Нуклеотиды внутримолекулярные водородные

Возможность образования такой водородной связи может быть легко продемонстрирована на молекулярных моделях нуклеозидов с анга-конформацией. Впервые предположение о таком взаимодействии было выдвинуто для объяснения различия УФ-спектров в сильнощелочной среде уридина и уридин-З -фосфата, с одной стороны, и уридин-2 -фосфата, с другой стороны Прямых доказательств образования такого рода водородной связи до сих пор не получено. Расстояние между атомами кислорода 2-экзо-О и 2 -экзо-0 в кристаллах пиримидиновых рибонуклеозидов и рибонуклеотидов , полученное на основании данных рентгенографии, превышает расстояние, требуемое для образования водородной связи. Однако это не удивительно, так как в кристаллической решетке и тот и другой атомы кислорода находятся в непосредственной близости с функциональными группами соседних молекул нуклеотида такие межмолекулярные взаимодействия могут преобладать в данном случае над внутримолекулярными взаимодействиями, существующими в разбавленных растворах. [c.141]

Пример 11-Б. Обнаружение денатурации ДНК с помощью ультрацентрифугирования. Жесткость молекулы ДНК обусловлена в первую очередь ее двухцепочечной спиральной структурой, в которой основания нуклеотидов расположены одно над другим (гл. 16), причем основания противоположных цепей связаны между собой водородными связями. При повышении температуры раствора ДНК водородные связи разрываются, в результате чего нарушается тенденция к регулярному расположению оснований. При потере жесткости из-за разрывов водородных связей между основаниями и нарушении их регулярной упаковки молекула ДНК приобретает способность изгибаться. В результате этого уменьшается вытянутость молекулы, что приводит к увеличению 8. Чем больше происходит внутримолекулярных разрывов, тем более гибкой становится молекула, менее жесткой и менее вытянутой, что приводит к увеличению 5. Этот процесс продолжается до тех пор, пока не разорвется последняя водородная связь. В этой точке происходит разделение двух цепей ДНК, что приводит к образованию двух единиц, каждая из которых имеет молекулярную массу, равную половине молекулярной массы исходной структуры. Иллюстрацией такого явления служит рис. 11-17, на котором приведена зависимость х для ДНК с молекулярной массой 25 000 000 от температуры раствора ДНК. За период разрывов значение 5 возрастает на 220%, после чего резко [c.299]

Вторичная структура тРНК формируется за счет образования максимального числа водородных связей между внутримолекулярными комплементарными парами азотистых оснований. В результате образования этих связей полинуклеотидная цепь тРНК закручивается с образованием спирализованных ветвей, заканчивающихся петлями из неспаренных нуклеотидов. Пространственное изображение вторичных структур всех тРНК имеет форму клеверного листа (рис. 14.7). [c.186]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология