Нуклеозиды торсионные углы

Длина эфирной связи Р—О в фосфатной группе Н. (ок. 0,16 нм) меньше длины обычной простой связи (0,171 нм) т.е. вклад тс-связи близок к 35%. Вследствие sp -гибридиза-ции валентный угол при атоме кислорода в группировке Р—О—R увеличен до 118-120° и вращение вокруг связи С—О более заторможено, чем вокруг связи Р—О. Почти все торсионные углы в молекуле Н. коррелируют между собой. Обычно Н. конформационно менее подвижны, чем нуклеозиды, что не исключает наличия неск. конформаций в динамич. равновесии, но сказывается на их относит, заселен- [c.304]

Для нуклеозидов и нуклеотидов большое значение имеет взаимное расположение азотистого основания и углеводного кольца. Считают, что плоскости колец основания и сахара приблизительно перпендикулярны, но основание может вращаться вокруг гликозидной связи. В связи с этим для полной характеристики взаимного расположения плоскостей основания и сахара необходимо указать величину торсионного угла ф N Этот двугранный угол образован проекциями связей С - —О и N1—С (в случае пиримидинов) или N9—Се (в случае пуринов). Если связи N1—Св пиримидина (или N9—Сз пурина) и Сх —О сахара антипараллельны, фск считается равным 0° положительные углы отсчитываются по часовой стрелке, отрицательные — против часовой стрелки, если смотреть в направлении от к N. [c.366]

Истинные цис-с,вяш образуют торсионный угол, равный 0°. Однако в нуклеозидах вследствие искажения копланарности рибозного кольца 2 -и З -оксигруппы отклоняются от истинной г цс-конфигурации, образуя угол фад, равный 43—54°. Наличие г/ис-гликольной группировки является причиной того, что производные рибозы вступают в реакции с образованием 2, 3 -циклических соединений. Известны, например, 2, 3 -алкил-идеповые производные (см. стр. 369), 2, 3 -циклофосфаты (см. стр. 363), 2, 3 -карбонаты (см. стр. 371). Присутствие г ис-2 -гидроксильной группы является причиной лабильности эфиров нуклеозид-З -фосфатов в щелочной среде (см. стр. 363). [c.367]

РИС. 2.22. Конформационные свойства нуклеозидов. А. Несколько возможных конформаций рибозного или дезоксирибозного кольца нуклеозида [66]. Б. Вид на нуклеозид вдоль линии связи N—С, соединяющей пиримидиновое основание с сахарным кольцом. Угол х может пробегать значения от О до 360°. К сц -конформациям относят те конформации, для которых х принимает значения, расположенные на жирной полуокружности [66]. В. Второй вариант соглашения определений торсионного угла относительно гликозидной связн С—N. Угол % меняется от О до 80°. Показана анти-конформация нуклеозида. Г. Обозначения конформационных углов остова полинуклеотида [68]. (Отметим, что имеются еще по меньшей мере четыре другие системы [c.129]

Рассмотрим сначала угол у, характеризующий взаимное положение основания и углеводного кольца. Очевидно, если заданы угол X и конформация углеводного кольца, то структуру нуклеозида можно считать полностью определенной. До того, как была предложена рассмотренная выше номенклатура конформаций, для описания вращения вокруг гликозидной связи обычно использовался угол введенный Донохью и Трубладом [18] и определяемый как угол, образованный следом плоскости основания и проекцией связи Сг —О рибозы (или дезоксирибозы) на плоскость, перпендикулярную гликозидной связи. Положительные углы отсчитываются по часовой стрелке, если смотреть вдоль связи С —N от С1 к М фск считается равным 0°, когда угол между проекциями связей С]—О и N5—С4 в пурине (или N1—Са в пиримидине) равен 180°. Из рассмотрения молекулярных моделей авторы заключили, что существуют две предпочтительные области торсионных углов. Первая — с ф , равным —30 45° (ан/пм-область), вторая — с фсм, равным + 150 45° (син-область). Например, для аденозина [c.407]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология