Короткие последовательности

Один из недостатков оценки риска, основывающейся на методологии анализа дерева неполадок, заключается в отсутствии количественных оценок относительной важности включаемых в рассмотрение событий. Одним из возможных способов преодоления этого ограничения служит рассмотрение лишь коротких последовательностей событий для огромного количества основных событий например, в случае оценки риска парового котла анализ может быть ограничен лишь деревом отказов для основного события "полное разрушение котла" (катастрофическая неисправность). Такой подход будет оправдан в том случае, если прежде всего интересуются риском для населения. [c.475]

Укажите реагент ила короткую последовательность реакций для проведения следующих превращений [c.398]

Была также высказана гипотеза о механизме сорбции макромолекул гемицеллюлоз на поверхности целлюлозных волокон [31, 80], которая заключается в следующем. При соприкосновении волокон целлюлозы с раствором гемицеллюлоз начинается адсорбция с относительно большой скоростью. При этом наблюдается отложение гемицеллюлозных цепей на открытой поверхности целлюлозы, так что гибкие макромолекулы адсорбируются на этой поверхности через сегменты или короткие последовательности цепей. Адсорбированные сегменты связаны друг с другом через неадсорбированные участки, образуя мостики или петли, простирающиеся в раствор Сегменты у концов цепей могут быть не адсорбированы и простираться в раствор. Характер адсорбционных сил в данном случае, по-видимому, определяется образованием водородных связей между доступными гидроксилами. [c.393]

В первичной структуре а-, /3- и 7-цепей находят многочисленные гомологичны области. /3-, 7-, а также 6 -цепь построены каждая из 146 аминокислотных остатков а-цепь на 5 остатков короче. Для анализа степени гомологичности различных полипептидных цепей необходимо рассматривать более короткие последовательности. Различие между а- и /3-цепями гемоглобина незначительно, в то время как между этими цепями и цепью миоглобина оно намного существеннее (рис. 3-40). [c.416]

Опыты с искусственными генными конструкциями, составленными из отрезков ДНК разного происхождения, выявили существование особого цис-действующего элемента регуляции генов эукариот, получившего название усилителя (энхансера) или активатора транскрипции. Энхансеры представлены короткими последовательностями ДНК, состоящими из отдельных элементов (модулей), включающих десятки нуклеотидных пар. Модули могут представлять собой повторяющиеся единицы. Энхансер увеличивает эффективность транскрипции гена в десятки и сотни раз. Впервые энхансеры были обнаружены в составе геномов животных ДНК-содержащих вирусов ( У40 и полиомы), где они обеспечивают активную транскрипцию вирусных генов. Извлеченные из вирусных геномов и включенные в состав искусственных генетических конструкций, они резко усиливали экспрессию ряда клеточных генов. Позднее были обнаружены собственные энхансеры генов эукариотической клетки. Особенность энхансеров состоит в том, что они способны действовать на больших расстояниях (более чем 1000 п. н.) и вне зависимости от ориентации по отношению к направлению транскрипции гена. Оказалось, что энхансеры могут располагаться как на 5 -, так и на З -конце фрагмента ДНК, включающего ген, а также в составе интронов (рис. 112, а). Например, энхансеры были выявлены в районе 400 п. н. перед стартом транскрипции генов инсулина и химо-трипсина крысы. В случае гена алкогольдегидрогеназы дрозофилы энхансер был локализован за 2000 п. н. перед промотором. Энхансеры обнаружены на 3 -фланге гена, кодирующего полипептидный гормон-плацентарный лактоген человека, а также в составе интронов генов иммуноглобулинов и коллагена. [c.203]

До развития методов последовательной дегидратации пептидов и белков, ДНФ-метка Л -конца с последующим частичным гидролизом широко использовалась. Зоны, отвечающие пептидам, содержащим концевой ДНФ-остаток, можно выделить, разделить и анализировать аминокислоты после полного кислотного гидролиза. Таким путем можно устанавливать короткие последовательности. [c.266]

В случае сильных ускорений марковские приближения едва ли применимы для расчета распределения звеньев, так как они позволяют точно рассчитывать лишь вероятности коротких последовательностей. Следует иметь в виду, что само обращение к приближенным методам расчета было предпринято из-за значительного усложнения схемы точного решения по мере увеличения длины рассматриваемой последовательности звеньев. [c.93]

Короткие последовательности аминокислот известны под названием пептидов или полипептидов. Граница между белками и полипептидами четко не определена. Полное установление последовательности аминокислотных остатков в белках и более сложных из полипептидов считалось вне возможностей классических методов деструкции. [c.591]

Размеры генов можно приблизительно оценить и более прямым способом. Сегодня уже известно, что каждая аминокислота полипептидной цепи кодируется короткой последовательностью, состоящей из трех расположенных друг за другом нуклеотидов в одной из цепей прокариотической ДНК (рис. 27-27). Поскольку в генетическом коде нет запятых , кодирующие триплеты ДНК расположены последовательно в соответствии с последовательностью аминокислот в кодируемом полипептиде. На рис. 27-27 показан принцип, определяющий структурное соотнощение на основе кода между ДНК, РНК и белком. В связи с тем что одна полипептидная цепь может содержать от 50 до 2000 (и даже больше) аминокислотных остатков (разд. 6.5), ген, кодирующий такую полипептидную цепь, должен состоять со- [c.879]

Слово палиндром используется в биохимической генетике для обозначения участков эукариотической ДНК, в которых обнаруживаются обращенные повторы нуклеотидных последовательностей с осевой симметрией второго порядка, напоминающие короткие последовательности, узнаваемые рестриктирующи-ми эндонуклеазами. Пример такого участка приведен на рис. 27-28. [c.883]

Тип III. К этому типу относятся полосы, для которых также характерно расщепление па две компоненты с противоположной поляризацией (-L и ), однако величина расщепления Av не зависит от количества изомера и длины соответствующей последовательности. Положение пар полос для конфигураций С, А и И различно (см. табл. 4). Для образцов с высоким содержанием конфигураций С или И интенсивность J -компоненты (представление Ei) расщепленной пары пропорциональна квадрату содержания И или С изомера в образце, в то время как интенсивность -компонент (представление А) пропорциональна первой степени их количества. Атактический образец содержит короткие последовательности различной длины, причем некоторые из них имеют достаточную длину для того, чтобы образовать спираль, а некоторые нет. Последовательности, которые не образуют-спирали, вносят вклад только в -компоненты расщепленных пар, и поэтому соотношение между интенсивностями компонент II и -L может быть любым. [c.275]

А и В—мономерные звенья, например, стирола и малеинового ангидрида [1, 2]. В более общем случае структура менее упорядочена и состоит из коротких последовательностей звеньев одной природы, более или менее беспорядочно перемежающихся с короткими последовательностями звеньев [c.304]

В этом случае свертку можно вычислить путем многократного применения только что описанного способа использования избыточного алгоритма ДПФ для вычисления свертки последовательностей равной длины, причем порядок дискретного преобразования определяется более короткой последовательностью. [c.225]

При блочном строении цепи, т. е. наличии в ней длинных последовательностей из 1- 3- и 1- 4-связанных остатков., первые Должны приводить к образованию полимерного неокисленного фрагмента, а вторые — полностью распадаться до свободного эритрита и гликолевого альдегида. Наконец, при хаотическом распределении остатков продуктом деградации должна быть смесь низкомолекулярных гликозил-эритритов, образующихся из коротких последовательностей 1-5>3-связанных остатков, гликолевого альдегида, а также свободного зритрита, возникающего [c.92]

С помощью методов радиоавтографии [6, 17] или иммуно-цитохимии [26, 27, 11, 67] удалось определить места на шероховатой эндоплазматической сети (ШЭС), где происходит синтез запасных белков семян. Белки, синтезированные на полирибосомах, связанных с ШЕС, сразу проходят через мембрану сети благодаря наличию на N-конце полипептидов с гидрофобными свойствами короткой последовательности, называемой сигнальной [15, 45]. Существование такой последовательности в настоящее время установлено у бобовых и злаковых [18, 23, 32]. При появлении (в просвете эндоплазматической сети) этой последовательности она отделяется от новосинтезированной цепи специфической пептидазой. В процессе прохождения через мембраны шероховатой эндоплазматической сети некоторые белки могут также становиться гликоксилированными [62, 5, 65]. Таким образом, механизм анаболизма запасных белков очень сходен с механизмами, описанными для секреторных клеток животных [70] и растений [46]. [c.135]

В некоторых белках встречаются многократные повторения коротких последовательностей. Повторения коротких последовательностей обнаружены в так называемых периодических белках (145, 593], к которым относятся коллаген, кератин шерсти, гистоны, тропомиозин, липопротеин А1 человека и понижающий точку замерзания гликопротеин антарктической рыбы. Для последнего белка повторяющимся звеном во всей последовательности является А1а-ТЬг-ТЬг. В некоторых случаях периодичность может отражать специфические особенности соответствующей ДНК [593] в других случаях структурные особенности (образование тройной спирали коллагена, показанной на рис. 5.6, характерное присоединение тро-помиозина к нитевидному актину и гистона к двойной спирали ДНК) могли возникнуть под воздействием отбора. [c.232]

Короткие последовательности с Л/-конца белков часто идентифицируют, используя ферментативную деградацию. Промышленность производит несколько аминопептидаз, отличающихся специфичностью. Лейцинаминопептидаза из почек свиньи, как следует из ее названия, гидролизует преимущественно лейцин и сходные аминокислоты с гидрофобными боковыми группами. Несмотря на то, что скорости расщепления, Л/-концевых аминокислот лежат в широких пределах, гидролиз желательно продолжать до конца, за исключением аминокислоты, предшествующей пролину. Вследствие столь широкого изменения скоростей расщепления следует соблюдать осторожность при интерпретации результатов анализа деградации, катализируемой этим ферментом. Чрезвычайно важно отбирать пробы для анализа в течение деградации. Например, при анализе белка с Л/-концевой последовательностью А1а-Ьеи-Ьеи. .. на ранних стадиях деградации выход аланина превышает выход лизина, однако при большом времени гидролиза соотношение меняется на обратное [24]. Другой фермент, выделенный из почек свиньи, ами-нопептидаза М, гораздо менее специфичен и, по-видимому, более пригоден для расщепления белков. [c.271]

Получение гибридных плазмид, содержащих любые фрагменты ДНК, основывается на применении рест-jDUKraa — ферментов, узнающих короткие последовательности ДНК и разрезающих молекулы ДНК в соответствующих местах. Гибридные плазмиды клонируют — размножают — вместе с бактериями, в которые они введены. [c.268]

Установлены явления совместной регуляции целых совокупностей генов, что имеет определяющее значение для морфогенеза в ходе индивидуального развития (см. 17.9). Строение зародыша задается короткой последовательностью нуклеотидов в ДНК, именуемой гомеобоксом. Гомеобокс ответствен за сегментацию тела членистоногих (Drosophila). Это доказывается изучением гомеогических мутаций, приводящих к макроскопическим [c.298]

Механизмы трансформации оптического изображения на сетчатке в нейральное изображение, сообщаемое мозгу, весьма сложны. В сетчатке происходит адаптация к различиям в интенсив-юности и в спектральном составе света, восприятие объемного изображения и движения видимого объекта. Были проведены ис-<жедования импульсов, возникающих в оптических нервах краба и позвоночных. Глаз краба содержит множество рецепторов, именуемых омматидиями, похожих на палочки. Удалось изучить импульсы, создаваемые отдельными омматидиями в соответствующих отдельных аксонах. В темноте распространяются редкие. периодические импульсы. При освещении с пороговой интенсивностью возникают дополнительные импульсы. Если интенсивность сильно превышает пороговую, то в момент освещения возникает короткая последовательность частых импульсов. Затем частота уменьшается, но остается существенно большей, чем темновая. При выключении света появляется новая пачка частых импульсов, их частота постепенно уменьшается до темновой. У позвоночных аксоны сильнее реагируют на изменения освещенности, чем на непрерывное освещение. Наблюдается подавление импульсов при сильном освещении. Функцией сетчатки является сложное, интегрирующее нервное взаимодействие, име-юшее характер вычислительной работы. В этом смысле сетчатка подобна ЭВМ. [c.466]

Основная проблема полного синтеза перипланона В (504), полового аттрактанта таракана, — построение функционализированного 10-членного кольца. Как уже отмечалось ранее, синтез циклов подобного размера не является тривиальной задачей. Эта проблема была эффективно рещена с помощью гидрокси-перегруппировки Коупа. В разработанном группой Стилла синтезе 504 [40к] непосредственным предшественником для перехода к десятичленной системе служил карбинол 505, получение которого из циклогексенона 506 было осуществлено с помощью короткой последовательности несложных превращений (схема 2.158). [c.275]

Одна из гипотез о механизме сорбции макромолекул ГМЦ на поверхности волокон целлюлозы [315, 481, 482, 680, 770] предполагает, что при соприкосновении с раствором ГМЦ начинается быстрая адсорбция цепей ГМЦ на открытой поверхности целлю-люзы, причем гибкие макромолекулы адсорбируются через сегменты или короткие последовательности цепей. Между адсорбированными сегментами существуют неадсорбированные участки, образующие мостики, или петли, простирающиеся в раствор. В раствор могут простираться и неадсорбированные сегменты у концов цепей. Предполагается, что характер адсорбционных сил определяется образованием водородных свзей между доступными гидроксилами. После заполнения в основном свободной поверхности целлюлозы сорбированными цепями ГМЦ начинается более медленная стадия сорбции макромолекул ГМЦ на уже сорбированные ГМЦ. [c.397]

Генная инженерия возникла как результат всего развития науки о ДНК. Но событием, позволившим непосредственно приступить к перетасовке генов, было открытие ( зерментов рестриктаз. Рестриктазы узнают определенные, короткие последовательности нуклеотидов и разрезают молекулу ДНК в этом месте. Такие последовательности могут случайно встретиться в любой ДНК- Поэтому если подействовать какой-то рестриктазой на ДНК, скажем, мухи, а одновременно ею же на ДНК слона, то произойдет случайная перетасовка генов мухи и слона. Чтобы получились длинные гибридные, химерные или, как их еш,е называют, рекомбинантные молекулы, нужно лишь добавить фермент лигазу, сшиваюш,ий фрагменты ДНК друг с другом. Так в пробирке можно создать какие угодно комбинации генов, причем все они заведомо никогда не реализовались в живой природе из-за запрета на межвидовое скрещивание. [c.59]

ЭТОМ чужеродная ДНК, не имеющая этих опознавательных метильных групп, разрущается рестриктирующими эндонуклеазами. В эукариотических ДНК присутствует большое число высокоповторяющихся коротких последовательностей, меньшее число более длинных умеренных повторов, которые, как полагают, играют регуляторную роль, и ряд уникальных (неповторяющихся) участков, представляющих собой, видимо, структурные гены. Эукариотические гены содержат вставочные нетрансли-руёмые нуклеотидные последовательности, называемые интронами, которые вставлены между транслируемыми участками, называемыми экзонами. С помощью недавно разработанных методов были определены нуклеотидные последовательности ряда генов и вирусных ДНК. [c.891]

ПИ. Структура холофермента этой полимеразы обозначается так ajpp a. Первый этап транскрипции-это присоединение холофермента к особому участку ДНК, называемому промотором, который представляет собой короткую последовательность, узнаваемую РНК-полимеразой. Разные промоторы несколько отличаются друг от друга по последовательности, что и определяет, вероятно, эффективность транскрипции разных генов. Как только РНК-полиме-раза заняла правильное положение в про-моторном участке и образовала несколько фосфодиэфирных связей, субъединица и отделяется от холофермента. Оставшийся кор-фермент (от англ. ore - сердцевина) продолжает шаг за шагом удлинять молекулу РНК. Об окончании транскрибируемого гена (или генов) сигнализирует особая терминирующая последовательность в матрице ДНК. Для прекращения транскрипции и отделения РНК-полимеразы от ДНК необходим еще один специфический белок, обозначаемый р. Таким образом, синтез РНК включает три этана инициацию, элонгацию и терминацию (рис. 28-17). [c.913]

При статистической сополимеризации различные мономеры находятся в контакте с инициатором или с растущей цепью и статистически чередуются в коротких последовательностях, образуя макромолекулы структуры ААВВВАВАААВАВВ. Обычно используются инициаторы, действие которых на все взятые мономеры приблизительно одинаково. Соотношение, в котором мономеры входят в полимер, часто отличается от соответствующего соотношения в исходной мономерной смеси, так как мономеры различаются реакционной способностью и полярностью двойной связи. [c.129]

По спектру ЯМР сополимера пропилена со стиролом сделан вывод о том, что в цепи имеются лишь короткие последовательности звеньев стирола. Оказалось, что фенильные протоны дают лишь один пик, а из работы Бови с сотрудниками известно, что полистирол дает два фенильных пика при степени полимеризации больше десяти (см. стр. 258). [c.195]

Структура сополимеров с короткими последовательностями мономерных звеньев была подробно рассмотрена Алфреем, Борером и Марком [1] и здесь обсуждаться не будет. По физическим свойствам такие сополимеры занимают промежуточное положение между гомополимерами, синтезированными из мономеров, входящих в состав сополимера при исследовании с такими сополимерами можно обращаться так же, как и с гомополимерами. [c.305]

Оценка длины боковых ответвлений может даваться по измерению дихроизма поглощения, связанного с группами СНд (в боковых цепях, содержащих меньше чем четыре атома углерода, ось СНз-группы ориентирована почти перпендикулярно главной цепи, а в более длинных ответвлениях она может располагаться параллельно главной цепи), или по интенсивности высокочастотной полосы дуплета 720—735 сж" (см. работу ), т. е. по маятниковым колебаниям группы СНг в коротких последовательностях групп СНг- Обычно полосу при 770 см- относят к этильной, а при 745 сж — к бутильной группе, образующей боковую цепь. [c.326]

Повторяющиеся последовательности и сателлитная ДНК — одна из закономерностей в чередовании нуклеотидов у большинства ДНК эукариотических клеток. Эти ДНК состоят из уникальных и частично повторяющихся последовательностей. Например, в ДНК мыши повторяющиеся последовательности составляют десятую долю всего генома и представлены приблизительно одним миллионом копий последовательности, содержащей около 30 пар нуклеотидов с более низким (Г + Ц)-содержанием по сравнению с остальной массой ДНК. Имея другую плавучую плотность, ДНК с повторяющимися последовательностями при центрифугировании в градиенте плотности s l образует отчетливую сателлитную полосу. Каждая из двух цепей этой ДНК настолько отличается по составу оснований, что они хорошо разделяются в растворе s I. Такие наблюдения основаны на исследованиях реассоциации двух цепей сателлитной ДНК, расчлененных ранее путем термической обработки. Реассоциация сателлитной ДНК осуществляется настолько быстро, что, по-видимому, в ней существует короткая последовательность, повторяющаяся много раз. [c.66]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология