Репликативная транспозиция

Рис. 80. Механизм генетической нестабильности, вызываемой мобильными элементами [При попытке мобильного элемента осуществить репликативную транспозицию а пределах того же репликона. где он находитсн, возникают делеции (слева) или инверсии (справа)]

Рис. 77. Механизм репликативной транспозиция

Перемещение по крайней мере некоторых транспозонов и IS-элементов происходит путем их вырезания с места старой локализации с последующим встраивание.ч в какое-нибудь другое место того же или нового репликона. Такой механизм называется консервативным в отличие от полу-консервативной репликативной транспозиции. В принципе консервативная транспозиция может происходить при незначительной модификации уже описанной схемы, показанной на рис. 77. Действительно, если после образования промежуточной структуры, в которой концы транспозона объединены с концами ДНК-мишени (рис. [c.118]

Репликация ДНК транспозона с последующей транспозицией — репликативная транспозиция. [c.341]

Описанный механизм перемещения называется репликативной транспозицией. Наряду с ним существует способ транспозиции, предполагающий вышепление (эксцизию) перемещающегося элемента из молекул-донора и внедрение его (инсерцию) в молекулу-реципиент. Этот механизм получил наименование консервативной транспозиции. Очевидно, что фаг Ми или транспозон Тп916, первоначально проникающие в клетку в виде линейных молекул ДНК, должны включиться в хромосому в результате простой инсерции. По-видимому, в зависимости от условий один и тот же перемещающийся элемент может использовать, как [c.108]

При попытке мобильного элемента осуществить репликативную транспозицию в пределах того же репликона, где он находится, возникают делеции (слева) или инверсии (справа)] [c.121]

Эксцизия предсуществующего транспозона с переносом на новое место — не репликативная транспозиция. [c.341]

Необычной особенностью репликации ДНК фага Ми является то, что, во-первых, все вновь синтезированные копии фагового генома оказываются в состоянии профага (т. е. включены в клеточную хромосому) и, во-вторых, фагоспецифическая последовательность нуклеотидов, которая послужила матрицей для образования дочерних геномов, остается в клеточной хромосоме на том же месте, где она находилась до репликации. Другими словами, репликация идет без выщепления резидентного профага и, по существу, представляет собой репликативную транспозицию. Вероятная схема этого процесса представлена на рис. 152. Фагоспецифические белки обеспечивают сближение концов профага, интегрированного в клеточную хромосому (аналогично тому, как они это делают с проникшей в клетку молекулой ДНК фага). Участок хромосомы, в котором сближены концы прсфага, контактирует с другим участком этой же хромосомы или с какой-либо другой находящейся в клетке молекулой ДНК. В этом свежем участке появляется ступенчатый разрыв (два однонитевых разрыва на расстоянии 5 п. н.) возникают однонитевые разрывы и по обеим границам резидентного профага. Выступающие 5 -концы клеточной ДНК соединяются с З -концами вирус-специфических последовательностей, а З -концы клеточной ДНК выполняют роль затравки. Таким образом, инициация раунда репликации представляет собой в этом случае вариант рекомбинационной инициации- В результате Полуконсервативной репликации и последующих процессов репарации в клеточной хромосоме оказывается две копии профага в каждой из них одна чз цепей пронсходнт из резидентного профага, а вторая синтезирована заново. При повторении этого процесса Количество профагов в клеточной хромосоме может достигать сотни. [c.287]

Репликативная транспозиция в другие геномные сайты, зависящая от функций генов Ли В [c.233]

Репликативная транспозиция ТпЗ путем образования и диссоциации коинтеграта. Показаны дупликации сайта-мишени только у донора. [c.235]

Ммекулярный механизм транспозиции может быть различным у разных мобильных элементов, поэто.му лучше всего рассмотреть его на конкретных примерах. Достаточно изучен в этом отношении бактериофаг Ми, являющийся, по сути дела, необычным транспозо-ном. Этот умеренный бактериофаг встраивается в произвольный, участок хро.чосомы бактерии-хозяина. Если происходит индукция профага и начинается его вегетативное развитие, то он размножается, не вырезаясь из хромосомы, за счет повторных актов репликативной транспозиции. Вырезание фаговой ДНК из бактериальной происходит лишь при упаковке в фаговые частицы, когда репликация уже прошла. При репликации фага Л и транспозиция происходит с очень высокой частотой, поэтому именно эта система изучена лучше других. [c.115]

Вначале моделируется накопление ПП в геноме за время эволшии Т. При этом через заданный интервал г осуществляется процедура имитации эволюции, заключающаяся в моделировании процессов репликативной транспозиции, выщепления и мутирования с заданными частотами х, м и V, соответственно. При мутировании фиксируются только те замены, которые попадают в промоторный участок. В целом, осуществляется к = Т/х тактов имитадаонного эволюционного процесса. [c.69]

Рассмотрим расстояния между вершинами т , и т . Ясно, что, например расстояние пропорционально длительности временного интервала между тгисими двумя событиями, как репликативная транспозиция ПП 1, приведшая к возникновению [c.71]

ПП 5, и следущая по очередности репликативная транспозиция ПП 1, в результате которой образовался ПП номер 3. Чем больше частота репликативной транспозиции х, тем меньший временной интервал должен разделять последовательные транспозиции одной и той же ПП. Поэтому величину т , являпцуюся средним значением длин т , и т , можно считать обратногфопор-циональной частоте транспозиции х. [c.72]

Принимая во внимание, что значения коэффициентов о, э гут сложным образом зависеть от конкретной структуры дерева я, вообще говоря, не известны, можно использовать описанную выше имитационную модель (2.2) для оценки значений коэффициентов о. Э и гфоверки возможности определения скоростей репликативной транспозиции и выиепления. [c.73]

У транспозонов, перемещаю, щихся с помощью репликативной транспозиции, образование коинтеграта является промежуточной стадией реакции (см. рис. 77). Конитег-раты разрезаются с помощью сайт-специфической рекомби, нации между двумя ген-сайтами. осуществляемой резолвазой] [c.118]

Транспозоны, повсеместно распространенные в живой природе, являются мобильными генетическими элементами, обладающими способностью перемещаться из одной части генома в другую путем вырезания и последующей интеграции по механизму, независимому от гомологичной рекомбинации. Отдельные представители этого обширного семейства мобильных генетических элементов бактерий сильно различаются по своей структуре и механизмам внутригеномного перемещения. В настоящее время известно, по крайней мере, четыре механизма транспозиции [104]. При консервативной транспозиции транспозон вырезается из репликона-донора и в неизменном виде интегрируется в репликон-реципиент. Образовавшаяся в исходном репликоне брешь восстанавливается в результате репарации. Репликативная транспозиция характеризуется тем, что транспозон не вырезается из локуса, в котором он расположен. Вместо этого репли-кон-донор и репликон-реципиент образуют коинтеграт (объединяются друг с другом), в процессе формирования которого возникает вторая копия транспозона. Следующее за этим разрешение коинтеграта приводит к разделению репликонов, каждый из которых становится обладателем копии исходного транспозона. [c.78]

Этапы а—б—в г—д — репликативная транспозиция этапы а—б—е—е—ж — нерепликативная (консервативная) транспозиция. События представлены схематично на уровне взаимодействующих кольцевых ДНК и более детально — на уровне двух нитей взаимодействующих сайтов. Жирными линиями выделена донорная ДНК, тонкими — реципиентная ДНК. Транспозон в донорном сайте отмечен полузатемненной линией. Штриховкой обозначены вновь синтезированный транспозон (жирные черточки) и повторы ДНК-мишени (тонкие черточки). Стрелки указывают на места действия [c.40]

Известно два разных механизма транспозиции — репликативный и нерепликативный. При репликативной транспозиции одна копия транспозона передается в реципиентную ДНК, а другая сохраняется в исходном (донорном) сайте. При н е р е п -ликативной транспозиции транспозон обнаруживается только в реципиентной ДНК. [c.41]

Рис. 5-35. Репликативная и нерепликативная транспозиция подвижного элемента (задача 5-44). Подвижный элемент показан как гетеродуплекс, состоящий из двух генетически различающихся цепей-одна обозначена черным цветом, другая белым. В ходе репликативной транспозиции одна цепь остается в донорной ДНК, а другая переносится в ДНК реципиента. При нерепликативной транспозиции подвижный элемент вырезается из донорной ДНК и переносится целиком в ДНК реципиента.

Справочник химика 21

Химия и химическая технология