Геометрия молекул основные черты

Если задана определенная структура молекуЛь , то ряд ее свойств обнаруживает кодовые признаки частоты в спектрах поглощения, ориентация при адсорбции и т. п. имеют кодовый характер. Однако скорость, с которой молекула распадается, будет определяться типом структуры лишь до тех пор, пока сохраняются основные черты организации. Чем значительнее изменение структуры, которое происходит в результате химической реакции, тем труднее обнаружить связь между скоростью реакции и характеристиками исходного вещества. Эти характеристики обычно представляют собой термодинамические константы, в слабой степени отражающие геометрию молекулы. Соответствие между скоростью изменения состояния и типом организации (т. е. величиной кодовой природы) можно обнаружить лишь при условия, что процесс почти не затрагивает основного каркаса молекулы. [c.95]

ОСНОВНЫЕ ЧЕРТЫ ГЕОМЕТРИИ ОРГАНИЧЕСКИХ МОЛЕКУЛ [c.11]

Во второй работе [50] был изучен оксигемоглобин. Последний имеет орторомбическую пространственную ячейку. Рассчитывались проекции Паттерсона и сравнивались с аналогичными данными для гемоглобина. Между обеими системами были найдены общие черты, которые позволяют судить об ориентации молекул в кристалле, считая, что в основном геометрия обеих молекул одинаковая. [c.340]

У эукариот эизимология репликации ДНК пока еще детально не изучена, главным образом потому, что получать здесь необходимые мутантные формы гораздо труднее. Однако схема репликации у прокариот и эукариот в основных чертах, включая геометрию репликационной вилки и потребность в РНК-затравке, по-видимому, одинакова. Главное различие заключается в том, что у эукариот ДНК реплицируется не как таковая, а в виде хроматина, в котором она прочно связана с белками, принадлежащими к классу гистонов. В гл. 8 мы узнаем, что гистоны образуют комплексы в форме дисков, вокруг которых обвивается эукариотическая ДНК, в результате чего возникают регулярно повторяющиеся структуры, называемые нуклеосомами. Нуклеосомы располагаются вдоль молекулы ДНК с интервалами 200 нар оснований. Быть может, именно этим объясняется тот факт, что новые фрагменты отстающей цепи ДНК закладываются у эукариот с интервалами в 10 раз более короткими (от 100 до 200 нуклеотидов), чем у бактерий (от 1000 до 2000 нуклеотидов). Кроме того, если нуклеотиды служат барьерами, на время останавливающими продвижение ДНК-полимеразы. присутствие хроматина (а не голой ДНК) может, вероятно, объяснить и то, что репликапионные вилки движутся у эукариот приблизительно в 10 раз медленнее, чем у бактерий. [c.299]

Пятикоординационная сурьма обычно имеет тригонально-бипирамидальную координацию. Как уже отмечено выше (см. стр. 96), основные особенности геометрии тригонально-бипира-мидальных молекул хорошо объясняются теорией отталкивания электронных пар. Наиболее характерной чертой является расположение более электроотрицательных заместителей в аксиальных положениях. Такое строение имеют молекулы КзМХ2 и К4МХ, основные геометрические параметры которых приведены в табл. 31. [c.147]

Для всех эмпирических методов предсказания регулярных форм основной цепи на локальных участках аминокислотной последовательности, образования из этих форм супервторичных структур, доменов и трехмерных структур белковых молекул (с момента их появления и по сегодняшний день) характерны следующие черты принципиального порядка. Прежде всего, в основе всех исследований этого направления лежит конформационная концепция Полинга и Кори, согласно которой трехмерная структура белка представляет собой ансамбль регулярных, вторичных структур. Единство эмпирических методов предсказания по отношеш1ю к этой концепции неизбежно, поскольку в противном случае становится бесперспективным поиск эмпирических корреляций. Очевидно, если пространственное строение сложных макромолекул состоит не из отдельных немногочисленных стандартных блоков, а включает неограниченное количество разнообразных нерегулярных структурных сегментов, то нельзя рассчитывать на его описание с помощью простых правил, выведенных путем статистической обработки экспериментального материала, всегда крайне ограниченного в решении данной задачи. В первых работах предполагалось, что пространственное строение глобулярных белков почти сплошь состоит из вторичной структуры одного типа — а-спирали. Позднее к вторичным структурам был отнесен -складчатый лист, а затем -изгиб и недавно Q-петли. Привлечение последних двух означало принципиальный отход от строгого определения понятия вторичной структуры, так как -изгиб и Q-петли не являются регулярными формами. Кроме того, их идентификация отличается от идентификации а-спиралей и -структур по получаемой при этом информации о структуре белка. Если предсказание регулярной структуры в идеале означает определение на отдельном участке белковой цепи конформационных состояний составляющих его остатков, точнее, геометрии основной цепи участка, то предсказание изгибов и петель даже в идеале означает лишь утверждение об изменении направления цепи, причем, если это касается -изгибов, даже не на 180°, а лишь на угол больше 90° для петель и такое ограничение отсутствует. Это связано с тем, что -изгибы и Q-петли могут быть реализованы путем практически неограниченного количества различных форм основной цепи, а каждая форма — набором большого числа конформационных состояний остатков. Излишне говорить, что между -изгибами и 0-петлями нет четких границ. [c.328]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология