Кислотный гидролиз РНК и изомеризация фосфодиэфирных связей

Кислотный гидролиз РНК и изомеризация фосфодиэфирных связей [c.562]

Механизм кислотного гидролиза РНК в основных чертах сходен с механизмом расщепления РНК под действием оснований, одновременно с которым он и был предложен Как расщепление, так и изомеризация фосфодиэфирной связи происходят вследствие нуклеофильной атаки ОН-группы при С-2 (остатки рибозы) по атому фосфора соседней З -фосфодиэфирной группировки. Недиссоциированная гидроксильная группа при С-2 является довольно слабым нуклеофильным агентом. Однако в условиях кислотного гидролиза (при pH 1 или ниже) диссоциация межнуклеотидных фосфатных групп в РНК по свободной гидроксильной группе в значительной степени подавлена, так как их р/(а лел ат [c.563]

Особенностью гидролиза фосфодиэфирных связей РНК в кислой среде является то, что одновременно с ним протекает изомеризация фосфодиэфирных связей и, кроме того, изомеризация фосфомоноэфирных связей в 2 - и З -моионуклеотидах Все три реакции протекают по одному и тому же механизму и обусловлены участием ОН-группы при С-2 остатка рибозы в этих процессах. Такой вывод был сделан на основании изучения превращений, которым подвергаются в кислой среде фосфомоно- и фосфодиэфиры, имеющие оксигруппу в а-положении к фосфоэфирной связи Так, было показано, что под действием кислот происходит миграция фосфатной группы в глицерофосфатах При частичном кислотном гидролизе цитидин-З -бензилфосфата среди продуктов реакции был обнаружен цитидин-2 -бензилфосфат [c.563]

Поскольку изомеризация фосфодиэфирных связей в кислой среде протекает одновременно с их гидpOv изoм и, возможно, через один и тот же промежуточный продукт, зависимость скорости обоих процессов от природы составляющих оснований одинакова, что было показано изучением продуктов неполного кислотного гидролиза ряда динуклеозидмонофосфатов [c.566]

Изомеризация и гидролиз фосфодиэфирных связей являются нежелательными побочными процессами, которые могут происходить при кислотной обработке РНК или олигонуклеотидов, например при раскрытии концевых 2, З -циклофосфатных группировок в олигонуклеотидах (см. стр. 547). В условиях, обычно применяемых для расщепления 2, 3 -циклофосфатных группировок (0,1 н. соляная кислота при комнатной температуре в течение 4 ч), изомеризация фосфодиэфирных связей проходит, по-видимому, лишь в незначительной степени 59, хотя процент расщепления фосфодиэфирных связей при этом довольно велик. Предпочтительнее использовать более кратковременную кислотную обработку. [c.567]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология