Комплементарные пары

Рис. 3.3. Модель двойной спирали ДНК. Поперечные перекладины — комплементарные пары оснований, боковины - сахарофосфатный остов.

Что такое комплементарные пары азотистых оснований [c.665]

Важнейший метод получения рекомбинантных ДНК основан на способности нуклеиновых кислот быстро восстанавливать свою структуру после нагревания до 100 °С в сильно щелочной среде (pH 13). При нагревании до 100 С комплементарные пары оснований разрушаются и ДНК диссоциирует на две раздельные цепи. Этот процесс назван денатурацией ДНК ( плавлением ). Выдерживание комплементарных цепей при температуре 65 °С приводит [c.109]

Потенциостат состоит из источника опорного напряжения на стабилитроне VD1, дифференциального усилителя на операционном усилителе DA1 и усилителя мощности на транзисторах VT2 и VT3. Рабочий ток стабилитрона задавался источником тока на полевом транзисторе VT2 и резисторе R3. С движков многооборотных потенциометров R1 и R5 типа СП5-1В задаваемая при проведении экспериментов величина потенциала через переключатель S1 поступала на неинвертирующий вход операционного усилителя DA1. На инвертирующий его вход подавался сигнал с электрода сравнения. Усилитель мощности собран на установленной на радиаторы комплементарной паре составных транзисторов VT2 и VT3. Для устранения самовозбуждения включен конденсатор С1. Потенциал контролировался с помощью цифровых вольтметров типа В7-27 и В7-28, [c.107]

Экспериментальные данные о химическом составе ДНК удалось интерпретировать лишь после того, как была теоретически обоснована ее структура. В 1953 г., воспользовавшись исключительно четкими дифракционными картинами ДНК, полученными М. X. Ф. Уилкинсом, американский биолог Дж. Д. Уотсон и английский биофизик Ф. X. К. Крик предположили, что молекулы ДНК состоят из двух цепей, закрученных относительно друг друга в виде спирали таким образом, что через каждые 330 пм вдоль оси такой двойной спирали расположены остаток аденина или гуанина и остаток тимина или цитозина. При этом такие остатки образуют комплементарные пары аденин-ти-мин и гуанин-цитозин (рис. 15.21). Спаривание оснований по принципу комплементарности пояснено на рис. 15.20, из которого видно, что между аденином и тимином могут образовываться две, а между цитозином и гуанином три водородные связи. [c.456]

При изучении стабильности спиральных структур оказалось, что носитель длиной в 8 нуклеотидов достаточен для правильного связывания с более длинной олигонуклеотидной матрицей благодаря образованию уотсон-криковских комплементарных пар (разд. 3.2.2). Использование современных химических методов образования пептидной связи позволяет удлинить полипептидную [c.66]

Таким образом, вторичная структура ДНК — это двойная спираль, образующаяся за счет водородных связей между комплементарными парами гетероциклических оснований. [c.663]

Здесь - константа скорости плавления рибосомой одной комплементарной пары, а. - состояние комплекса "рибосома- [c.159]

Возрастание стабильности при повышении температуры иногда используют в качестве показателя гидрофобной природы связывания. Следует, однако, отметить, что эта закономерность не характерна для стэкинг-взаимодействия между комплементарными парами оснований в полинуклеотидах, которые при высоких температурах становятся менее стабильными (гл. 2, разд. Г. 10). [c.249]

Информация, необходимая для построения определенной аминокислотной последовательности, содержится в дезоксирибонуклеиновой кислоте (ДНК). Молекула ДНК является полинуклеотидом, образованным основаниями аденином (А), гуанином (G), цитозином (С), тимином (Т), остатками фосфорной кислоты и 2-дезоксирибозой в качестве углеводного компонента. Все ДНК построены как регулярные двойные спирали, структура которых стабилизирована водородными связями между комплементарными парами оснований А — Т и О — С. В ДНК каждые три следующих один за другим нуклеотида (триплетный код) кодируют одну аминокислоту (189 — 192]. Для 20 протеиногенных аминокислот существуют 64 кодовые единицы (кодона), из которых по 6 приходится на аминокислоты Leu, [c.391]

Комплементарные основания в двойной спирали ДНК лежат в одной плоскости, причем эта плоскость практически перпендикулярна главной оси спирали. Соседние пары оснований в ДНК повернуты друг относительно друга на 36 [угол между прямыми, соединяющими СГ в соседних комплементарных парах (см. рис. 12)]. [c.22]

Как уже отмечалось, образование комплементарных пар оснований (А-Т- иО-С-пар) было впервые постулировано Дж. Уотсоном и Ф. Криком при создании модели двойной спирали ДНК- Строение этих пар показано на рис. 12. Обе пары близки по форме и имеют одинаковые размеры. Они связаны осью симметрии второго порядка, но при этом псевдосимметричны при повороте на 180 вокруг оси, лежащей в плоскости рисунка (с выходом оснований из его плоскости), совпадают только СГ-атомы. [c.24]

Иную природу имеют межплоскостные взаимодействия оснований. Гетероциклические основания нуклеиновых кислот достаточно гидрофобны, т. е. в водном растворе им выгоднее расположиться друг над другом и тем самым уменьшить контакт с молекулами воды. При образовании таких стопок во взаимодействие вступают функциональные (С=0 и С—ЫНг) группы одного основания и я-элект-ронные системы соседнего с ним по вертикали основания. Поэтому стэкинг-взаимодействия оснований (в двойной спирали ДНК, например) зависят как от состава комплементарных пар, так и от их последовательности (рис. 13). [c.26]

Переда(ча информации дочерним клеткам в процессе деления происходит по принципу комплементарности. Оказалось, что каждое из упомянутых азотистых оснований имеет свою комплементарную пару [c.43]

Однако образовать комплементарные пары могут не только нуклеотиды ДНК и РНК в отдельности, но и нуклеотиды ДНК с нуклеотидами РНК. Это свойство лежит в основе переноса генетической информации в процессе биосинтеза белка (транскрипция). Нуклеотиды ДНК образуют следующие пары с нуклеотидами РНК [c.44]

Очевидно, что в двойной спирали структура комплементарной пары оснований не может определяться исключительно ее свойствами в изолированном состоянии. Наряду с горизонтальными взаимодействиями в паре существуют и вертикальные взаимодействия соседних неспаренных оснований (см. далее). Стабилизуется структура, оптимальная для двойной спирали как целостной системы. Вместе с тем возможность образования водородных связей между различными атомами, по-видимому, существенна для мутагенеза (см. 9.9). [c.503]

Я был бы неправ, если бы оставил читателя с ощущением, что великие открытия могут быть сделаны как-то походя. И пример Уотсона при внимательном рассмотрении как раз опровергает такое представление. Просто за внешней бравадой автора Двойной спирали надо увидеть то, что было на самом деле. А была денная и нощная концентрация мысли на том, как же устроена ДНК. Был крайне важный контакт с химиком Джерри Донохью, в результате которого родилась идея комплементарных пар оснований аденин-тимин и гуанин - цитозин, краеугольный камень двойной спирали. Было и постоянное подогревание Фрэнсиса Крика в те минуты, когда тот уже не видел дальнейшего пути и терял интерес к проблеме. И была прежде всего уверенность в том, что ген — это ДНК, тогда как подавляющее большинство биологов думали, что ген — это белок. [c.132]

Водородные связи играют исключительную роль в биохимии. Они образуются при многочисленных фермент-суб-стратных взаимодействиях, иммунологических реакциях, обеспечивают и обусловливают снециф ику взаимодействия ойнований нуклеиновых кислот в двойной спирали ДНК, при переносе информации от ДНК к РНК и далее к белковым структурам. Уотсон и Крик показали, что единственно возможной структурой двойной спирали ДНК является такая, при которой пу ин одной цепи образует комплементарную пару с пиримидином другой цепи при помощи водородных связей [c.39]

ЛОТ определяется двумя типами взаимодействий между гетероциклическими основаниями нуклеотидных остатков 1) взаимодействиями между основаниями в комплементарных парах 2) межплоско-стными взаимодействиями оснований, расположенных друг над другом, или так называемыми стэкинг -взаи.модействиями (от англ. sta king — укладываться в стопку). [c.24]

НЫ обрааовывать множество связанных водородны.ми связями пар другой структуры. Некоторые из эти.ч пар обнаруживаются экс-пери.ментально для производных нуклеозидов и нуклеотидов, а так-в ко.мплексах ряда синтетических полинуклеотидов. Однако квантово-механические расчеты показывают, что уотсон-криковские А-Т-(в случае РНК —А-1]-) и О-С-пары энергетически наиболее вьггодны. Происходит это потому, что в этих парах центры с повышенной и пониженной электронной плотностью оснований расположены оптимально друг относительно друга. Таки.м образом, комплементарные пары оснований в нуклеиновых кислотах стабилизированы преимущественно электростатнчески.ми взаимодействиями [c.25]

Поиск такой модели начинают с выявления с помощью ЭВМ вариантов вторичных структур с числом комплементарных пар оснований, близким к максимальному. Далее отбираются вторичные структуры, образование которых соответствует минимуму свободной энергии. Для этого используют специальные алгоритмы, которые позволяют учесть протяженность двуспиральных участков, количество и последовательность чередования О-С-, А-П- и О-и-пар в них, характер и размеры дефектов в этих участках и т. д. Такие алгоритмы создают на базе экспериментальных данных, полученных при изучении стабильности большого числа синтетических оли-гонуклеотидных комплексов, моделирующих одно- и двутяжевые участки РНК. [c.37]

Последовательность примерно 75 нуклеотидных остатков была определена для многих молекул различных тРНК. У всех у них обнаружены четыре одинаковых участка, образованных комплементарными парами А = и или 0 = С, как показано на рис. 15.25. Существование этих участков позволило сделать вывод, что молекула имеет форму листа клевера, приведенную на рис. 15.25. Эта структура была подтверждена рентгеноструктурным анализом кристаллов дрожжевой фе-нилаланиновой тРНК (рис. 15.26). [c.463]

Расстояния между атомами кислорода и азота, связанными водородными связями в комплементарных парах оснований ДНК (см. рис. 15.20), равны 280—300 пм. Энергия водородной связи уменьшается в два раза при увеличении расстояния а каждые 20 пм. Насколько вандерваальсов контакт между двумя центральными NH-группами раздвигает основания в нестабильной паре GT (по сравнению с комплементарными парами) Насколько слабее в этом случае будет водородная связь (Ответ примерно на 100 пм.) [c.470]

Тадтомеризация нукле отидов [81 Нуклеотиды, помимо наиболее вероятной конформации (при которой они образуют комплементарные пары А-Т и О-С), способны к таутомеризации и переходу в такие конформации, при которых они могут формировать неканонические комплементарные пары. Если в момент репликации в родительской цепи ДНК произоАавт переход нуклеотида в таутомерную конформацию, то в дочерней цепи ЛНК возникнет некомплементарная пара, т.е. предму тационное состояние, которое может в дальнейшем породить замену нуклеотида в данной позиции. [c.91]

В рамках нашей работы внимание сосредоточено на моделировании процесса трансляции с детальным описанием влияния вторичной структуры мРНК на элонгацию рибосом. Построенная имитационная модель позволяет оценивать эффективность процесса трансляции мРНК с учетом параметров ее вторичной структуры I энергетическая стабильность шпилек, количество комплементарных пар [c.155]

Как и в случае полиаминокислот (см. 4.5), переход спираль— клубок может рассматриваться как плавление спирали. Простейшая модель для изучения этих процессов — синтетический гомополинуклеотид, содержащий комплементарные пары только одного сорта, например Поли-А — Поли-У. Такая двойная спираль плавится при 65 °С в 0,15 М растворе ЫаС1 при pH 7,0. Интенсивность полос поглощения при 2600 А увеличивается на 34%, а удельное вращение [а]в убывает на 275°. [c.507]

У-й кодон" с п нуклеотидами и+И-го кодона, входящими в состав комплементарных пар. Уравнения, соответствующие приведенной кинетической схеме, разрешаются относительно вероятности перехода с у-го кодона на У+1 кодон при различных значениях п в виде функции Время г начинает отсчитываться с момен- [c.159]

Раскручивание двойной спирали и пространств, разделение цепей осуществляется при помощи неск. спец. белков. Т. наз. геликазы расплетают короткие участки ДНК, находящиеся непосредственно перед репликац. вилкой. На разделение каждой пары оснований расходуется энергия гидролиза двух молекул АТФ до аденозиндифосфата и фосфата. К каждой из разделившихся цепей присоедшгяется неск. молекул ДНК-связывающих белков, к-рые препятствуют образованию комплементарных пар и обратному воссоединению пепей. Благодаря этому нуклео гиднью последовательности [c.253]

Под действием эндонуклеазы R, Е. oli кольцевые ДНК разрываются в одной точке, в результате образуются линейные нити. Под действием другого фермента - экзонуклеазы (из фага) укорачиваются нити ДНК с иротивоиоложных концов. Далее при иомощи фермента концевой трансферазы наращиваются нити ДНК, причем у одной ДНК новые концы состоят из адениловых (А), у другой-из тимидиловых (Т) остатков. При смещивании молекул концевые остатки А и Т образуют комплементарные пары, замыкая линейные молекулы в кольца. Вначале эти кольца содержат 4 разрыва, которые затем закрываются при участии еще одного фермента - ДНК-лигазы. [c.497]

Точность узнавания азотистых оснований демонстрируется табл. 8.1. Комплементарные пары АУ и ГЦ оказываются действительно наиболее прочными так, АУ значительно прочнее АА или УУ. Однако возможно образование и некомплементар- [c.265]

ДНК базируются на основополагающих работах Уотсона и Крика (1952 г.) [3.4.3]. Из данных рентгеноструктурного анализа и факта определенной упорядоченности структуры ДНК различного происхождения был сделан вывод, что две полинуклеотидных цепи тяжа) закручены в форме двойной спирали (рис. 3.4.1). При этом основания ориентированы перпендикулярно к оси спирали, расстояние между кольцами равно примерно 0,344 нм. На один виток спирали приходится 10 оснований в каждом из тяжей. Оба тяжа спирали удерживаются и стабилизованы за счет водородных связей и ван-дер-Ваальсовых взаимодействий между основаниями. При этом друг против друга располагаются так называемые комплементарные пары оснований тимин и аденин, цитозин и гуанин [3.4.4] (точнее остатки оснований) [c.665]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология