Ретротранспозон класса

Ретротранспозоны класса II не имеют концевых повторов, а один из концов часто бывает представлен АТ-богатой последовательностью. В этом отношении они не похожи на ретровирусные провирусы. Элементы класса II менее изучены, чем [c.228]

Размер дуплицированных последовательностей для разных мобильных элементов различается. Для транспозонов и ретротранспозонов класса I, как правило, характерны дупликации сайтов-мишеней определенного размера. Например, встраивание транспозонов ТпЗ Е.соИ в новые локусы всегда сопровождается дупликацией участка размером [c.228]

Типичный ретротранспозон класса I и его транскрипт. [c.249]

Структура Ту-элементов. Ту-элементы имеют структуру, типичную для ретротранспозонов класса [c.249]

Структурное сходство. Структурное сходство ретротранспозонов класса 1 и интегрированной двухцепочечной формы ретровирусного генома (провируса) не вызывает сомнений (рис. 10.36). Оба они имеют одинаковую структуру длинные концевые прямые повторы (LTR), окружающие более протяженный центральный участок. Несмотря на то что нуклеотидные последовательности LTR у разных семейств различаются, все они начинаются и заканчиваются короткими инвертированными повторами, так что этими повторами начинаются и заканчиваются и сами единицы. Более того, первые два нуклеотида инвертированных повторов в разных единицах одинаковы это 5 -TG (рис. 10.37). В некоторых случаях сходными оказываются и другие пары оснований. Кроме того, отмечается сходство между U3-, R- и U 5-областями провирусных LTR и LTR ретротранспозонов. Сигнальные последовательности, участвующие в регуляции транскрипции с помощью РНК-полимеразы II, в том [c.259]

Типичные ретротранспозоны класса II не содержат длинных концевых повторов и имеют длину несколько т.п.н. (рис. 10.41). При их встраивании [c.263]

Структура ретротранспозонов класса II. Длинные открытые рамки считывания выделены цветом отмечены участки, обнаруживающие гомологию с последователь- [c.264]

Общая характеристика ретротранспозонов класса 11. Если оставить в стороне вопрос об отсутствии у ретротранспозонов класса II длинных концевых повторов, то можно сделать вывод, что эти ретротранспозоны во многом сходны с ретровирусами и ретротранспозонами класса I. Во-первых, это способность кодировать обратную транскриптазу во-вторых, наличие во многих случаях двух ORF в одной цепи. Аналогичное сходство наблюдается между дад- (и 0 г-подобными) генами и /)о/-облас-тями ретровирусов и ретротранспозонов класса I. Однако, несмотря на то что ORF II у всех элементов класса II сходны в том отношении, что они кодируют обратную транскриптазу, их ORF 1 различаются. [c.266]

Ретротранспозоны. Эукариотические мобильные элементы, транспозиция которых происходит при транскрипции или обратной транскрипции, называются ретротранспозонами. Они содержат центральный сегмент, кодирующий среди других белков обратную транскриптазу. У некоторых ретротранспозонов, называемых здесь транспозонами класса I, этот центральный сегмент окружен длинными концевыми повторами (LTR). У ретротранспозонов класса I на одном из концов имеются также короткие инвертированные повторы. По своей структуре, особенностям транскрипции и механизму транспозиции они напоминают ретровирусные провирусы. Отличие состоит в отсутствии жизнеспособных внеклеточных форм. Семейства ретротранспозонов обнаружены у разных беспозвоночных, в частности у дрожжей и Drosophila, а также у растений и некоторых млекопитающих. [c.228]

Типичные ретротранспозоны класса I состоят из центрального сегмента длиной несколько т.п.н. и фланкирующих его LTR длиной от сотен до тысяч пар оснований (рис. 10.27). Несколько пар оснований в начале и в конце каждого LTR также представляют собой инвертированные друг относительно друга повторы. Встраивание ретротранспозона в новый локус ДНК сопровождается дупликацией сайта-мишени, причем размер дуплицированного участка (но не его последовательность) для данного элемента всегда одинаков. Эти ретротранспозоны, как и все мобильные элементы, образуют в геномах мультисемейства. [c.249]

Как правило, ретротранспозоны класса I активно транскрибируются и транслируются, хотя в ходе развития и дифференцировки транскрипция обычно регулируется. Одни транскрипты намного короче полноразмерных элементов, другие начинаются в одном LTR и заканчиваются в другом, копируя весь элемент. Эти длинные транскрипты содержат на концах прямые повторы и являются промежуточными продуктами при транспозиции. По-видимому, они подвергаются обратной транскрипции аналогично транскрипции РНК ретровирусов, в резуль- [c.249]

Гены, кодирующие А-частицы. Последовательности, гибридизующиеся с РНК IAP, встречаются во всех хромосомах Mus mus ulus в 1000 диспергированных сайтах у других видов мышей в хромосомах присутствуют всего 20-25 копий, однако у сирийских хомячков-около 900 копий. Повторяющиеся единицы имеют длину 7,1 т.п.н., хотя встречаются и более короткие члены семейства. Как и все диспергированные повторяющиеся элементы, отдельные члены семейства отличаются друг от друга. У них имеется центральный участок, фланкированный LTR длиной 338 п.н.. каждый из которых в свою очередь имеет короткие концевые инвертированные повторы длиной 4 п.н. Таким образом, ДНК 1 АР-зто типичный ретротранспозон класса I (рис. 10.27). При его встраивании происходит дупликация сайта-мишени длиной 6 п. н. 5 -кон-цы длинных молекул РНК, обнаруженных в IAP, [c.259]

У всех исследованных ретровирусов и ретротранспозонов класса 1 дад или 0й0-подобные рамки считывания (ORF А) транслируются нормально, но затем часто происходит протеолиз с образованием разных продуктов. opia содержит только одну рамку считывания, и все белки (например, дад-подобный белок и обратная транскриптаза), по-видимому, представляют собой продукты пост-трансляционного процессинга. У других ретротранспозонов и многих ретровирусов дй -подобные и роЛрамки считывания перекрываются (рис. 10.36), но при этом используются разные наборы триплетов, как в случае Ту-элементов. Иногда трансляция, начинаясь с й -подобного участка, продолжается со сдвигом рамки считывания с образованием слитного белка, содержащего как дй -подобную, так и ро/-последовательности. Из этого белка в результате процессинга образуются отдельные белки. [c.261]

Общность свойств ретротранспозонов класса I и ретровирусов наводит на мысль о наличии у них общего предка. По-видимому, в ходе эволюции ретровирусы развились в жизнеспособные внеклеточные формы, а ретротранспозоны в исключительно внутриклеточные. Важны оба типа элементов, поскольку оба участвуют в передаче информации от РНК к геному, как это делают ретротранспо- [c.262]

Поскольку элементы класса II лишены LTR, их обратная транскрипция и транспозиция должны осуществляться с помощью механизмов, отличных от тех, которые используются ретровирусами и ретротранспозонами класса I. Как это происходит-пока неизвестно. Возможно, посредниками при транспозиции служат недавно обнаруженные кольцевые F- и LINE-1-ДНК. [c.267]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология