Консервативная последовательность в промоторах

Гены, кодирующие адаптивные белки, образование которых резко усиливается под влиянием разных факторов среды (повышение температуры, отравление металлами), содержат в составе промоторов дополнительные характерные короткие нуклеотидные последовательности. В ответ на повышение температуры или другие стрессы (например, отравление ядами) вырабатываются особые белки, получившие название белков теплового шока. Считается, что быстрое накопление таких белков в клетке обеспечивает физиологическую адаптацию к изменившимся условиям среды. Эти белки чрезвычайно консервативны, они мало менялись в эволюции. Например, белки, имеющие Мг = 70 ООО и образующиеся после теплового шока в клетках . соИ, растений, насекомых и млекопитающих, проявляют большую степень гомологии по аминокислотной последователь- [c.199]

Рис. 11.5. Точки контакта для РНК-цолимеразы находятся на одной поверхности ДНК, образующей промотор. Последовательность ДНК представляет типичный промотор с консервативными последовательностями в положениях -35 и -10. Область первоначального разделения цепей начинается от блока Прибнова и заканчивается сразу за стартовой точкой.

Консервативная последовательность промотора [c.263]

Обнаружено также очень небольшое количество промоторов, лишенных положения — 10. Таким образом, ни одна из консервативных последовательностей не является абсолютно необходимой для функционирования промотора. Нам пока еще не известны все детали реакции узнавания, и сейчас мы с уверенностью можем сказать только одно типичный промотор использует положения — 35 и — 10 для взаимодействия с РНК-полимеразой. Поскольку у ряда промоторов рассмотренные последовательности отсутствуют, можно предполагать существование других способов узнавания, однако, сколько существует таких механизмов и как они восполняют отсутствие среднестатистических последовательностей, пока не известно. [c.144]

К настоящему времени определены последовательности многих промоторов, узнаваемых РНК-полимеразой фага Т7. Они существенно отличаются от промоторов, с которыми взаимодействует фермент клетки-хозяина. Размеры промоторов фага Т7 меньше, чем размеры бактериальных промоторов. Для них характерно наличие консервативной последовательности протяженностью в 23 п.п., занимающей положение от — 17 до +6. Внутри этой области нет аналога блоку Прибнова, хотя промотор обогащен парами А—Т и обнаруживаются два по- [c.161]

Были предприняты попытки определить характерные особенности ДНК, необходимые для связывания РНК-полимеразы. Для этого сравнивали последовательности различных промоторов. Любая необходимая для связывания нуклеотидная последовательность должна присутствовать во всех промоторах. Такую последовательность принято называть консервативной. Однако в результате [c.143]

Далее против хода транскрипции имеется другая последовательность, которая у некоторых промоторов консервативна, хотя в ряде других случаев она отсутствует. Эта последовательность располагается между положениями — 70 и — 80, и ее канонический состав имеет вид [c.149]

Из характеристики этих фаговых промоторов мы видим, что по своим основным свойствам они аналогичны бактериальным промоторам. Для процесса специфичного узнавания промотора необходимо, чтобы очень небольшая последовательность ДНК была консервативной. Эта последовательность располагается внутри связывающего участка, в состав которого, вероятно, входят еще и другие последовательности. [c.161]

Сравнивая последовательности многих промоторов, мы можем построить консенсус-промотор два консервативных его участка показаны на рис. 2.15. Последовательность любого промотора в областях — 10 и — 35 более или менее сходна с этими консенсус-последовательностями. [c.57]

Здесь и далее при рассмотрении промоторов для наглядности оперируют цепью ДНК, которая соответствует по последовательности матричной РНК, но в действительности является комплементарной той цепи ДНК, которая транскрибируется.) Выявленные консервативные последовательности промоторов представляют собой участки контакта холофермента с ДНК. Несимметричностью последовательности промотора обеспечивается однозначный выбор ферментом направлегшя транскрипции. [c.143]

Во всех случаях, когда предпринимались попытки обнаружить промоторную последовательность РНК-поли-меразы, предполагалось, что промотор окажется расположенным против хода транскрипции (считая от стартовой точки). Так продолжалось до тех пор, пока не был охарактеризован промотор для генов, кодирующих 58-РНК у X. laevis. У этих генов, транскрибируемых РНК-полимеразой III, промотор расположен в пределах транскрипционной единицы на расстоянии более чем 50 оснований правее стартовой точки по ходу транскрипции. Такое его расположение объясняет отсутствие сколько-нибудь очевидных консервативных последовательностей в участках, расположенных слева от стартовых точек генов, транскрибируемых РНК-полимеразой III. [c.154]

Чем отличаются различные классы промоторов Гены, принимающие участие в спорообразовании, не содержат обычных консервативных последовательностей, обнаруживаемых в положениях — 35 и — 10 промоторов вегетативных генов. Вероятно, каждый класс промоторов, контролирующих гены спорообразования, обладает характерными только для него консервативными последовательностями. Этот вывод, возможно, справедлив также и в случае промоторов, контролируемых вторым вегетативным фактором Похожая ситуация обнаруживается при исследовании средних генов бактериофага 8Р01, среди которых было изучено достаточное количество последовательностей промоторов, чтобы определить среднестатистическую. [c.159]

Но в области — 35 обнаруживаются различия. Как и в случае промоторов Е. соИ, только в этой области (кроме блока Прибнова) промоторов средних генов можно выявить сколько-нибудь консервативную последовательность. Эта последовательность представляет собою гексануклеотид [c.160]

Для того чтобы РНК-полимераза фага Т7 инициировала синтез РНК, по-видимому, необходима только часть консервативной последовательности. Когда последовательность, находящаяся слева от положения — 12, заменяется другой ДНК, то промоторы этого класса сохраняют способность взаимодействовать с ферментом. Иными свойствами обладает последовательность промотора фага ТЗ, имеющая общий с промотором фага Т7 участок от положения — 9 до +А, однако не узнаваемая РНК-по-лимеразой фага Т7. По-видимому, в случае обеих РНК-полимераз последовательность, одинаковая в промоторах фагов ТЗ и Т7, вьшолняет одну и ту же роль, однако первоначальное узнавание осуществляется по-разному, и основное значение в нем придается последовательностям, расположенным левее. [c.161]

Рис. 2.15. Консенсус-последовательность промотора. Этот промотор обеспечивает транскрипцию слева направо. Первое транскрибируемое основание обозначается +1 —10 и —35-основания, лежащие до начала транскрипции. Консервативную последовательность в области —10 иногда называют ТАТА-последовательностью. Расстояние между консервативными элементами раз-.1ИЧНЫХ промоторов (ТАТА и областью —35) колеблется от 15 до 18 пар оснований, причем оптимально расстояние в 17 пар.

Непрерывны Стабильны Гены, выполняющие общую функцию, сгруппированы в опероны (регулоны) ТрАнскрипция Одна, распознает промотор с помощью ст-субъединицы Единыи план строения, наличие двух консервативных последовательностей у Е соИ ТАТААТ (-10) и TTGA A (-35) [c.15]

Сайт-специфический мутагенез области, примыкающей слева к гену ALB крысы, и определение влияния мутаций на эффективность транскрипции позволили выявить шесть консервативных последовательностей, которые входят в базальный промотор и обусловливают его тканеспецифичность (рис. 8.40). Базальный промотор составляют два элемента последовательность ТАТА, задающая точку начала транскрипции, но не влияющая на [c.66]

Можно предполагать, что функционирование промоторов осуществляется на основе двух групп факторов облигатных и факультативных. К облигатным, то есть присутсвупцим в обязательном порядке, можно отнести консервативные блоки в последовательностях функциональных сайтов (например, -10 и -35 блок в промоторах Е.соИ ). Возможно, что именно облигатные структуры обеспечивает базовый уровень активности функциональных сайтов. [c.237]

В р-глобиновом гене мыши также были обнаружены три типа участков, расположенных аналогичным образом. Однако существенные различия между двумя промоторами состоят в том, что центральная последовательность в г инов(эм консервативный [c.152]

Одна из возможностей состоит в том, что фермент способен узнавать широкий диапазон промоторных последовательностей. Это не кажется невероятным, если учесть, что в промоторах, узнаваемых РНК-полимераза-ми других типов, консервативные участки очень малы по размеру. Возможно также, что фермент самостоятельно не способен узнавать промотор, а нуждается для этого во вспомогательном факторе. В этом случае необходимо существование различных факторов для каждого типа промотора. Действительно, оказывается, что РНК-полимераза III способна транскрибировать гены, кодирующие 5S-PHK, только в присутствии вспомогательного фактора. Это белок с мол. массой 37 000 дальтон, взаимодействующий с участком от -ь 45 до -ь 96. Данный белок (несколько копий которого должно связаться с ДНК, чтобы покрыть столь обширную область) одновременно служит двум целям, поскольку в ооцитах он также связывается с образовавшейся 5S-PHK. Рассматриваемый регуляторный белок не связывается с ДНК, кодирующей тРНК 1 Мы можем предположить, что в дальнейшем будет охарактеризован ряд аналогичных факторов, играющих важную роль в селекции промоторов. [c.155]

Важным фактором транскрипции для многих промоторов РНК-полимеразы II служит TFI1D. Он представляет собой большой белковый комплекс, который обычно называют ТАТА-фактор, так как он может связываться с консервативной АТ-богатой последовательностью, называемой ТАТА-бокс, которая расположена примерно за 25 нуклеотидов до сайта начала транскрипции. Механизм действия ТАТА-фактора, стимулируюшего транскрипцию полимеразой IL представлен на рис. 9-69 [c.147]

Анализ нуклеотидной последовательности клонированных генов позволил выявить ряд областей ДНК, играющих существенную роль в процессах транскрипции. На основе изучения большого числа бактериальных генов стало возможным построение консенсусных моделей последовательностей, выполняющих функции промоторов и терминаторов транскрипции. Бактериальные промоторы состоят примерно из 40 нуклеотидных пар (4 витка двойной спирали ДНК), т.е. они достаточно малы, чтобы полностью закрываться РНК-холополимеразным комплексом Е. oli. В рамках консенсусной структуры промотора выявлены два коротких консервативных элемента. На расстоянии около 35 нуклеотидных пар в сторону 5 -конца от точки начала транскрипции находится восьмичленная последовательность, изображенная на рис. 39.5. На более близком расстоянии к точке инициации транскрипции (около [c.85]

В препаратах цитоплазматической РНК мозга также обнаружены короткие молекулы РНК, содержащие ID-последовательность ВС1 (160 нуклеотидов), ВС2 (100-110 нуклеотидов) и ТЗ (75 нуклеотидов). Синтез этих малых РНК осуществляется РНК-полимеразой III, узнающей консервативные участки в Ш-по-следовательности, гомологичные внутреннему промотору генов РНК-полимеразы III (см. рис. 1.1.). Обнаруженные в клетках эукариот малые РНК, как показано в последние годы, ифают важнейшую роль в таких процессах, как сплайсинг и 3 -процессинг пре-мРНК, трансляция и трансмембранный транспорт секретируемых белков и т.п. [c.22]

Фермент РНК-полимераза Е. oli узнает многие промоторы, расположенные в начале самых разных генов. Напомним (см. введение), что промотор занимает около 60 пар оснований, в том числе 20 пар оснований за местом начала транскрипции (т.е. по ее ходу). Вообще говоря, двух одинаковых промо-торных последовательностей не существует, но все они содержат два характерных участка один из них расположен за 10 пар оснований до точки начала транскрипции, а второй-примерно за 35 пар оснований до этого места. Первое основание ДНК, которое копируется в виде РНК, принято обозначать номером + 1, так что середины этих консервативных про- [c.56]

Три, распознают промотор с помощью транскрипционных факторов Промоторы генов, кодирующих белки, имеют одну консервативную ТАТА-последовательность, а также мозаичный набор из разных боксов. У высших эукариот СААТ, ОС, октамер АТТТССАТ и др. [c.15]

Приведены последовательности нуклеотидов в консервативных уча стках промотора и в стартовом сайте транскрипции На мРНК. ука аны возможные инициирующие и терминирующие кодоны р — промогор t — терминатор гранскрипции > — инициирующий кодон, i — терми [c.17]

Смотреть страницы где упоминается термин Консервативная последовательность в промоторах: [c.167] [c.143] [c.143] [c.257] [c.18] [c.30] [c.59] [c.263] [c.263] [c.279] [c.257] [c.119] [c.210] [c.119] [c.160] [c.138] [c.151] [c.155] [c.244] [c.169] [c.156]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология