Фосфатная группа и спектр ЯМР нуклеотидов

Некоторые константы скоростей реакций пиримидинов, их нуклеозидов и нуклеотидов с гидратированным электроном приведены в табл. 5.4. Из таблицы видно, что присутствие отрицательно заряженной фосфатной группы в нуклеотиде уменьшает константу скорости реакции с е . Электронные аддукты пиримидина наблюдались при импульсном радиолизе в деаэрированных водных растворах с добавлением трет-бутанола для удаления Н - и ОН -радикалов [7731. Спектр поглощения электронного аддукта урацила имеет [c.228]

Большая степень взаимодействия 5 -фосфатных групп по сравнению с 2 -и З -фосфатными группами проявляется, в частности, во влиянии на величину химического сдвига протонов в спектрах ЯМР соответствующих нуклеотидов по сравнению с нуклеозидами (см., например, " ). [c.188]

Образование такого комплекса возможно при больших отношениях молярных концентраций нуклеотидов (Р) и красителя (Д), т. е. при Р/Д>- 10. При увеличении концентрации АО до стехиометрического, т. е. когда Р/Д = 1, начинается агрегация красителя на молекуле НК. При этом молекулы красителя взаимодействуют с наружными фосфатными группами молекул НК и максимум спектра поглощения этого комплекса приходится на 474 ммк. На гибких деспирализованных участках молекул НК краситель всегда образует агрегаты. [c.122]

Другая серия работ, проводимых в лаборатории Д. Г. Кнорре (С. К. Василенко и др.), направлена на установление первичной структуры олигонуклеотидов и т-РНК. Основу этих исследований составляет остроумное использование фосфодиэстеразы змеиного яда. Олигонуклеотиды тина Pup(Pup)nPyp, образующиеся при гидролизе РНК панкреатической рибонуклеазой, после снятия З -концевой фосфатной группы подвергали неполному перевариванию фосфодиэстеразой. При этом образуется набор олигонуклеотидов разной длины, причем конце вой нуклеотид в смеси находится в виде нуклеозида. Полученные фрагменты отличаются по величине и могут быть разделены ионообменной хроматографией. Сравнение спектров олигонуклеотидов, содержащих т я (т + 1) нуклеотидов, позволяет определять т + 1)-й нуклеотид. Таким образом, сравнивая попарно олигонуклеотиды, можно определить последовательность в исходном олигонуклеотиде. Работа выполнена совместно с Институтом химии природных соедипений АН СССР. [c.522]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология