Кодоны эффективность терминации

Выделить супрессоры охра-мутаций всегда трудно, причем для них характерна более низкая эффективность-обычно ниже 10%. Скорость роста клеток, содержащих охра-супрессоры, снижена. Из этого следует, что одновременная супрессия кодонов UAA и UAG неблагоприятна для клетки, возможно, в силу того, что охра-ко-доны наиболее часто используются в качестве природных сигналов терминации. Отсутствие сколько-нибудь [c.100]

Голодание по другим аминокислотам не приводит к такому результату, так как положения, в которых рибосома останавливается, не препятствуют спариванию областей 1 и 2, что в свою очередь способствует образованию структуры шпильки спарившимися областями 3 и 4. Случай с голоданием по глицину показан на рисунке. Единственное исключение представляет аргинин, кодирующая последовательность которого следует непосредственно за кодонами триптофана. Остановка рибосомы в этом положении также ослабляет терминацию, хотя и менее эффективно, чем в случае ее остановки в кодонах триптофана. [c.193]

Некоторые мутации в лидерной области усиливают эффект терминации в аттенуаторе. Они могут препятствовать снятию терминации при голодании по триптофану. Одна из таких мутаций дестабилизирует спаривание между областями 2 и 3. В результате область 3 приобретает возможность спариться с областью 4 и образовать шпилечную структуру терминатора даже в тех случаях, когда клетки голодают по триптофану. Другая мутация изменяет инициирующий кодон AUG лидерного пептида, предотвращая в результате трансляцию. Наблюдаемое в результате увеличение эффективности терминации свидетельствует о том, что транскрипция с проскакиванием аттенуатора зависит от способности транслировать лидерную область. [c.193]

Существуют также различия между прокариотами и эукариотами по использованию кодонов, терминирующих трансляцию. В эукариотических мРНК используются все три терминаторных кодона (UAA, UGA и UAG), но чаще кодон UAA. В прокариотических мРНК терминация в основном происходит на шдоне UAA. Обнаружено, что на эффективность терминации трансляции также влияют последовательности мРНК, прилегающие к терминатор-ному кодону. Причем для про- и эукариот они различаются. [c.157]

В случае MS2 РНК после терминации трансляции каждого из перечисленных цистронов происходит, по-видимому, диссоциация рибосом от матрицы. Каждый цистрон в соответствующий момент начинает транслироваться в результате независимой инициации свободными рибосомами из среды. Однако ситуация с L-цистроном, очевидно, другая. По каким-то структурным причинам не удается получить эффективной ассоциации рибосом с инициаторным районом L-цистрона на MS2 РНК. Полагают, что инициация трансляции L-цистрона может иметь место вследствие время от времени происходящего спонтанного сдвига рамки (-И) при трансляции конца С-цистрона рибосомами в этом случае рибосомы терминируют на триплете UAA, отстоящем на три нуклеотида к 5 -концу от инициирующего кодона L-цистрона, и, не успев соскочить с матрицы, реинициируют на первом близлежащем триплете AUG (см. рис. 7). Естественно, что продукция L-цистрона должна быть маленькой, как это и есть на самом деле. [c.236]

Клонируемый ген встраивают в N ol-, Pst -или // иёШ-сайт, расположенный между сайтом связывания рибосомы и сайтами терминации транскрипции. Если его рамка считывания не попадает в ногу с кодоном AUG, то необходимо произвести минимальную коррекцию. В этом случае после индукции и транскрипции происходит достаточно эффективная трансляция клонированного гена. Однако следует иметь в виду, что поскольку нуклеотидная последовательность, кодирующая N-концевой участок белка-мищени, у разных клонированных генов неодинакова, нельзя создать универсальный вектор, исключающий одноцепочечное спаривание мРНК при любых обстоятельствах. Поэтому ни одна из областей инициации трансляции, как бы она ни была оптимизирована, не может га- [c.121]

В настоящее время кажется вероятным, что в конце генов имеется один или несколько бессмысленных кодонов в качестве естественного сигнала о терминации полипептидной цепи. (Как указывалось в гл. XVII, в информационной РНК должна существовать определенная последовательность, которая, попав в аминоацильный участок рибосомы, дает сигнал об освобождении законченной полипептидной цепи из пептидильного участка.) Непонятно, однако, как клетке удается выжить, если у нее возникает эффективный супрессор естественного сигнала терминации полипептидных цепей. Поэтому роль естественного сигнала терминации приписывают o hre-кодрну УАА, т. к. все известные супрессоры этого кодона характеризуются очень низкой эффективностью. [c.458]

При выделении нонсенс-супрессоров использовали их способность узнавать мутантные нонсенс-кодоны, которые в силу особенностей своего расположения в гене оказывали летальное действие. Между тем один из нормальных терминирующих кодонов имеет такую же последовательность оснований как и супрессируемый нонсенс-кодон. Следовательно, мутантная тРНК, супрессирующая нонсенс-мутацию, в принципе должна быть способна супрессировать и нормальные терминирующие кодоны в конце всех генов. Тогда в результате сквозного прочитывания текста произойдст образование более длинного белка с дополнительным С-концевым пептидом. Таким образом, вероятнее всего, что эффективная супрессия терминации окажется летальной для клетки, так как при этом появятся более длинные белки с измененной функцией. [c.100]

В фагмидных экспрессирующих векторах на месте стыковки гена белка оболочки и клонируемого гена часто помещают кодон терминации трансляции. При таком устройстве вектора система дисплея начинает функционировать только в супрессорных штаммах Е. соИ, а в отсутствие супрессии в бактериальных клетках синтезируется исследуемый белок клонотеки. Этот подход исключает необходимость переклонирования изучаемой последовательности нуклеотидов после отбора белка с нужными функциями с помощью фагового дисплея. Однако ограниченная эффективность супрессии может сделать уровень экспрессии гибридного белка на поверхности фаговых частиц очень низкой. [c.336]

Структура и свойства участников трансляции эукариотической мРНК пока изучены гораздо хуже, чем у прокариот. И хотя у эукариот вьщеляют те же три стадии процесса —инициацию, элонгацию и терминацию,-на каждой из них требуется больще не-рибосомных белковых факторов. Несмотря на эти различия, последовательности, кодирующие белки прокариот, нормально транслируются эукариотическими системами трансляции при условии соответствующей модификации их мРНК на 3 - и 5 -концах (рис. 3.8, А). И наоборот, кодирующие последовательности эукариот эффективно транслируются системами прокариот, если у них перед 5 -концом инициаторного кодона AUG имеется последовательность Шайна-Дальгарно. Это значит, что трансляционные аппараты обоих типов организмов [c.159]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология