Поэтому на данные, противоречащие концепции Полинга, долгое время не обращали внимания. [c.72]

Табл. 8.7 иллюстрирует зависимость параметров полос амид I и амид П в спектрах комбинационного рассеяния некоторых полипептидов от вторичной структуры. Налицо четкие различия между а-спиралями, 8-слоями и беспорядочными конформациями. [c.121]

Была сделана попытка построить стереохимиче-ские модели различных третичных структур аланиновой тРНК (из дрожжей) на базе известной нуклеотидной последовательности и предложенной Холли вторичной структуры молекулы типа клеверный лист , затем рассчитать для каждой полученной модели интенсивности малоуглового рассеяния рентгеновских лучей и сопоставить эти значения с экспериментальными величинами Лучшее совпадение было получено для модели, схематически изображенной на рис. 4,25 (хотя при углах выше 60 мрад наблюдаются заметные расхождения). Такая конформация, по-видимому, согласуется с имеющимися данными. Действительно, петля с антикодоном находится в менее экранированном состоянии, чем две другие петли, что должно обеспечивать большую реакционную способность этого участка. Изложенное, конечно, не исключает возможности существования и других 33 моделей . [c.298]

Из-за отсутствия соответствующей теории, как уже обсуждалось ранее, для установления вторичной структуры белка разработан эмпирический подход, согласно которому определяют кривые ДОВ и КД для модельных полипептидов. (Для модельного полипептида характерна только одна конформация и его структура известна из данных по рассеянию рентгеновских лучей.) Затем пытаются из этих стандартных кривых построить средневесовую кривую, которая была бы такой же, как наблюдаемая кривая образца. [c.467]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология