функции f структурные исследования

Высокая характеристичность флуоресцентных спектров, проявляемая индолами, служит основой нескольких методов их идентификации и анализа [13]. Эти методы особенно пригодны для биологически важных молекул, так как они обладают большей чувствительностью, чем УФ-спектральная техника, и часто позволяют обнаруживать субмикрограммовые количества веществ. В водном растворе сам индол имеет максимум флуоресцентного возбуждения при 287 нм и максимум эмиссии прп 355 н, с квантовой эффективностью 46% [14]. Хотя первый максимум относительно мало чувствителен к природе растворителя, второй максимум заметно изменяется при уменьшении полярности, изменяясь до 297 нм в циклогексане. Заместители в молекуле индола также оказывают значительное влияние на положение максимумов, что используется для корреляции в структурных исследованиях. Например, изменение в ионизации а-аминокислотной функции триптофана с изменением pH отражается в изменении спектра [c.493]

В настоящем сборнике рассмотрены физико-химические свойства (главным образом магнитные и электрические) и их связь с кристаллической структурой и строением электронных оболочек элементов для ряда сложных конденсированных систем (интерметаллические соединения, гидриды переходных металлов, системы окислов редкоземельных металлов). Рассмотрены также магнитные свойства соединений урана, структура и свойства полупроводников типа —В и катализаторов. Приведены методы определения и расчета термодинамических функций для сплавов металлов и расплавов солей и метод математической обработки структурных исследований с помощью вычислительных машин. [c.279]

Биоорганическая химия, ставшая сейчас столь быстро развивающейся перспективной областью физико-химической биологии, занимается исследованием структуры и функции биологически важных соединений методами органической химии. Ее объектами являются и биополимеры, и низкомолекулярные биорегуляторы поэтому поле деятельности этой пауки исключительно широко. Однако пропикновение строгих представлений и методов органической химии в область, изучающую различные системы клетки и различные уровни ее структурной организации, неодинаково как с качественной, так и с количественной точки зрения если среди низкомолекулярных биорегуляторов, часто называемых просто природными соединениями, позиции биоорганической химии прочны и действенны, то при исследовании биополимеров [c.5]

В принципе важно было бы учесть в атомных амплитудах и перераспределение электронной плотности. Эту задачу решить нелегко прежде всего потому, что определение распределения р(г) в ячейке, а значит, и области, относящейся к каждому атому, само является конечной целью структурного исследования. Итерационный процесс применить здесь крайне трудно, так как поправки к fj каждого атома пришлось бы на каждом шаге итерации находить в численном виде. Приближенный метод, получающий все более широкое распространение, заключается в так называемом мультипольном представлении распределения электронной плотности по атому, т. е. в виде суммы подходящих функций, содержащих не только радиальные, но и азимутальные множители с численными параметрами, подлежащими уточнению. Фурье-преобразование мультипольного представления р/ (г) дает атомную амплитуду / (Н) также в виде суммы функций, в которые входят те же численные параметры. Ути параметры уточняются вместе с координатами атомов и другими константами в общей схеме МНК, описанной выше . [c.183]

При проведении структурных исследований полимерных мембран возникают существенные трудности. Они объясняются прежде всего тем, что структура мембран изменяется в процессе разделения и является функцией многих параметров например, разветвленности и регулярности полимерной цепи, способа и режима получения мембраны, наличия пластификатора и стабилизатора, а также трудностями количественной оценки размеров надмолекулярных структур. [c.65]

Расчет функции распределения длин последовательностей можно рассматривать как задачу-максимум при структурном исследовании нерегулярных макромолекул. В ряде случаев решение этой задачи упрощается в результате слабого перекрывания полос цепочечных [c.78]

Сигнальные графы весьма полезны при анализе сложных ХТС, при выводе основных соотношений теории обратной связи, а также при исследовании той роли, которую выполняет какой-либо отдельный параметр во всей системе. Структурная блок-схема оказывает помощь при анализе характеристик элементов ХТС. После того как из результатов расчета становится известной структурная блок-схема системы, необходимо в отдельности реализовать коэффициенты функциональных связей отдельных блоков, входящие в матрицы преобразования соответствующих элементов. Применение сигнальных графов обеспечивает гибкий метод определения большого разнообразия технологических схем, эквивалентных данной системе. Таким образом, хотя общий метод синтеза для реализации заданной передаточной функции ХТС отсутствует, сигнальные графы значительно облегчают синтез системы. [c.169]

В ОДНИХ местах и меньшей в других. Как и любую периодическую функцию, это распределение можно представить в виде суммы синусов и косинусов (ряд Фурье), и коэффициенты при членах этого ряда оказываются равными отдельным структурным факторам, поделенным на объем элементарной ячейки. Используя предварительный набор структурных факторов, можно вычислить, таким образом, электронную плотность р(х, у, г) в зависимости от положения в кристалле. Эти вычисления довольно трудоемки, и часто предпочитают, особенно на первых стадиях структурного исследования, рассчитывать двумерные синтезы Фурье, дающие р(х, у) и т. д. Величины р(х, у) представляются в виде контурных карт, изображающих проекции электронной плотности на выбранную плоскость кристалла. Если какие-либо молекулы расположены более или менее параллельно рассматриваемой плоскости, то из проекции довольно точно можно определить положение атомов таких молекул. Положения атомов, выведенные таким путем из нескольких проекций электронной плотности, могут использоваться теперь для получения лучшего соответствия с наблюдаемыми интенсивностями, и затем строятся новые синтезы Фурье. Несколько повторений такой операции приводят, наконец, к наилучшему возможному набору параметров для исследуемой структуры. Карта электронной плотности приведена в приложении на рис. 17. [c.315]

Структурные исследования фосфиновых соединений рассматриваемого класса интересны не только для определения структурной функции компонент, образующих молекулы, и установления общей конфигурации комплексов, но и для сопоставления длин связей металл — лиганд. Сравнительно большой объем структурных данных позволяет сделать некоторые заключения об общем интервале значений, в которых лежат расстояния Рс1—Р и Р1—Р, о зависимости этих расстояний от природы других лигандов и их взаимного расположения и даже о зависимости тех же расстояний от природы функциональных групп, присоединенных к атомам фосфора. [c.47]

Увеличение количества экспериментальных данных и повышение трудоемкости расчетов при переходе от проекций к трехмерным распределениям обусловливают общую характерную черту большинства структурных исследований расшифровка атомного мотива всегда начинается методом проекции и лишь по мере необходимости привлекаются данные общего пространственного распределения электронной плотности. В тех случаях, когда совокупность обычных проекций не позволяет с достаточной убедительностью разобраться в значении отдельных максимумов, а трехмерное распределение требует чрезмерно большой экспериментальной и расчетной работы, полезно прибегать к специальным приемам расшифровки структуры—методом поясных и взвешенных проекций. Описание сущности этих методов и вывод соответствующих общих формул были даны в гл. III, посвященной рядам Фурье. В гл. IV рассматривалось применение этих методов к анализу межатомной функции. В этом параграфе описывается пример использования метода взвешенных проекций при анализе распределения электронной плотности. [c.521]

В результате структурных исследований было установлено, что тиоцианатные группы могут присоединяться к центральному атому атомом азота или атомом серы, часто имеют мостиковую функцию, а иногда играют роль внешнесферных ионов. Структурные исследования показали также, что введение в комплекс линейного асимметричного структурного элемента, каким является группа 5СЫ, как правило, ме меняет координацию, характерную для того или иного центрального атома, но существенно влияет на характер связи металл—лиганд. [c.168]

Мутации, вызываемые путем сайт-специфичного воздействия,, используют сегодня для проверки адекватности результатов структурных исследований. В некоторых случаях с их помощью-удалось показать, что структурная стабильность белка и его каталитическая активность могут быть разобщены. Накопив достаточное количество информации о взаимосвязи между стабильностью структуры белка и его функцией, мы, возможно, сумеем осуществлять тонкую регуляцию активности биологических катализаторов и создавать полностью синтетические их аналоги. Недавно появилась работа, в которой сообщалось о клонировании первого синтетического гена фермента, кодирующего активный фрагмент молекулы рибонуклеазы. [c.184]

Для карбоксипептидазы А (КПА) из поджелудочной железы быка известны и трехмерная структура [1—3], и полная аминокислотная последовательность [4]. Роль существенно важного металла установлена менее определенно, но она доступна изучению с помощью разнообразных спектроскопических [5, 6] и кинетических [7, 8] методов. Следовательно, этот фермент можно включить во все увеличивающийся список белков, для которых возможно провести корреляции структуры и функции. Любой предлагаемый механизм катализа под действием КПА должен теперь учитывать как накопленные химические данные, так и взаимодействия, наблюдавшиеся при структурном исследовании кристаллов комплекса карбоксипептидазы с модельным субстратом глицил-ь-тирозином [3, 9]. [c.504]

Рис. 116. Структурное исследование кристаллов Р1(ЫНд)2 С12-транс а—проекция структуры на плоскость XZ , б—проекция межатомной функции на плоскость иШ

Рис. 153. Структурное исследование пенициллина а—проекция UW межатомной функции рубидиевой соли б—проекция межатомной функции калиевой соли

Гипотеза, сформулированная Полингом [241 ], о природе переходного состояния фермент-субстратных комплексов утверждает, что функция ферментов определяется их способностью к более прочному связыванию форм переходного состояния, чем молекулы субстрата, и что это свойство обусловливает понижение свободной энергии активации реакции. На основании структурных исследований Липскомба и сотр. [29, 188, 189], свидетельствующих о координации карбонильного кислорода субстрата катионом металла, можно предполагать, что такой же способ координации существует в переходных фермент-субстратных коплексах металлсодержащих аналогов КПА. Следовательно, прочность связи металл— кислород, образующейся при присоединении субстрата, может давать существенный вклад в стабилизацию переходного фермент- [c.96]

Открытие диссоциации рибосом сыграло очень большую роль в их дальнейшем изучении. Именно разделение субчастиц и их выделение поджило отправной точкой для структурных исследований отдельно большой и малой субчастицы, для выделения и изучения индивидуаль-Hf>ix 16S (18S) и 23S (28S) рибосомных РНК, для выделения и изучения Врибосомных белков каждой субчастицы. Кроме того, стало возможным изучение парциальных функциональных активностей на изолированных рибосомных субчастицах, таких как связывание матричной РНК, связы- ание аминоацил-тРНК, пептидилтрансферазная функция, связывание гидролиз ГТФ И Т. п. [c.119]

В книге собран и обобщен обширный новейший экспериментальный материал по химии и биохимии гликопротеинов — представителей одной из важнейших групп углеводсодержащих биополимеров, широко распространенных в организме человека и животных и выполняющих наравне с белками и нуклеиновыми кислотами ответственные и разнообразные функции (например, они участвуют в явлениях иммунитета, в системе свертывания крови, входят в состав межклеточных и суставных жидкостей, соединительных тканей). В книге представлены все методы анализа гликопротеинов, химические и физико-химические методы их исследования и результаты структурных исследований отдельных гликопротеинов. [c.4]

Катализируемый гидроксильным ионом гидролиз (или омыление) эфиров является одной из наиболее изученных органических реакций. Данные о влиянии структуры на реакционную способность, данные о положении расщепляемой связи, полученные как с помощью меченых соединений, так и в результате структурных исследований, а также данные по изотопному обмену дополняют друг друга и показывают, что механизм этой реакции соответствует нуклеофильному катализу. Нуклеофильный катализ можно определить как реакцию нуклеофильного вещества с субстратом, приводящую к образованию неустойчивого промежуточного продукта, который затем превращается в продукты реакции, регенерируя катализатор [1]. Гидроксильный ион выполняет все перечисленные выше функции за исключением последней, так как он расходуется при достижении конечного равновесия. Поэтому реакция должна быть, строго говоря, названа нуклеофильно-промотируемым гидролизом. Механизм этого процесса [уравнение (32а)] сходен с механизмом, предложенным для гидролиза эфиров, катализируемого ионом гидроксония. Ряд подобных [c.73]

Химическая стабильность эфирной связи в простых эфирах позволяет использовать при структурных исследованиях различные методы деградации без затрагивания эфирной связи аналогичным образом, существует широкий круг синтетических методик, позволяющих превращать простые эфиры в гораздо более сложные структуры. Например, устойчивость эфирных групп к расщеплению и миграции в ходе гидролиза, восстановления и превращения в удобные для анализа производные служит важным фактором, превращающим метилирование в один из самых надежных методов определения структуры полисахаридов [164]. В то же время такая устойчивость к расщеплению ограничивает возможности использования эфирных групп для защиты гидроксильных функций в ходе синтетических последовательностей лишь некоторыми специальными случаями [165]. Один из таких случаев наблюдается при достаточной устойчивости конечного продукта в относительно жестких условиях удаления защищающих групп. К немногим эфирным группам, которые могут широко использоваться для защиты вследствие легкости их удаления, следует отнести бензильную, другие арилметильные и силильную (см. часть 13). [c.332]

Таким образом, секретин в качестве гормона участвует в деятельности пищеварительной системы, центральной нервной системы и симпатической части вегетативной нервной системы, причем в каждой из них он выполняет ряд регуляторных, а возможно, и других функций. Иными словами, молекула секретина полифункциональна. Исследование разнообразных натуральных и синтетических фрагментов секретина показало, что всем спектром гормональной активности обладает целая интактная молекула [229, 230]. В структурных исследованиях обычно используют синтетический гормон [231-233]. Кривые КД и ДОВ синтетического секретина и его фрагмента (5-27) оказались сходными по основным характеристикам [233] был сделан вывод, что в стабилизации конформации секретина в растворе вклад его N-концевого тетрапептидного участка невелик. Исследование методом кругового дихроизма последовательно наращиваемых синтетических фрагментов секретина показало, что пептидная цепь молекулы частично свернута в а-спиральную форму [232-234] были выделены два потенциально возможных спиральных участка - один в N-концевой, другой [c.372]

Метод наименьших квадратов и метод Карля—Хауптмана, так же как и алгебраический метод Аврами, базируются на представлении о структуре как совокупности дискретных атомов. Однако наибольшие успехи структурных исследований связаны с трактовкой кристаллического пространства как пространства с непрерывно распределенной электронной плотностью. На этом и основан предложенный в 1935 г. Паттерсоном метод межатомной функци и—метод, ставший в дальнейшем основным приемом решения громадного большинства структурных задач. Расчет межатомной функции Р туи) по значениям структурных факторов связан с представлением ее в виде ряда Фурье и, следовательно, производится при помощи стандартных вычислительных схем и приспособлений. В результате синтеза / -ряда мы получаем данные о совокупности межатомных векторов. Анализ совокупности межатомных векторов в принципе позволяет найти и самое атомную конфигурацию. [c.419]

В связи с изотопностъю ядерной амплитуды рассеяния нейтронов на нейтронограммах отсутствует спад интенсивности отражений при больших углах, характерный для рентгенограмм. Это имеет существенное значение для структурных исследований жидкостей, цель которых — нахождение функции радиального распределения, для чего необходимо измерить сечение рассеяния в достаточно широком диапазоне углов рассеяния, в том числе при больших углах. [c.206]

Миозин является белком многих качеств. В сокращении скелетных, сердечных и гладких мышц и во внутриклеточных движениях он одновременно выполняет, по крайней мере, три ключевых функции - структурную, аллостерическую и ферментативную. Наиболее полезная информация о функциях миозина была получена при исследовании поперечнополосатых скелетных мышц, сокращающихся произвольно, а также аналогичных тканей беспозвоночных, прежде всего летательных мышц насекомых. Электронно-микроскопическое изучение продольных и поперечных тонких срезов скелетных мышц, впервые проведенное в 1953 г. X. Хаксли, выявило высокий уровень их структурной организации [439]. Уже в следующем году X. Хаксли вместе с Дж. Хенсоном предложили так называемую модель скользящих нитей, которая имела основополагающее значение для понимания природы и молекулярного механизма мышечных сокращений [440]. Скелетные мышцы - это пучки мышечных волокон, наиболее крупным повторяющимся структурным элементом которых является миофибрилла - цилиндрическая нить диаметра 1-2 мкм (1000-2000 А), идущая от одного конца клетки до другого. Миофибрилла, в свою очередь, содержит белковые филамен-ты двух типов толстые и тонкие. Основной белок толстых нитей - миозин, тонких - актин. Миозиновые и актиновые филаменты в миофиб-рилле строго упорядочены. Функциональной сократительной единицей миофибриллы является саркомера, имеющая длину около 2,5 мкм и разделяющаяся на I- и А-диски (рис. 1.31). Толстые филаменты (длина 1,6 мкм и толщина 0,015 мкм) тянутся от одного края А-диска до другого, а тонкие (длина 1,0 мкм и толщина 0,008 мкм) идут от [c.120]

Обсуждая проблемы биотехнологии, мы уже показали, что ясное понимание структуры макромолекул открыло нам пути к познанию их функхщй в биосистемах. Достичь такого понимания нам позволили структурные исследования, работы по химической модификации и более глубокое уяснение связи между молекулярным строением и биологической функцией, а также новые методы молекулярной генетики. [c.167]

Систематические структурные исследования соединений Р11У р 1У составов МАД , МАДз , М(АА)Х4 и М(АА)Хг не проводились. В нескольких опубликованных работах решались частные стереохимические вопросы, связанные с необходимостью установлеш1я структурной функции отдельных лигандов. [c.75]

Наконец, предварительное структурное исследование кристаллов Pd(PPr3)2(N S)2 подтвердило предположение об обращении роданогрупп в фосфипных соединениях Pd, основанное на спектральных данных. В отличие от других соединений Pd и Pt, приведенных в табл. 1, оно оказа.лось изорода-нидным. Это заключение вытекает из того, что максимум проекции межатомной функции, отвечающий вектору Pd—S, удален от начала координат на - 4,6А. [c.190]

Авторы структурного исследования этих соединений полагают, что основой аналогии между описанными комплексами с ЗОг- и с ЫО-группами является необычная о-акцепторная функция этих лнгандов (в отличие от обычной а-донорной и л-акцепторной функции 50г и N0, например, в [Ни(ЫНз)4-ЗОгСиС и в многочисленных нитрозосоединениях рутения). Альтернативное объяснение различия в характеристике координированной группы ЗОг было проведено в разделе, посвященном соединениям рутения (стр. 26). [c.46]

Более прецизионное сопоставление длины связей при конфигурациях с и (Р, к сожалению, невозможно из-за относительной малочисленности данных по соединениям Ре и по низкоспиновым соединениям Со . К тому же структурно исследованные соединения Ре Со и Со слишком различны по составу и по структурной функции лигаидов. Например, в структуре Ре(Н20)2С12 координация металла октаэдрическая, а атомы хлора мостиковые, а в высокоспиновых соединениях кобальта [c.56]

Более или менее полное структурное исследование было проведено в 1955 г. [69] для рацемата аспарагиновой кислоты. Кристаллы относились к пространственной группе 121а с размерами элементарной ячейки а = 9,18 А-, Ъ = 7,49 А с = 15,79 А р = 96 Z = 8. Удовлетворительная модель структуры была выведена из проекций функции межатомных векторов при широком использовании метода проб и ошибок. Некоторое уточнение структуры проведено по проекциям электронно плотности. Однако изнза большого перекрытия атомов в них точность определений координат низка (окончательные значения факторов расходимости R(Okl) = 25%, R(hOl) = 20%) и имеет смысл говорить только об общих чертах структуры. Предварительные координаты базисных атомов приведены в табл. 25. [c.67]

Вообще понятия сложная система и большая система несколько условны с точки зрения определения их границ и параметров. В широком смысле под системой можно понимать совокупность элементов, находящихся во взаимодействии. Это, видимо, в известной мере справедливо но отношению к системам любой п]эироды (механической, биологической, социально-экономической). Под сложной системой производственно-хозяйственного характера (предприятие, объединение, министерство) будем подразумевать систему, в которой в силу свойств и специфики задач, возникающих ири ее исследовании, необходимо принимать во внимание большое количество взаимосвязанных и взаимодействующих между собой элементов, обеспечивающих выполнение системой некоторой достаточно сложгюй функции Исходя из вышеприведенного определения, даже самое общее представление о предприятиях химической и нефтехимической промышленности позволяет делать заключение об отнесении их к классу сложных систем производственно-хозяйственного характера. Это является следствием большой сложности структурных, организационных, технико-технологических, экономических, правовых элементов предприятия. [c.380]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология