Нуклеозиды

R Пуриновое или пиримидиновое основание Нуклеозид [c.107]

Рис. 3.2. Структура и номенклатура основных нуклеозидов.

НУКЛЕИНОВЫЕ кислоты, НУКЛЕОЗИДЫ И НУКЛЕОТИДЫ [c.188]

Блокирование аминогруппы аденина, гуанина или цитозина может оказаться необходимым при фосфорилировании для предотвращения образования фосфамидов. В более редких случаях (особенно для гуанина) оно такл<е позволяет достигнуть большей гидрофобности слишком полярного нуклеозида. [c.154]

Благодаря гидрофобности силилированных нуклеозидов любые побочные продукты можно отделить с помощью обычных приемов органической химии (хроматография на силикагеле). Фторид-ион в безводных средах — хороший нуклеофил. Силильная группа устойчива к обработке основаниями и гидразингидратом. [c.163]

Фосфорные эфиры нуклеозидов называют нуклеотидами для нуклеозидного остатка обычно требуется локант, например цитидин-5 -фосфат (31). Наиболее широко распространенные нуклеотиды называют также, модифицируя название нуклеози-да с добавлением окончания -иловая кислота , например 3 -уридиловая кислота (32). [c.188]

Другим примером использования метода молекулярного щупа является исследование гидратации фосфатной группы нуклеозидов и нуклеотидов [149, 163]. В качестве гидратационной характеристики использовался эффект ионизации этой группы, наблюдаемый по скорости распространения ультразвука в растворе (изменения скорости ультразвука отражают изменения объема и сжимаемости при ионизации молекулы). На рис. 3.6 представлены схематические изображения исследо- [c.49]

Имеются два хорошо известных типа нуклеиновых кислот рибонуклеиновые кислоты (РНК) и дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК). Они являются полимерами, построенными из углеводно-фосфатных звеньев (соединенных в цепи остатков фосфорной кислоты и рибозы или дезоксирибозы), с присоединенными в определенные положения углеводного звена гетероциклическими основаниями (точнее, их остатками). Наиболее распространенными гетероциклическими основаниями, входящими в состав нуклеиновых кислот, являются аденин, гуанин, ксантин, гипоксантин, тимин, цитозин и урацил. Эти названия приняты ШРАС/ШВ, однако в указателях СА применяются лишь систематические пурин-пиримидиновые названия. Глико-зилированные основания называют нуклеозидами, и их названия чаще всего строят из названий компонентов при этом название основания модифицируется окончаниями -озин или -идин , как в случае аденозина (29) и тимидина (30). [c.188]

УФ-спектры наиболее распространенных нуклеозидов можно най-тц в большинстве биохимических учебников. [c.113]

О ДНК и РНК говорилось как о высокомолекулярных соединениях, состоящих из мономерных единиц — нуклеозидов, соединенных между собой фосфодиэфирным] связями. Такое описание может привести к представлению, будто бы это длинные [c.113]

Фосфорилирование нуклеозида хлорфосфатом аналогично образованию пептидной связи, происходящему при взаимодействии амина с ацилхлоридом. Вероятно, один из простейших таких примеров— реакция рибонуклеозида с хлороксидом фосфора. В соответствующих условиях (триметил- или триэтилфосфат в качестве растворителя, О С, а затем обработка смесью диоксан — пиридин, комнатная температура) происходит фосфорилирование в основном [c.171]

Конечно, при взаимодействии с соответствующим образом защищенным нуклеозидом можно фосфорилировать и вторичную гидроксильную группу [c.172]

В работе [149] измерялись также объемные эффекты ионизации и изменения сжимаемости. Таким образом, взаимовлияние атомных групп нуклеотидов и нуклеозидов на гидратацию проявляется на расстояниях 0,6—0,8 нм между вандерваальсо-выми поверхностями групп, что соответствует двум-трем слоям молекул воды, т. е. менее чем двум слоям в гидратной оболочке. [c.50]

Пуриновые и пиримидиновые основания сильно поглощают в ультрафиолетовой области спектра благодаря наличию я-электронов, Ятах 260 нм (6260 нм 10 ) ДЛЯ ббЛКОБ 1тах 280 НМ. Положение максимума поглощения зависит от структуры основания (отсюда следует, что и от pH раствора, поскольку с изменением pH преобладают различные таутомерные формы), от введения в гетероциклическое ядро заместителей, но незначительно— от структуры сахарного остатка. Такие свойства полезно знать при синтезе пуриновых и пиримидиновых производных, так как их можно характеризовать соответствующими максимумами поглощения в ультрафиолетовых спектрах, а при хроматографическом определении также идентифицировать по поглощению в ультрафиолетовой области, например для Ы-бензоилгуано-зина (синтезируемого бензоилированием основания и сахарного остатка нуклеозида бензоилхлоридом в пиридине с последующим удалением бензоильных групп с сахарного остатка гидроксидом натрия) [c.113]

Группой. Кроме того, место атаки у того или иного основания меняется для ферментов, выделенных из различных источников. Например, бычья панкреатическая РНаза атакует фосфоэфирные связи пиримидинового нуклеозида, присоединенного к остатку фосфорной кислоты З -связью. В то же время РНаза из бактерии В. 8иЫШ8 атакует фосфоэфирную связь пуринового нуклеозида, присоединенного З -связью. [c.127]

Еще одним примером молекулярной модификации служит синтетический нуклеозид арабииоаденозин (1-23), который обладает значительной активностью к вирусу герпеса и поэтому широко применяется в современной химиотерапии. Сходство этого [c.22]

ТОЙ С образованием соответственно моно-, ди- или трифосфатов нуклеозидов. Ранее нам уже встречался аденозинтрис )осфат. Соединение, состоящее из основания, сахара и фосфата, называется нуклеотидом. Подобно аминокислотам — мономерным звеньям белкового полимера, — нуклеотиды (нуклеозидмонофосфаты) [c.107]

Эти азотистые основания слабо растворимы в воде, одна1Ю в составе нуклеозидов и нуклеотидов их растворимость увеличивается. Они характеризуются высокой температурой плавления >300°С. [c.109]

Такое направление реакции мол<но предотвратить, получив пмидазолид пирофосфата и проводя его реакцию с нуклеозид-монофосфатом. Альтернативным путем является гидролиз цикло-карбоната обработкой водным триэтиламином. В настоящее время для синтеза аналогов АТР и GTP, модифицированных по основанию или сахарному остатку, предпочитают использовать именно имидазолидный метод. Один из примеров — синтез [c.137]

Конечно, как и в случае образования пептидной связи, затрачивается определенная энергия, и поэтому необходима активация. Синтез фосфодпэфирной связи был бы невозможен при простом смешивании фосфорной кислоты с соответствующими защищенными нуклеозидами. Наконец (см. ниже), может потребоваться даже блокирование фосфатной группы. Хотя это не строго необходимо (и не применялось в первых нуклеотидных синтезах), такой метод имеет свои преимущества и в настоящее время наиболее распространен. [c.154]

После ацилирования аминогруппа становится химически неактивной, или ненуклеофильной. Тем не менее введение ацильной группы часто приходится осуществлять в две стадии полное ацилирование нуклеозида с последующим деаци-лироваиием сахара. Вдобавок гликозидная связь М-ацильных производных обычно менее устойчива к гидролизу. К типичным ацильным группам относятся аце-/ О / О / [c.155]

Как и в случае аминокислот, с нуклеозида тритильную группу можно удалить кислотной обработкой (т. е. 80%-ной уксусной кислотой, смесью пиридин — уксусная кислота). Реакция также проходит через образование промежуточного (стабилизированного) карбониевого иона. Введение п-метоксигруппы дополнительно стабилизирует такой ион. Поэтому кислотолабильность тритилированного [c.158]

Ацнлирование первичной и вторпчиой гидроксильных групп нуклеозидов чаще всего проводят, обрабатывая нуклеозид ангидридом или хлорангидридом кислоты в пиридине. В зависимости от реакционной способности и условий проведения реакции может также происходить ацилирование экзоциклических аминогрупп, если они присутствуют в гетероциклическом основании (см. выше). Помимо обычных ацильных групп (формильной, ацетильной, бензоильной, хлораце-тильной и т. д.), удаляемых чаще всего в щелочных условиях, предложен ряд ацильных групп, условия удаления которых делают их пригодными для нуклеотидного синтеза. [c.159]

Первоначально силилирование углеводов и нуклеозидов использовали для приготовления образцов в газовой хроматографии и масс-спектроскопии. Однако в настоящее время силильные соединения, особенно трег-бутилдиметилсилиль-ная группа ( -ВОМЗ), используются для блокирования гидроксильных групп. Обычно предпочитают объемистые группы благодаря их повышенной селективности к первичным гидроксилам и достаточной устойчивости к изомеризации даже в случае рибонуклеозидов, обладающих 1,2-Ч((с-диольной группировкой. Ниже приведена реакция тимидина с некоторыми силильными реагентами. [c.162]

Для синтеза нуклеозидмонофосфатов были изучены и другие дихлорфосфаты. 2,2,2-Трихлорэтил-2-хлорфенилхлорфосфат нашел, по-видимому, наиболее широкое применение для синтеза нуклеозид-З -фосфатов. При проведении фосфорилирования в пн- [c.172]

На основе сведений о различных защитных группах, пригодных для блокирования гидроксильных и аминогрупп, можно синтезировать защищенные нуклеозиды, в которых реакционноспособные группы образуют только 3, -фосфодиэфирную связь. Нежелательные продукты (3, 3 - или 5, 5 -фосфодиэфиры, фосф-амиды и т. п.), скорее всего не образуются. Показательный при- [c.166]

После завершения реакции защитные группы можно удалить в мягких условиях, не затрагивающих фосфодиэфирной связи. На этом основан фосфодиэфирный метод синтеза полинуклеотидов. Продукт реакции — фосфодиэфир со свободной, потенциально уязвимой для воздействия, отрицательно заряженной группой. Далее, с увеличением длины полинуклеотидной цепи число отрицательных зарядов в соединении также будет увеличиваться. Поэтому в зависимости от условий реакции эти потенциально нуклеофильные центры могут участвовать в нежелательных побочных реакциях. Кроме того, такое многозарядное соединение слищком полярно, чтобы можно было проводить его очистку обычными методами органической химии, например с помощью хроматографии на силикагеле. Вместо этого необходимо использовать хроматографию на ионообменных носителях, обладающих меньшей емкостью (например, на ДЭАЭ-целлюлозе). Фосфодиэфирный метод пригоден для получения веществ лишь в небольших количествах. Однако нейтрализация зарядов путем этерифи-кации подходящими защитными группами перед фосфорилирова-нием нуклеозидов устраняет проблемы, упомянутые выше. В этом случае продуктом реакции конденсации является фосфотриэфир. Фосфотриэфирный метод позволяет работать с большими количествами веществ. Ниже описаны некоторые защитные группы, используемые для блокирования фосфата. [c.167]

Именно защищенный фосфорилирующий агент и реягирует с нуклеозидами с образованием 3, 5 -фосфодиэфирной связи. После завершения реакции трихлор-этильная защитная группа может быть удалена несколькими способами классический— это обработка цинком, но можно использовать и фторид тетрабутил-аммония [c.168]

Легкодоступная бариевая соль циаиэтилфосфата — подходящий реагент для фосфорилирования нуклеозидов. После образования продукта реакции эту группу можно удалить мягкой щелочной обработкой или обработкой фторид-ионом. [c.168]

Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот (1990) -- [ c.6 , c.12 , c.25 , c.319 , c.320 ]

Органическая химия. Т.2 (1970) -- [ c.717 ]

Химический энциклопедический словарь (1983) -- [ c.394 ]

Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.123 , c.126 ]

Методы получения и некоторые простые реакции присоединения альдегидов и кетонов Ч.2 (0) -- [ c.433 , c.473 , c.474 ]

Углублённый курс органической химии книга2 (1981) -- [ c.420 , c.425 ]

Химия природных соединений (1960) -- [ c.0 ]

Синтетические методы органической химии (1982) -- [ c.41 ]

Органическая химия (1974) -- [ c.1062 ]

Молекулярная биология (1990) -- [ c.6 , c.11 , c.12 , c.25 , c.319 , c.320 ]

Общая органическая химия Т.10 (1986) -- [ c.33 , c.68 , c.81 , c.110 ]

Биологическая химия Изд.3 (1998) -- [ c.102 , c.103 , c.105 , c.176 , c.470 ]

Биофизика (1988) -- [ c.38 ]

Молекулярная биофизика (1975) -- [ c.85 , c.95 ]

Органическая химия (1979) -- [ c.661 ]

Химия гетероциклических соединений (2004) -- [ c.256 , c.575 ]

Химия углеводов (1967) -- [ c.52 , c.194 , c.205 , c.226 , c.230 , c.231 ]

Реагенты для органического синтеза Том 7 (1974) -- [ c.71 ]

Биоорганическая химия (1991) -- [ c.434 , c.436 ]

Биохимия (2004) -- [ c.174 ]

Органическая химия (1990) -- [ c.712 , c.713 ]

Основы современной химии гетероциклических соединений (1971) -- [ c.332 ]

Органическая химия (2001) -- [ c.554 ]

Органическая химия (2002) -- [ c.768 , c.924 ]

Большой энциклопедический словарь Химия изд.2 (1998) -- [ c.394 ]

Жидкостная колоночная хроматография том 3 (1978) -- [ c.3 , c.35 , c.65 , c.80 ]

Хроматографические материалы (1978) -- [ c.4 , c.23 , c.31 , c.34 , c.44 , c.50 , c.59 , c.72 , c.84 , c.143 , c.144 , c.148 , c.151 , c.160 ]

Органическая химия (1963) -- [ c.774 ]

Аффинная хроматография (1980) -- [ c.0 ]

Основные начала органической химии том 1 (1963) -- [ c.676 , c.696 ]

Молекулярная биология клетки Том5 (1987) -- [ c.79 ]

Биохимия растений (1966) -- [ c.461 , c.468 , c.473 , c.481 ]

Руководство по ядерному магнитному резонансу углерода 13 (1975) -- [ c.20 , c.208 , c.209 ]

Органическая химия 1965г (1965) -- [ c.559 ]

Органическая химия 1969г (1969) -- [ c.643 ]

Органическая химия 1973г (1973) -- [ c.598 ]

Успехи стереохимии (1961) -- [ c.180 ]

Биохимия нуклеиновых кислот (1968) -- [ c.21 ]

Биологическая химия Издание 3 (1960) -- [ c.56 , c.357 ]

Биологическая химия Издание 4 (1965) -- [ c.56 , c.377 ]

Основы биологической химии (1970) -- [ c.125 , c.126 ]

Органическая химия Издание 3 (1977) -- [ c.220 , c.601 , c.603 ]

Органическая химия Издание 4 (1981) -- [ c.553 ]

Курс органической химии (1970) -- [ c.393 ]

Органическая химия Углубленный курс Том 2 (1966) -- [ c.701 ]

Основные начала органической химии Том 1 Издание 6 (1954) -- [ c.582 , c.603 ]

Органическая химия Издание 2 (1980) -- [ c.423 ]

ЭПР Свободных радикалов в радиационной химии (1972) -- [ c.311 ]

Органическая химия (1972) -- [ c.433 ]

Оптимизация селективности в хроматографии (1989) -- [ c.0 ]

Химия высокомолекулярных соединений Издание 2 (1966) -- [ c.439 ]

Химия нуклеозидов и нуклеотидов (1966) -- [ c.14 ]

Биохимический справочник (1979) -- [ c.62 ]

Курс органической химии Издание 4 (1985) -- [ c.474 ]

Органическая химия (1972) -- [ c.433 ]

Органическая химия Издание 2 (1976) -- [ c.432 ]

Химия и биохимия углеводов (1977) -- [ c.117 ]

Пептиды Том 2 (1969) -- [ c.386 ]

Курс органической и биологической химии (1952) -- [ c.166 , c.331 ]

Курс органической химии (0) -- [ c.1045 , c.1048 ]

Газовая хроматография - Библиографический указатель отечественной и зарубежной литературы (1967-1972) Ч 1 (1977) -- [ c.0 ]

Начала органической химии Кн 2 Издание 2 (1974) -- [ c.674 , c.678 ]

Начала органической химии Книга 2 (1970) -- [ c.744 ]

Методы исследования углеводов (1975) -- [ c.0 ]

Курс органической химии _1966 (1966) -- [ c.507 ]

Органическая химия Издание 4 (1970) -- [ c.309 ]

Хроматография на бумаге (1962) -- [ c.503 , c.510 , c.513 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.326 , c.338 , c.346 , c.350 ]

Биохимия Издание 2 (1962) -- [ c.49 , c.50 , c.113 , c.437 , c.438 , c.450 ]

Современная генетика Т.3 (1988) -- [ c.101 ]

Биохимия человека Т.2 (1993) -- [ c.7 , c.8 , c.9 , c.13 , c.15 , c.16 , c.22 ]

Биохимия человека Том 2 (1993) -- [ c.7 , c.8 , c.9 , c.13 , c.15 , c.16 , c.22 ]

Аффинная хроматография Методы (1988) -- [ c.173 ]

Полярография лекарственных препаратов (1976) -- [ c.121 ]

Основы биохимии (1999) -- [ c.197 , c.231 ]

Металлоорганическая химия переходных металлов Том 2 (1989) -- [ c.184 , c.218 ]

Биологическая химия (2004) -- [ c.103 , c.366 , c.375 ]

Биохимия Т.3 Изд.2 (1985) -- [ c.255 , c.256 , c.257 , c.258 , c.259 , c.260 , c.261 , c.262 , c.263 , c.264 , c.265 , c.266 , c.267 , c.268 , c.269 , c.270 , c.271 , c.272 , c.273 , c.274 , c.275 , c.276 , c.277 , c.278 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология