Физическое картирование генома человека

Искусственные дрожжевые хромосомы (YA ) предназначены для клонирования больших фрагментов ДНК (100 т. п. н.), которые затем поддерживаются в дрожжевой клетке как отдельные хромосомы. УАС-система чрезвычайно стабильна. С ее помощью проводили физическое картирование геномной ДНК человека и анализ больших транскриптонов, создавали геномные библиотеки, содержащие ДНК индивидуальных хромосом человека. YA -вектор напоминает хромосому, поскольку он содержит последовательность, функционирующую как сайт инициации репликации ДНК (автономно реплицирующуюся последовательность), сегмент центромерной области дрожжевой хромосомы и последовательности, образующиеся на обоих концах при линеаризации ДНК и действующие как теломеры, обеспечивающие стабильность хромосомы (рис. 7.3). При встраивании чужеродной ДНК в YA может происходить нарушение рамки считывания маркерного дрожжевого гена. В результате продукт этого гена не образуется, и при выращивании клеток на специальной среде можно наблюдать цветную реакцию. Кроме того, некоторые YA -векгоры несут селективный маркер, независимый от сайта клонирования. Несмотря на все преимущества, YA пока не использовались для промышленного синтеза гетерологичных белков. [c.137]

В начале 80-х годов стало очевидно, что современкому генному инженеру компьютер необходим не менее (а иногда и более) чем физи ку, химику или экономисту. Возникла необходимость в создании автоматизированного рабочег о места генног о инженера. При этом выявилось, что ряд задач, возникающих у генных инженеров, связан с анализом огромного количества вариантов. Такие задачи не поддаются решению при помощи "лобовых подходов, для их анализа необходимо применение методов современной дискретной математики. Одна из та ких задач физическое (рестрикционное) картирование молекул ДНК -рассматривается в гл. 5 (Певзнер П.А.). Физическое картирование -один из самых распространенных методов анализа ДНК. В связи с предполагаемым ссквенированием генома человека объем работ по физическому картированию в ближайшие годы будет значительно увеличен. В настоящее время физическое картирование - один из разделов компьютерной генетики, где удалось "заставить" работать серьезные результаты из разных областей математики (теория графов, потоки в сетях, эргодическая теория). [c.7]

Важнейшую роль в структурных исследованиях генома играет изучение его полиморфизма. Этот раздел молекулярной генетики является основой для понимания принципов молекулярной эволюции, механизмов возникновения патологических мутаций, для оценки факторов риска при воздействии потенциальных токсических агентов окружающей среды на человеческий организм, наконец, для понимания основ различной индивидуальной восприимчивости лекарств. Эти исследования получили новый импульс с открытием полиморфных мини- и микросателлитов, которые позволили осуществить тонкое генетическое картирование генома и в конечном счете создать интегрированные карты генома, объединяющие физические и генетические карты генома человека в единую систему. Это в свою очередь привело к развитию методов позиционного клонирования, которые позволяют быстро клонировать гены, начав с исследования их сегрегации в семьях. [c.7]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология