Момани

К интересному заключению, противоречащему начинающему складываться представлению об актуальной для проявления опиоидной активности конформации Met-энкефалина, пришел в результате теоретического анализа природной молекулы и ее аналогов Ф. Момани [182]. Биологические испытания [D-Ala ]- и [0-А1а ]-аналогов Met-энкефалина показали, что активность первого соединения в несколько раз выше, чем у природного нейропептида, а у второго - практически отсутствует [183-185]. Если установленная экспериментально [129, 133, 145, 168] и рассчитанная априорно [181] глобальная конформация шейпа действительно Ответственна за взаимодействие с опиатным рецептором, то замена Gly [c.347]

Более прецизионный конформационный анализ энкефалина осуществлен С.Г. Галактионовым и соавт. [48]. Начальные значения углов внутреннего вращения ф, у основной цепи были взяты из расчета соответствующих монопептидов. Предварительная оценка подвижности основной цепи проводилась путем анализа модельного тетрапептида Ala-GIy-Gly-Ala положения боковых цепей Туг и Phe находились из расчета трипептидных фрагментов Tyr -Gly , Gly -Phe и Gly--Met . После минимизации энергии по всем двугранным углам ф, у и х получено около 20 структурных вариантов с величинами С/общ < 7,0 ккал/моль. Было показано, что глобальная конформация В111НВВ21В322 имеет основную цепь шейпа jfee с поворотом на участке Gly -Gly и сближенными N- и С-концевыми остатками. Многие низкоэнергетические конформационные состояния обладали формой пептидной цепи свернутого типа с эффективно взаимодействующими ионогенными группами Туг и Met . Ф. Момани [182] в расчете Ме1-энкефалина отмечает высокую чувствительность конформационной энергии к величинам зарядов концевых групп. Однако полученные им результаты не согласуются с данными других авторов. Так, лучшая из рассчитанных Момани для свободной молекулы гормона структура не входила в наборы предпочтительных конформаций, найденных Де-Коэном и соавт. [167, 180] и Галактионовым и соавт. [48]. Структура с B-H-R-B-B-формой основной цепи, предложенная Шерагой и соавт. [181], попадала в число низкоэнергетических конформационных вариантов, полученных другими авторами, проигрывая глобальным конформациям 1,0 ккал/моль [167, 180] и 5,8 ккал/моль [48]. [c.393]

Конформационный анализ циклического декапептида грамицидина S проводился рядом исследователей [292-297]. В табл. III.35 значения двугранных углов ф, у основной цепи молекулы, рассчитанные М. Дигертом и соавт. [292], П. Де Сантисом и А. Ликвори [294], Ф. Момани и соавт. [296], Р. Скоттом и соавт. [297], сопоставлены с результатами исследований спектров ЯМР, КД, ИК [298, 299] и данными рентгеноструктурного анализа [300]. За одним исключением [296], между теоретическими и экспериментальными моделями нет значительных различий. И те и другие привели к структуре грамицидина S, состоящей из двух (3-складчатых листов, соединенных двумя (3-изгибами и скрепленных четырьмя поперечными водородными связями. По форме основной цепи приведенные в табл. Ш.35 конформации находятся в удовлетворительном согласии с кристаллической структурой гидратированного комплекса грамицидина S с мочевиной [301], а также данными двумерной ЯМР-спектроскопии [302]. [c.395]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология