Дигидроуридин конформация

Под действием пиримидил-РНК-азы расщепляются фосфодиэфирные связи, образованные производными уридина и цитидина, а также фосфодиэфиры некоторых редких компонентов РНК, в частности псевдоуридина, 5,6-дигидроуридина и риботимидина . Вопрос о влиянии пр ироды пиримидинового кольца нуклеозида на скорость реакции, катализируемой пиримидил-РНК-азой, рассмотрен в обзоре Витцеля °2 (см. также При расщеплении РНК под действием пиримидил-РНК-азы образуется смесь З -фосфатов пиримидиннуклеозидов и олигонуклеотидов, терминированных остатком пиримидин-З -фосфата. Скорость ферментативной реакции сильно зависит от природы отщепляющегося остатка и конформации полинуклеотида (см. стр. 291) можно осуществить специфическое частичное расщепление полинуклеотидов в условиях, когда скорость процесса уменьшена. [c.70]

Исключением из аналогии является, очевидно, лишь 5,6-дигидроуридин, в котором гетероциклическое основание должно иметь конформацию, заметно отличающуюся от плоской. На основании изучения спектров ЯМР для дигидроурацила 1 и его метильных производных (II, III) был сделан вывод о существовании этих соединений в конформации полукресла [c.125]

Увеличение угла вращения Фс, N приводит к уменьшению амплитуды положительного эффекта Коттона для соединения XVI с фиксированной сын-конформацией наблюдается большой отрицательный эффект Коттона, причем изменение знака эффекта Коттона не связано с изменением хромофора при переходе от уридина к 2-0-замещенным производным уридина, как это видно из значения амплитуды для 2-0-этил-2, 3 -0-изопропилиденуридина XVII. Эти данные ясно показывают, что для пиримидиновых нуклеозидов в растворе предпочтительной является анты-конформация, хотя вращение вокруг С-Г—Ы-гликозидной связи все же возможно это и приводит к уменьшению амплитуды эффекта Коттона по сравнению с соединениями с фиксированной конформацией. анты-Конфор-мация пиримидиновых нуклеозидов в растворах подтверждается и данными ЯМР. Это было показано для растворов ацетатов нуклеозидов в диметилсульфоксиде, где изменение химического сдвига протонов ацетильной группы при С-2 при переходе от производных уридина к производным 5,6-дигидроуридина указывает на заметное влияние магнитной анизотропии двойной связи и, следовательно, на сближенность в пространстве метильных протонов ацетильной группы при С-2 и двойной связи Изучение зависимости химического сдвига протона при С-6 пиримидинового кольца в нуклеозид-5 -фосфатах от pH указывает на пространственную близость фосфатной группы к этому протону, что возможно лишь при ангы-конформации [c.138]

Далее мы замечаем новые символы ф (пси), И, У-На- Это обозначения некоторых редко встречающихся нуклеотидов, в которые, как правило, входят незначительно изменен-Н1.1е общеизвестные основания, уже знакомые читателю. Так, греческой буквой принято обозначать псевдоуридин, буква И — условное обозначение для инозина, а У-На — это не что иное, как дигидроуридин — уридин, у которого на два атома водорода больше, чем обычно. Символ Ме тоже вряд ли вызовет затруднения он означает, что в молекуле имеется дополнительная метильная группа. В заключение следует еще сказать, что представленная на рис. 22 структура (конформация) — всего лишь один из трех возможных вариантов. [c.67]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология