Дигидроуридин

Дигидроуридин Риботимидин Псевдоуридин ид"ин) [c.99]

Определение структуры цитидина и уридина представляло некоторые трудности, так как, хотя результаты элементарного анализа указывали на присутствие в каждом из них остатка пентозы, они не давали обычных реакций, свойственных пентозам. Гликозидная природа этих веществ не могла быть доказана обычными методами, так как они устойчивы к гидролизу разбавленными кислотами, а при действии горячих концентрированных кислот разрушаются, выделяя некоторое количество углевода и образуя соединение, содержащее только пиримидиновую часть молекулы. О близком родстве между этими двумя нуклеозидамн свидетельствует то, что цитидин превращается в уридин при дезаминировании азотистой кислотой [444]. Сам уридин при продолжительном воздействии концентрированной кислоты давал урацил и фурфурол (полученный из пентозного остатка). Данные, подтверждающие, что уридин является О-рибозидом урацила, были получены обработкой его бромистоводородной кислотой и бромом, в результате чего образовывались О-рибоновая кислота и 5-бромурацил, а также каталитическим гидрированием его в дигидроуридин, который мог быть гидролизован обычным путем в О-рибозу и 4,5-дигидроурацил [418]. Сделанное на основании различных данных предположение о том, что углеводный остаток в уридине (а следовательно, и в цити-дине) расположен у атома N-3, было подтверждено Левиным и Типсоном [445], синтезировавшими Ы-метилуридин и показавшими, что при полном гидролизе этого соединения образуется 1-метилурацил. Фуранозная природа рибозы в уридине была доказана метилированием и последующим окислением [446] то, что гликозидная связь имеет Р-конфигурацию, было установлено Давол- [c.256]

Значительно большей деградации могут подвергаться некоторые редкие компоненты нуклеиновых кислот. Дигидроуридин, например, разрушается в обычных условиях щелочного гидролиза РНК (см. стр. 456). [c.59]

Первым выделенным мононуклеотидом была инозиновая кислота (IMP, 9), которая была получена из гидролизата мяса Либихом в 1847 г. примерно за 20 лет до выделения нуклеиновых кислот из гнойных клеток Мишером. Взаимосвязь между мононуклеотидами и нуклеиновыми кислотами стала понятна в первой половине двадцатого столетия главным образом в результате работ Левина и др. [6]. Инозиновая кислота не является широкораспространенным в природе нуклеотидом она образовалась в процессе выделения по Либиху за счет дезаминирования АМР, который сам по себе был выделен из мышц лишь в 1927 г. Были выделены все обычные нуклеотиды аденина, цитозина, гуанина, тимина н урацила, так же как и многие минорные нуклеотиды, например, образуюш,иеся из псевдоуридина, дигидроуридина и метилированных производных аденозина и гуанозина. [c.134]

Возможно существование и другого пути биосинтеза пиримидинов, проходящего через карбомоил- -аланин, соответствующие рибонуклеозид и рибонуклеотид и затем дигидроуридин-5 -фосфат [59] в этом случае оротовая кислота не принимает участия в образовании пиримидинового кольца. [c.179]

Помимо псевдоуридина, инозина (И), представляющего собой нуклеозид гипоксантина (см. фиг. 45), дигидроуридина (УНг) и различных N-moho-и диметилпроизводных, встречаются также 0-метильные производные и 6-аминоизопентениладенозин. Структуры этих производных показаны на фиг. 58. Их биологические функции рассмотрены в гл. XXI. [c.159]

Под действием пиримидил-РНК-азы расщепляются фосфодиэфирные связи, образованные производными уридина и цитидина, а также фосфодиэфиры некоторых редких компонентов РНК, в частности псевдоуридина, 5,6-дигидроуридина и риботимидина . Вопрос о влиянии пр ироды пиримидинового кольца нуклеозида на скорость реакции, катализируемой пиримидил-РНК-азой, рассмотрен в обзоре Витцеля °2 (см. также При расщеплении РНК под действием пиримидил-РНК-азы образуется смесь З -фосфатов пиримидиннуклеозидов и олигонуклеотидов, терминированных остатком пиримидин-З -фосфата. Скорость ферментативной реакции сильно зависит от природы отщепляющегося остатка и конформации полинуклеотида (см. стр. 291) можно осуществить специфическое частичное расщепление полинуклеотидов в условиях, когда скорость процесса уменьшена. [c.70]

I— Ьметилинозин и — 5,6-дигидроуридин и-смесь уридина и 5,6-дигидроуридина. Выделены концевые группы и редкие нуклеотиды, использованные как опорные точки при реконструкции последовательности. [c.75]

Исключением из аналогии является, очевидно, лишь 5,6-дигидроуридин, в котором гетероциклическое основание должно иметь конформацию, заметно отличающуюся от плоской. На основании изучения спектров ЯМР для дигидроурацила 1 и его метильных производных (II, III) был сделан вывод о существовании этих соединений в конформации полукресла [c.125]

Увеличение угла вращения Фс, N приводит к уменьшению амплитуды положительного эффекта Коттона для соединения XVI с фиксированной сын-конформацией наблюдается большой отрицательный эффект Коттона, причем изменение знака эффекта Коттона не связано с изменением хромофора при переходе от уридина к 2-0-замещенным производным уридина, как это видно из значения амплитуды для 2-0-этил-2, 3 -0-изопропилиденуридина XVII. Эти данные ясно показывают, что для пиримидиновых нуклеозидов в растворе предпочтительной является анты-конформация, хотя вращение вокруг С-Г—Ы-гликозидной связи все же возможно это и приводит к уменьшению амплитуды эффекта Коттона по сравнению с соединениями с фиксированной конформацией. анты-Конфор-мация пиримидиновых нуклеозидов в растворах подтверждается и данными ЯМР. Это было показано для растворов ацетатов нуклеозидов в диметилсульфоксиде, где изменение химического сдвига протонов ацетильной группы при С-2 при переходе от производных уридина к производным 5,6-дигидроуридина указывает на заметное влияние магнитной анизотропии двойной связи и, следовательно, на сближенность в пространстве метильных протонов ацетильной группы при С-2 и двойной связи Изучение зависимости химического сдвига протона при С-6 пиримидинового кольца в нуклеозид-5 -фосфатах от pH указывает на пространственную близость фосфатной группы к этому протону, что возможно лишь при ангы-конформации [c.138]

Влияние насыщения связи С-5—С-6 в молекуле пиримидиновых оснований на таутомерное равновесие. В химии и биологии нуклеиновых кислот важную роль играет насыщение связи С-5—С-6 в молекуле пиримидиновых оснований, что происходит, например, при облучении нуклеиновых кислот УФ-светом (см. гл. 12), часто применяемом при функциональных и особенно при генетических исследованиях. Сравнение характеристических полос в ИК-спект-рах 5,6-дигидроуридина и 5,6-дигидротимидина с ИК-спектром 3-метил-5,6-дигидроуридина в ОгО дает следующую картину [c.174]

Довольно быстро обмениваются протоны при С-5 в 5,6-дигидропроизводных урацила. Так, за 18 ч при комнатной температуре в растворе D2O интенсивность сигнала в спектре ЯМР протонов при С-5 6-окси-5,6-дигидроуридин-5 -фосфата XIX значительно [c.327]

Взаимодействие редких нуклеозидов РНК с боргидридом натрия протекает в мягких условиях и может быть использовано для специфической модификации тРНК, поскольку уридин и цитидин не вступают в эту реакцию. При облучении УФ-светом уридин, однако, восстанавливается боргидридом натрия с образованием 5,6-дигидроуридина (см. стр. 636). [c.340]

Ари, UpG, UpdGpdGpU и олигоуридиловых кислотах, может быть прогидрирован до остатка 5,6-дигидроуридина 4. хотя реакция идет медленнее, чем для самого уридина, и в некоторых случаях возникают трудности, связанные с сильной адсорбцией вещества на катализаторе. В случае полинуклеотидов гидрирование уридиновых звеньев практически полностью ингибируется. Остатки уридина в полинуклеотидах тем не менее могут быть превращены в остатки [c.342]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология