Терминатор, зависимость от фактора

Терминатор, зависимый от фактора р [c.165]

На рис. 13.6 изображена генетическая карта ранней области фага лямбда. Два предранних гена N и его транскрибируются РНК-полимеразой Е. соИ соответственно влево и вправо от промоторов, обозначенных Pl и Pr. Это означает, что при левосторонней и правосторонней транскрипции в качестве матрицы используются разные цепи ДНК. На рис. 13.7 показано, что транскрипция, осуществляемая РНК-полимеразой Е. соН, останавливается в конце генов N и его соответственно на терминаторах ILi и tR . Оба этих терминатора являются р-зависимыми. (Первоначально фактор р был обнаружен благодаря функционированию именно этих терминаторов.) [c.169]

Как показано на рис. 39.6, р-зависимые сигналы терминации транскрипции в клетках Е. соИ также характеризуются определенной консенсусной структурой. Консервативная последовательность терминатора, состоящая примерно из 40 нуклеотидов, содержит разнесенные на некоторое расстояние инвертированные повторы и заканчивается серией АТ-пар. РНК-транскрипт, образовавшийся после прохождения транскрипционного комплекса через область инвертированных повторов, может формировать внутримолекулярную шпилечную структуру, изображенную на рис. 39.6. Транскрипция продолжается далее в вышеупомянутую АТ-область, после чего под воздействием специфического белка-терминатора, так называемого р-фактора, РНК-полимеразный комплекс останавливается и диссоциирует, высвобождая первичный РНК-транскрипт. [c.85]

У р-зависимых терминаторов в шпильке обычно ниже относительное содержание G -nap и, кроме того, отсутствует олиго(гЦ)-учас-ток (см. рис. 3.3). Фактор р представляет собой белок с молекулярной массой 55 кДа. Активной формой, по-видимому, является тетрамер. Полагают, что фактор р связывается с 5 -концом [c.145]

Связыванию р-фактора с РНК мешают также рибосомы, транслирующие РНК, поэтому на р-зависимых терминаторах, встречающихся внутри структурных генов, р-фактор не обеспечивает терминации, если мРНК эффективно транслируется. Наличие таких терминаторов внутри генов, по-видимому, не случайно. Когда синтез белка по каким-либо причинам подавлен, они сигнализируют РНК-поли.меразе о том. что мРНК не транслируется и синтез ее Осмыслен. [c.157]

Степень зависимости от фактора р варьирует. Для некоторых терминаторов необходима относительно высокая концентрация фактора р, тогда как другие хорощо функционируют при более низких его концентрациях. Эти вариации отражают истинные различия в эффективности терминации, обнаруживаемые in vivo. [c.163]

Существуют ли терминаторы полностью независимые от фактора р Некоторые терминаторы in vitro при встрече с минимальным ферментом, по видимому, способны в одиночку осуществлять весь комплекс термина-ционных реакций. Это так называемые р-независимые терминаторы. Однако мы должны с осторожностью трактовать эти данные, так как возможно, что в действительности в бактериальной клетке фактор р также необходим для узнавания таких сигналов терминации. In vitro в отсутствие фактора р эти терминаторы проявляют свое действие только тогда, когда транскрипция происходит в условиях относительно высокой ионной силы. При этом, возможно, истинная (при низкой ионной силе) зависимость от фактора р не тестируется. [c.163]

Результаты, получаемые in vitro, не вносят в этот вопрос окончательной ясности, поскольку р-зависимые и р-независимые терминаторы необходимо исследовать в различных условиях. Какую информацию можно получить in vivo Существуют бактериальные мутации, нарушающие активность фактора р. Хотя такие мутации по-разному влияют на различные р-зависимые терминаторы, как правило, они не сказываются на процессе терминации в сайтах, которые in vitro были охарактеризованы как р-независимые. [c.163]

Предположим, что внутри транскрипционной единицы могут существовать р-зависимые терминаторы, располагающиеся перед основным терминатором. Тогда явление полярности можно объяснить как на рис. 13.4. Обычно терминаторы, находящиеся внутри транскрипционной единицы, не работают, так как из-за присутствия рибосом фактор р на этих терминаторах никогда не взаимодействует с РНК-полимеразой, хотя она делает здесь паузу. Нонсенс-мутации приводят к освобождению мРНК от рибосом, и поэтому у фактора р появляется возможность свободно передвигаться вдоль мРНК. В результате он может провзаимодействовать с полимеразой, остановившейся на терминаторе. Это приведет к терминации и освобождению РНК-полимеразы. Следовательно, дистальная часть транскрипционной единицы не сможет экспрессироваться. (Для чего существуют внутренние терминаторы Возможно, что они являются просто шпильками, похожими на те, которые возникают на обычных терминаторах. Терминация с участием этих структур может происходить только в необычных условиях полярности). [c.167]

Транскрипция на стадии I приводит к появлению мРНК для двух белков N и Сго (названия белков набраны прямым щрифтом, а названия генов-курсивом). Функционируя как фактор антитерминации, белок N создает возможность экспрессии генов второй стадии. В присутствии белка N поток транскрипции, инициированный на Р и Pr, преодолевает р-зависимые терминаторы tu и ir,. В результате появляется мРНК от гена ein до гена int в левом опероне и от гена сП до в правом оперо-не. Транскрипция правого оперона прекращается на терминаторе t , а транскрипция левого оперона прекращается в области bj (рис. 15.13, светло-серые стрелки). Мутанты, дефектные по функции гена N, гибнут из-за очень сильного снижения уровня транскрипции на стадии II, в результате которого гены, существенные как для лизиса, так и для лизогенизации, не экспрессируются. [c.185]

ИЗ 6 уридиновых остатков (рис. 1.2). На первом участке движение РНК-полимеразы по ДНК замедляется и даже останавливается, а на втором — РНК-полимераза отсоединяется от ДНК. Характерной особенностью К1ю-зависимых терминаторов является наличие шпильки и обогащенность (до 40 %) концевого участка транскрипта длиной 50—90 нуклеотидов цитидиловыми остатками и его обед-ненность (до 15 %) гуанидиловыми остатками. В таких участках К1ю-фактор связывается с мРНК, двигаясь вдоль нее, догоняет РНК-полимеразу, застрявшую на шпильке, и способствует се отсоединению от ДНК. Подобные структуры (С-богатый — С-бедный участок с последующей шпилькой) встречаются и в середине генов, но в этом случае действию КЬо-фактора препятствуют рибосомы, осуществляющие синтез белка. [c.19]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология