Обращенные повторы

Рис. 27-28. А. Палиндром, или обращенный повтор. Видно, что он обладает осевой симметрией. Ось симметрии второго порядка проходит через центральную точку. Б. Крестообразная структура, возникающая в том случае, если основания палиндрома образуют пары не между цепями, а внутри каждой из цепей. В нативной эукариотической ДНК палиндромы могут содержать десятки и даже сотни оснований.

Рис. 35. Фрагмент цепи ДНК с обращенным повтором

Слово палиндром используется в биохимической генетике для обозначения участков эукариотической ДНК, в которых обнаруживаются обращенные повторы нуклеотидных последовательностей с осевой симметрией второго порядка, напоминающие короткие последовательности, узнаваемые рестриктирующи-ми эндонуклеазами. Пример такого участка приведен на рис. 27-28. [c.883]

Обращенные повторы мгновенно ренатурируют [c.299]

Можно выделить два типа палиндромов, как показано на рис. 24.1. Когда обращенные повторы непрерывны, при их реассоциации образуется структура типа шпильки. Когда они разделены какой-либо другой последователь- [c.299]

По-видимому, обращенные повторы рассеяны по всему геному. К их числу относятся последовательности всех классов, как неповторяющиеся, так и повторяющиеся. Об их функции известно немногое. [c.300]

Они присутствуют в больщих транскрипционных единицах, кодирующих синтез ядерной РНК, и в этом случае в основном и обусловливают наличие у нее характерной вторичной структуры. Многие обращенные повторы, обнаруживаемые в ядерной РНК человека, являются членами А1и-семейства, описанного в предыдущем разделе. Действительно, если рассматривать А1и-семейство в целом, то около трети его членов-это расположенные непосредственно по соседству друг с другом обращенные повторы. Остальные представляют собой либо отдельные копии либо группу обращенных повторов, расположенных более отдаленно друг от друга. Всего к А1и-семейству относится половина или более обращенных повторов генома человека. [c.300]

Так как данный фрагмент имеет обращенные повторы, то, очевидно, при суперспирали-задии образуется структура типа <крест> (рис. 133), в которой 11-аденин и 10и 12 гуанины не участвуют в образовании водородных связей. [c.440]

Члены А1и-семейства могут входить в состав транскрипционных единиц структурных генов, что следует из их присутствия в гигантской ядерной РНК. Наличие множества копий А1и-последовательности в одной молекуле ядерной РНК может способствовать образованию вторичной структуры. Более того, присутствие членов А1и-се-мейства в виде обращенных повторов, описанное в следующем разделе, в основном и обусловливает вторичную структуру ядерной РНК, обнаруженную у млекопитающих (гл. 27). [c.299]

Реассоциацию фракции, ренатурирующей в нулевой момент времени, называют мономолекулярной реакцией, так как в реакции участвует только одна молекула ДНК. Это означает, что два реассоциирующих компонента должны располагаться в одной цепи ДНК. Поэтому такая реакция является внутримолекулярной реассоциацией последовательностей, противоположно ориентированных и расположенных близко друг к другу. Эти последовательности-обращенные повторы или палиндромы, уже рассмотренные нами в гл. 13. Такую фракцию иногда называют схлопнувшейся ДНК. [c.299]

Рис. 24.1. При денатурации и ренатурации из расположенных рядом обращенных повторов образуются щпильки, а из обра-

Одна из сложностей при определении истинного размера гяРНК связана с ее склонностью к образованию агрегатов. В гяРНК имеются участки со вторичной структурой, большая часть которых образуется в результате реакций между обращенными повторами А1и-се-мейства или эквивалентного семейства (гл. 24). Кроме того, имеют место и л ежмолекулярные взаимодействия, которые, по-видимому, и приводят к образованию очень быстро седиментирующего материала. [c.332]

САМОКОМПЛЕМЕНТАРНАЯ ДНК. Состоит из обращенных повторов, которые ренатурируют за счет реассоциации комплементарных последовательностей, расположенных на одной цепи в денатурированной ДНК. [c.526]

Рис. 31.16. Перенос гена (показано крас-н ым цветом), Гр ан ичаще го с обеих сторон с 18-элементами (желтый цвет). При транспози-цииреципиентныйучасток(си-ний цвет) удваивается. Один конец транспозона представляет собой обращенный повтор другого конца.

Что лежит в основе высокой подвижности транспозонов Электронно-микроскопические исследования и определение последовательности нуклеотидов в ДПК показали, что последовательность, расположенная на одном конце транспозона, повторяется на другом конце. Папример, концы ТпЗ-транс-позона, кодирующего устойчивость к ампициллину,- представляют собой обращенные повторы длиной 38 пар оснований. Последовательности нуклеотидов в ДПК реце-ниенте, граничащие с обеих сторон с транс-позоном, являются прямым повтором последовательности 5-9 пар оснований, присутствовавшей до вставки транспозона (рис. 31.16). Между этими обрамляющими [c.206]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология