Повторы концевые

Полученное в п. 4 значение к. п. д. системы сравнивают со значением т]г.о, вычисленным в п. 2 на основе концевых температур. Если эти значения не совпадают с требуемой точностью, то необходимо изменить величину Ох и повторить расчет, начиная с п. 3. [c.39]

С ДЛИННЫМИ КОНЦЕВЫМИ ПОВТОРАМИ [c.227]

Иот, ограниченные длинными концевыми повторами (ДКП) [c.229]

Общая схема репликации двухнитевой аденовирусной ДНК представлена на рис. 138. К синтезированному в зараженной клетке вирус-специфическому терминальному белку (точнее — к его более крупному предшественнику) ковалентно присоединяется нуклеотид, и этот нуклеотид-белковый комплекс выполняет роль затравки. Синтез новой цепи может начаться на любом конце генома, так как в силу наличия инвертированных концевых повторов оба конца Молекулы аденовирусной ДНК идентичны. Синтез дочерней цепи сопровождается вытеснением одной из родительских цепей. После Полного вытеснения этой цепи высвобождается ее З -конец, к которому присоединяется новая нуклеотид-белковая затравка. Син-1 з комплементарной цепи происходит теперь на однонитевой матрице, т.е. по репарационному типу. Результат этих двух актов — синтеза с вытеснение.м на родительском дуплексе и репарационного синтеза на вытесненной цепи — полностью эквива- [c.267]

ДНК фага Т7 — линейная двухнитевая молекула ( 40 т. п. н.) с прямым концевым повтором длиной 160 нуклеотидов. Инициация раунда репликации происходит внутри молекулы — на расстоянии, примерно соответствующем 15 % длины генома от одного из концов, условно называемого левым. Здесь имеются промоторы, которые узнаются фагоспецифической ДНК-зависимой РНК-полимеразой. Без транскрипции этого оп-района раунд репликации не начинается. Скорее всего РНК, образующаяся при транскрипции с этих промоторов, непосредственно используется в качестве за- [c.277]

XI - повторы 1-го типа С-концевого домена [c.247]

XII - повторы 2-го типа С-концевого домена. [c.247]

Проводится обратный ход для суммирования расходов вдоль полученного дерева отыскивается ветвь г = (/ь /зЬ метка конца которой бу, = 1 от меток ее концевых узлов вычитается по 1 и на данной ветви назначается расход х,-, равный сосредоточенному расходу бу (с учетом его знака) в узле/2 далее к величине расхода в его начальном узле/1 добавляется х,- и т.д. - это повторяется для всех ветвей, пока не окажется равной единице метка выбранного корня /о. [c.187]

Метод Эдмана последовательной деградации пептидов и белков основан на реакции фенилизотиоцианата с концевой аминогруппой в щелочной среде, которая приводит сначала к образованию тиомочевинной метки концевой аминокислоты, последняя при действии СРзСООН отщепляется, в конечном счете, в виде замещенного фенилтиогидантоина, после чего полипептидная цепь белка укорачивается на один аминокислотный остаток. Далее этот процесс повторяется вновь [c.94]

Группа атомов, с помощью которой можно описать строение полимера, называется составным звеном. Составное звено, которое многократно повторяется, называют повторяющимся составным звеном а группы на концах цепи — концевыми группами. Молекула полимера, состоящая из повторяющихся составных звеньев и концевых групп, называется макромолекулой. [c.6]

Первая область состоит из двух повторяющихся последовательностей одна образована шестью аминокислотами и повторена 6 раз, а другая образована девятью аминокислотами, повторена дважды. Эти два типа последовательностей весьма отличны друг от друга. Последовательность из шести аминокислот почти полностью представлена полярными кислотами (пять из шести) и богата глицином (две из шести). Последовательность из девяти аминокислот включает четыре неполярных остатка из девяти (два тирозина и два пролина). Эти повторяющиеся последовательности отличаются от повторностей, выявленных у N-концевой половины цепи глиадинов [115, 45]. Из 40 последних С-кон-цевых аминокислот 31 относится к полярным. Два конца полипептидной цепи имеют поэтому полярный характер, четко выраженный по отношению ко всей цепи. Это контрастирует с зеином (запасной белок кукурузы), где в N- и С-концевых последовательностях обнаружено столько же полярных остатков, сколько и неполярных [4]. [c.212]

Наиболее успешным методом определения С-концевых остатков является не химический метод, а ферментативный. Селективное удаление С-концевого звена осуществляется при помощи фермента карбоксипептидазы (из поджелудочной железы), которая расщепляет лишь ту пептидную связь,которая расположена в а-положении к свободной а-карбоксильной группе в полипептид-ной цепи. Анализ можно повторить на укороченном пептиде с тем, чтобы идентифицировать новый С-концевой остаток и т. д. [c.1049]

Рис. 7.17. Схема, демонстрирующая циклические церестановки (цермутации) нуклеотидных последовательностей геномов в цо-цуляции фагов Т2. Каждая пермутация имеет концевой повтор. Концевые повторы не находят себе комплементарных партнеров и оказываются вне кольцевого дуплекса.

Тепловой насос на концевых продуктах может быть реадиао-ван по трем схемам (рис. 8.15). По первой схеме тенло передается циркулирующим теплоносителем, который испаряется в конденсаторе, отбирая тепло верхнего продукта, затем сжимается в компрессоре и при повышенной температуре поступает на обогрев кипятильника. После конденсации насосом перекачивается в конденсатор и цикл повторяется. [c.485]

Как будет видно из дальнейшего, особое значение для механизмов репликации линейных молекул ДНК имеет структура их Концевых участков. У линейных ДНК-геномов не бывает невыразительных концов. Соответствующие участки (рис. 134) могут иметь прямые концевые повторы длиной от сотни и более (например, ДНК фага Т7) до тысяч (Т-четные фаги и др.) пар нуклеотидов. При этом если у фага Т7 все геномные молекулы ДНК идентичны, то молекулы ДНК Т-четных фагов существенно различны, даже Когда они образованы в одной клетке, зараженной единственной фаговой частицей геномы Т-четных фагов (и ряда других вирусов) характеризуются так называемыми кольцевыми перестановками. Еще один вариант концевой структуры вирионных ДНК-ДУПлек-сов — липкие (т. е. взаимно комплементарные) однонитевые концы. Длина которых обычно находится между 10 и 20 нуклеотидами (фаги Р2, Р4), но может укорачиваться до одного нуклеотида (герпес-вирусы), если в этом случае вообще позволительно называть такие Концы липкими . [c.261]

Таким образом, один из З -концов вновь возникших дуплексов должен находиться в однонитевой форме. Поскольку молекула ДНК фага Т7 имеет прямой концевой повтор, однонитевые 3 -конць[ двух сестринских молекул должны быть взаимно комплемеЕнарны. Поэтому эти молекулы могут объединиться в дн.мер, мономерные составляющие части которого на первых порах удерживаются за счет взаимодействия между комплементарными последовательностями, а затем скрепляются ковалентно. Сходным образом репликация димерной молекулы может привести к возникновению тетрамера и т. д. [c.278]

Рис. 147, Схе.ма образования зрелых молекул ДНК фага Т4 (с кондевы. ги перестановками и прямыми концевыми повторами) из коикатемера-предшест-венника

Третье различие между системами репликации ДНК фагов Т4 и Т7 касается способа превращения конкатемера в зрелый мономерный геном. В первом случае длина сегмента ДНК, отрезаемого от конкатемера, задается не специфической нуклеотидной после-доватачьностью (как у Т7), а вместимостью фаговой головки кон-катемерная молекула ДНК начинает упаковываться в головку, а когда головка заполнится, активируется эндонуклеаза, которая отщепляет оставшийся снаружи участок молекулы. Поскольку в головку помещается сегмент ДНК, превышающий по своим размерам уникальную последовататьность вирусного генома, повторение актов упаковки и нарезания генерирует молекулы с кольцевыми перестановками и прямыми концевыми повторами (рис. 147). Отметим, что в фаговом геноме закодирован фермент, способствующий превращению разветвленных молек л ДНК в линейные. [c.280]

Удобно расчленить раунд репликации ДНК на три стадии 1) переход родительского генома в репликативную форму 2) собственно репликация репликативной формы и 3) переход репликативной формы в зрелый дочерний геном. Рассмотрим несколько вирусных систем, у которых синтез ДНК осуществляется при участии двухнитевых кольцевых молекул (рнс, 148), Такие кольца — репликативные формы — могут возникать несколькими способа.ми путем синтеза комплементарной цепи на однонитевой кольцевой матрице (фаг с( Х174), в результате спаривания липких концов, (фаги Р2, Р4), в результате сайт-специфической (фаг Р1) илн общей (фаг Р22) внутримолекулярной peкo.vlбинaцни. между концевыми повторами и т. д. Наконец, в форме двухнитевого кольца [c.280]

Не все детали приведенной схемы образования вирус-специфн ческой ДНК строго доказаны, и в дальнейшем в нее, возможно, будут внесены те или иные поправки. Тем не менее эта схема достаточно хорошо иллюстрирует общий принцип. Весьма важно, что схема объясняет одну чрезвычайно существенную особенность структуры вирус-специфических ДНК ретровирусов — молекулы вирусных ДНК длиннее молекул вирусных РНК, которые послужили матрицей для обратной транскрипции. Действительно, к 5 -концу (-f)uenH вирусной ДНК добавилась последовательность иЗ, а к З -концу этой цепи — последовательность u5. В результате на концах молекулы вирус-специфической ДНК появился длинный (несколько сотен нуклеотидов) концевой повтор (ДКП, или LTR), имеющий структуру иЗгиЬ (рис. 160). [c.312]

Другой вариант образования субгеномных мРНК реализуется у коронавирусов. В зараженной клетке поми.мо геномной РНК синтезируется шесть классов субгеномных мРНК. Нуклеотидные последовательности всех этих (+)РНК идентичны не только на З -конце, но и на 5 -конце. Объясняется это следующим образом (рис. 168). Как и в других системах, сначала с геномной РНК считывается (—)нить. Синтез всех (+)це-пей начинается на З -конце (—)матрицы . Однако связь между синтезируемой (- -) нитью и матричной (—)ни-тью весьма слаба. После образования 5 -концевого лидерного сегмента (-Ь)нити длиной около 70 нуклеотидов этот лидер имеет высокий шанс отделиться от матрицы. В дальнейшем он опять взаимодействует с той же или другой молекулой (—)РНК- Однако, поскольку в матрице имеются характерные прямые повторы, З -конец лидерного сегмента может присоединиться либо к тому месту, от- [c.322]

Подвижные элементы с длинными концевыми повторами (ретро-транспозоны) 227 -3. Мобильныеэлементы, ограниченные инвертированными повторами 231 Литература 233 [c.353]

УкрНИИСПом и коллективам Андрушевского спиртового комбината разработан более простой вариант бродильной батареи. Особенности его следующие заполнение суслом с дрожжами от головного до концевого аппарата батареи и освобождение зрелой бражки от концевого до головного аппарата этой же батареи, затем все эти операции повторяются, т. е. направление движения бражки по батарее изменяется после каждой стерилизации первый и,последний аппараты батареи поочередно станов5 ся головными, и их изготовляют более высокими обычная система переточных тру4 заменена более совершенной устранены верхний распре- [c.274]

Часто в таком взаимодействии существенным оказывается только соприкосновение с коротким — олигосахарид-ным — концевым участком, а не со всей макромолекулой в целом. Поэтому олигосахариды, структура которых повторяет структуру такого концевого участка большой молекулы, с большой полнотой моделируют многие биологические свойства самого биополимера. Отсюда становится понятным, что синтезу олигосахаридов исследователи уделяют большее внимание, причем интерес к этой проблеме особенно обострился в самые последние годы в связи со значительным прогрессом в познании биологических функций полисахар д 1ых структур. В результате во всей проблеме гликозидного синтеза синтез олигосахаридов сейчас прочно занимает центральное положение. [c.132]

Обычно IS-элементы встраиваются (интегрируют) в разл. места бактериального генома, однако нек-рые участки оказываются более предпочтительными, чем другие. Встраивание и исключение этих элементов происходит с высокой точностью, что свидетельствует об участии в зтих процессах ферментов, узнающих инвертир. концевые повторы IS-эле-ментов. [c.79]

Церулеин по сравнению с брадикинином снижает артериальное давление на более долгое время, однако вызывает более слабые сокращения гладких мышц. Имея похожую структуру с гормоном желудочно-кишечного ракта холецистокининпанкреозимином (разд. 2.3.1.12), церулеин обладает и похожей биологической активностью. Сверх того, оба пептида церулеин и фил-лоцерулеин совпадают в С-концевом участке с гастрином. Филлоцерулеин в более слабой форме повторяет спектр активностей церулеина. [c.284]

Начиная с 9-й или 10-й аминокислоты, эта обобщенная последовательность напоминает о повторах, которые встречаются в блоках у а-, у- и uJ-глиадинов, где связаны 3 или 4 глутамина и один пролин. Однако рассматриваемая в совокупности, N-koh-цевая последовательность субъединиц глиадинов с высокой молекулярной массой не идентична ни одной из N-концевых последовательностей известных глиадинов. Глиадины с высокой молеку- [c.209]

Другой метод определения Ы-концевых групп (разработанный в 1950 г. П. Эдманом в Университете Лунда, Швеция) основан на реакции между аминогруппой и фенилизотиоцианатом, приводящей к образованию замещенной мочевины (ср. разд. 29.14). Гидролиз соляной кислотой в мягких условиях селективно удаляет Ы-концевой остаток в виде фенилтиогидантоина, который затем идентифицируют. Большое преимущество этого метода состоит в том, что он не затрагивает остальной части пептида поэтому анализ можно вновь повторить и идентифицировать при этом следующую концевую группу в укороченном пептиде. В идеале этот метод можно использовать многократно до полного определения всей последовательности звеньев, аминокислота за аминокисло той однако на практике это оказывается неосуществимым. [c.1049]

Бактериальные IS-э. eмeнты — это сегменты ДНК. способные как целое перемещаться с од него места локализации на другое (а). 15-элементы (б), как правило, кодируют белок (белки),, необходимы для их перемещения (транспозиции). По концам элемента расположены инвертированные повторы. необходимые для его транспозиции. разных 18-эле.ментов длина концевых повторов варьирует от 8 до 40 п. н. Повторы. югут быть совершенными или несовершенными. При встраивании в новый участок локализации 18-элементы вызывают небольшую дупликацию ДИК-мишени. часто 5 или 9 п, о Дуплицированные последовательности окружают 15-эле.мент на новом месте с дв х сторон. Разные 18-элементы и.меют длину от 750 до 1600 п. о.] [c.112]

Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот (1990) -- [ c.261 , c.262 , c.267 , c.277 , c.278 , c.280 , c.309 , c.311 ]

Молекулярная биология (1990) -- [ c.261 , c.262 , c.267 , c.277 , c.278 , c.280 , c.309 , c.311 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология