Повторы длинные

ДНК фага Т7 — линейная двухнитевая молекула ( 40 т. п. н.) с прямым концевым повтором длиной 160 нуклеотидов. Инициация раунда репликации происходит внутри молекулы — на расстоянии, примерно соответствующем 15 % длины генома от одного из концов, условно называемого левым. Здесь имеются промоторы, которые узнаются фагоспецифической ДНК-зависимой РНК-полимеразой. Без транскрипции этого оп-района раунд репликации не начинается. Скорее всего РНК, образующаяся при транскрипции с этих промоторов, непосредственно используется в качестве за- [c.277]

Тогда, по формуле T=k/2Lv можно оценить время т, прошедшее с момента внедрения ПП в геном до момента его экспериментального исследования, где к -количество нуклеотидных замен в двух фланкирующих повторах длины L, окружающих ПП. [c.67]

Переход Т-ДНК в одноцепочечную форму начинается с внесения в нее разрывов по обеим фланкирующим ее последовательностям. При этом правая фланкирующая последовательность оказывается на 5 "-конце одноцепочечной Т-ДНК, а левая - на 3 -конце. Предполагается, что интеграция Т-ДНК в геном растения зависит от специфических последовательностей, локализованных в правой фланкирующей последовательности, которая содержит повтор длиной 25 п. н. Аналогичный повтор присутствует и в левой последовательности, однако, как показывает делеционный мутагенез, она не принимает участия в интеграции. [c.376]

Возвратнопоступательное действие поршня, поднимающего корпус бомбы, создается внутренним клапаном, закрывающим выход воздуха до тех пор, пока поршень не достигнет верхней точки своего хода. В этой точке воздух выпускается, поршень падает под действием силы тяжести с резким толчком, и цикл повторяется. Длину хода поршня можно изменять, перемещая выхлопное отверстие ниже или выше, а частоту хода можно регулировать между 30 и 180 толчками в минуту, прикрывая клапан на линии подачи воздуха. Уплотнение между поршнем и стенками цилиндра поддерживается поршневыми кольцами. Верх поршня снабжен столом, к которому прикреплен корпус. [c.262]

Для большинства транспозонов последовательность прямого повтора в каждом отдельном событии транспозиции отличается, но длина ее остается постоянной (что связано с механизмом транспозиции). Наиболее часто встречаются прямые повторы длиной 5 и 9 пар оснований. [c.460]

Транспозоны ТпА обычно на концах имеют близко-родственные инвертированные повторы длиной около 38 пар оснований. Дис-активные делеции в любом из них предотвращают транспозицию элемента. В сайте-мишени образуются прямые повторы из 5 пар оснований, выбираемых случайно, хотя и с региональной предпочтительностью. [c.467]

Плунжерный пресс является оборудованием периодического действия в цилиндр загружают порцию материала, и за счет движения плунжера материал наносят на движущуюся токопроводящую жилу. В крайнем положении плунжер автоматически останавливается, и цикл работы повторяется. Длина кабеля или провода, получаемого из одной загрузки материала, зависит от вместимости цилиндра пресса и может быть вычислена [c.128]

Параметры фильтрации точка ставится на матрице, если совпадают 6 нуклеотидов из 7. 1,3 10 - ожидаемая плотность точек на матрице. Хорошо виден повтор длиной 72 пары нуклеотидов, а также серия более мелких повторов вблизи начала последовательности [c.241]

Если поверхность твердого тела приобрела заряд определенного знака (например, в результате адсорбции ионов), то ионы, несущие заряд противоположного знака, притягиваются к заряженной поверхности. При этом образуется двойной электрический слой (см. главу X). Между твердой зарялсенной поверхностью, с одной стороны, и жидкостью, с другой стороны, возникает разность потенциалов — скачок потенциала. Величина общего скачка потенциала определяется плотностью заряда, которая зависит от адсорбции ионов твердой поверхностью (или от собственной ионизации поверхности). Для того чтобы каждый раз не повторять длинную фразу ионы, несущие заряд, противоположный заряду твердой поверхности , вводится термин противоионы . [c.410]

Как будет видно из дальнейшего, особое значение для механизмов репликации линейных молекул ДНК имеет структура их Концевых участков. У линейных ДНК-геномов не бывает невыразительных концов. Соответствующие участки (рис. 134) могут иметь прямые концевые повторы длиной от сотни и более (например, ДНК фага Т7) до тысяч (Т-четные фаги и др.) пар нуклеотидов. При этом если у фага Т7 все геномные молекулы ДНК идентичны, то молекулы ДНК Т-четных фагов существенно различны, даже Когда они образованы в одной клетке, зараженной единственной фаговой частицей геномы Т-четных фагов (и ряда других вирусов) характеризуются так называемыми кольцевыми перестановками. Еще один вариант концевой структуры вирионных ДНК-ДУПлек-сов — липкие (т. е. взаимно комплементарные) однонитевые концы. Длина которых обычно находится между 10 и 20 нуклеотидами (фаги Р2, Р4), но может укорачиваться до одного нуклеотида (герпес-вирусы), если в этом случае вообще позволительно называть такие Концы липкими . [c.261]

Заштрихованы повторы длиной 1 1 и 72 п, н. римскцм1г цифрами обозначены участки связывания Т-аитигеиа указано положение участка начала репликации [ori) и одного из регуляторных сигналов транскрипции (Т. ТА) показаны также начальные участки транскриптов ранних генов на ранней ia) и поздней б) стадиях инфекцн п начальные участки транскриптов поздних геиов (в) стрелки указывают направление транскрипции [c.300]

Второй эффект Т-антигена заключается в том, что он запускает репликацию вирусного генома и тем самым резко увеличивает число матриц ( дозу гена ), с которых происходит считывание мРНК. Возможно, что увеличение числа молекул вирусной ДНК в клетке — одна из важных причин стимуляции транскрипции поздних генов. Дело в том, что на ранней стадии считывание этих генов угнетено в результате присоединения особого клеточного белка к повтору длиной 21 п. н. Количество этого белка-ингибитора в клетке весьма ограничено. Поэтому после начала репликации вирусного генома этот белок оказывается в дефиците и значительная доля молекул вирусной ДНК остается свободной от ингибитора. [c.301]

В ДНК некоторых вирусов имеются инвертированные концевые повторы, длиной от нескольких нуклеотидов (фаг ср29) до 100—150 нуклеотидов (аденовирусы) и больше в обоих указанных случаях [c.261]

Отсутствие патогенности делает ААВ весьма перспективным вектором для доставки в организм человека терапевтических генов. Рекомбинантный ААВ получают с помощью котрансфекции клетки-хозяина, инфицированной каким-нибудь аденовирусом (вирусом-помощником), двумя плазмидами (рис. 21.8). Одна из них несет терапевтический ген, фланкированный инвертированными концевыми повторами (длиной от 125 п. н.) ААВ, а вторая - два его гена, гер и ap, ответственные за репликацию генома и синтез капсида соответственно. После [c.496]

Искусственная хромосома содержит три основных элемента концевые участки (теломеры), центромеру и точки инициации репликации. Свойства теломерных областей хромосом человека хорошо изучены, чего нельзя сказать о центромерах и точках инициации репликации, и существовали опасения, что искусственную хромосому человека не удастся сконструировать, пока не будут досконально изучены все ее элементы. Однако уже получены и поддерживаются в трансфицированной культуре клеток стабильные линейные искусственные хромосомы человека (микрохромосомы), состоящие из множества ДНК-повторов (длиной около 1 м. п. н.) центромерной области Y-хромосомы, высокомолекулярных фрагментов геномной ДНК и теломерных участков. В их центромерную область был встроен ген устойчивости к неомицину, что позволило использовать среду G418 в качестве селективной. В нескольких G418-устойчивых клетках были обнаружены микрохромосомы длиной от 6 до 10 м. п. н. [c.501]

Экспрессия этой транскрипционной единицы зависит от ориентации сегмента ДНК, сцепленного с ней. Сегмент имеет протяженность, равную 995 п. н., и ограничен повторами длиной 14 п.н. (IRE и IRR). Инициирующий кодон гена Н2 лежит на расстоянии 16 п.н. вправо от прилегающего инвертированного повтора. Сегмент ДНК между IRE и IRR содержит ген hin, продукт которого представляет собой тракс-действующий белок, способствующий инверсии всего сегмента путем реципрокной рекомбинации между инвертированными повторами (рис. 36.9). Мутации в hin-гене уменьшают частоту инверсии в 10" раз. [c.470]

Большая часть быстро гибридизуюшихся цепей ДНК обычно состоит из очень длинных тандемных повторов одной короткой последовательности нуклеотидов (рис. 10-69). Повторяющаяся единица в подобной последовательности может быть представлена даже одним или двумя нуклеотидами, однако большинство повторов длиннее у млекопитающих они обычно составлены из вариантов одной короткой последовательности, организованной в повтор размером в несколько сот нуклеотидов. Такие тандемные повторы простой последовательности называются сателлитной ДНК, поскольку первая обнаруженная ДНК такого типа имела необычный нуклеотидный состав, что давало возможность отделить ее от тотальной клеточной ДНК в виде минорного компонента (или сателлита ). Обычно последовательности сателлитной ДНК не транскрибируются и чаще всего локализованы в гетерохроматине центромерных областей хромосом (см. разд. 10.3.8). У некоторых млекопитающих на долю сателлитной ДНК приходится 10% и более от всей [c.242]

Умеренно повторяющиеся последовательности, присутствующие в количестве менее чем 10 копий на гаплоидный геном, не образуют кластеров, а чередуются с неповторяющимися (уникальными) последовательностями. Они могут быть как короткими, так и весьма протяженными. Длинные диспергированные повторы состоят из 5000—7000 пар оснований и представлены в количестве 1000—100000 копий на гаплоидный геном. Они фланкированы с обоих концов прямыми повторами длиной в 300— 600 пар оснований (рис. 38.8). Во многих случаях длинные повторы транскрибируются РНК-полимеразой II в виде молекул мРНК, содержащих такие же кэпированные 5 -концы, как и мРНК. [c.70]

Is-последовательности несут на концах полные или почти полные инвертированные повторы длиной в 20-40 п.н. большинство Тп-элементов оканчивается длинными (800-1 500 п.н.) Is-подобными последовательностями. Когда элементы встраиваются в хозяйский геном, они фланкируются короткими повторами (4-12 п.н.) ДНК хозяина (рис. 2.94). [c.141]

Рис. 2.94. Пример одного транспозона (Тп 5) Е. oli. На концах транспозона имеются инвертированные повторы длиной в 500 п.н. Они практически идентичны. Единственное различие состоит в том, что левый повтор имеет пару А Т в том месте, где правый повтор имеет пару G- . Именно отсюда начинается транскрипция гена

Области Т-ДНК как у А. tumefa iens, так и у Л. rhizogenes фланкированы прямыми повторами длиной 25 пар нуклеотидов (п. н.) (см. рис. 1.1), и концы Т-ДНК, интегрированной в растительный геном, обнаруживаются вблизи этих последовательностей. Обобщенную последовательность границы Т-ДНК можно представить следующим образом [c.15]

Потеря онкогенных свойств означает, что в этом случае трансформированные ткани невозможно идентифицировать как неопластические выросты, клетки которых легко селектировать по их способности к росту на среде, не содержащей фитогормонов. Для разрешения проблемы идентификации трансформированных клеток между повторами длиной 25 п. н. встраивают бактериальные гены устойчивости к антибиотикам, помещенные под контроль промоторов Т-ДНК и снабженные сигналами полиадени-лирования. Такие химерные гены устойчивости к антибиотикам эффективно экспрессируются в растительных клетках как доминантные признаки в любом генетическом окружении. Удобно, чтобы маркерные гены были тесно сцеплены с чужеродной ДНК по двум причинам. Во-первых, это позволяет осуществлять прямую селекцию трансформированной ткани растения, чтобы убедиться в переносе чужеродной ДНК. И во-вторых, это гарантирует, что фланкирующая чужеродная ДНК в конкретном трансформированном клоне, полученном в результате селекции, не была встроена в нетранскрибируемую область генома. [c.18]

Vir-reHbi, повторы длиной 25 п. и. и круг растений-хозяев [c.31]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология