Гетерологическая связь

Рассмотрим теперь гипотетический случай, когда протомер Р непрерывно синтезируется в клетке и сразу же распадается в результате параллельно протекающей метаболической реакции на неспособные к ассоциации продукты. При этом обе реакции сбалансированы таким образом, что стационарная концентрация протомера [Р] остается все время равной 10 М. Предположим, что значение К для единичного а/-взаи-модействия, приводящего к образованию димеров и тримеров (колец), равно 10 (или А(5 ° = —22,8 кДж моль ). Спрашивается чему будет равна концентрация димеров и тримерных колец в клетке в равновесии, если концентрация Р равна 10 М Используя уравнение (4-39), получаем, что концентрация димеров Ра равна Ю -(10"=) = 10 М. (Заметим, что при такой концентрации димеров концентрация составляющих их мономеров эквивалентна 2-10 М.) Концентрация колец, [Рз], равна (10 )3-( 10" ) = 10 М (концентрация соответствующих мономерных единиц эквивалентна З-Ю" М), Таким образом, 99,6% суммарного количества протомеров Р, присутствующих в клетке, будет входить в состав тримеров (10 =+0,2-10 +300-10 М), 0,33%—в состав мономеров и только 0,07% —в состав димеров. Следовательно, одновременное образование двух гетерологических связей, приводящее к замыканию кольца, делает реакцию ассоциации, описываемую уравнением [c.272]

Рассмотрим теперь количественные аспекты гетерологических взаимодействий, приводящих к образованию замкнутых колец. Пусть К — константа образования, а А0° — изменение стандартной свободной энергии для присоединения /-конца протомера Р к а-концу другого протомера Р, в результате чего образуется димер Ра [уравнение (4-39)]. На второй стадии присоединяется третий протомер. Заметим, что при этом возникают два новых а/-контакта, в связи с чем ДС для второй стадии равно 2ЛС°, а /Сг — К - Результирующая константа образования для процесса сборки тримера из трех протомеров и изменение свободной энергии равны [c.271]

Олигомеры, содержащие как гетерологические, так и изологические связи [c.284]

Если угол, образуемый двумя субъединицами при связывании а с /, несколько отличается от угла, соответствующего замкнутому кольцу, то образуется структура типа спирали, изображенная на рис. 4-6, Б. На один виток спирали может приходиться как целое число субъединиц, так и не целое (как в спиральной структуре, показанной на рисунке). Каждая последующая субъединица присоединяется к предыдущей за счет тех же гетерологических контактов типа aj, однако в этом случае могут иметь место и другие взаимодействия. Если поверхности субъединиц комплементарны и их геометрия благоприятствует образованию дополнительных контактов, то группы, расположенные в разных частях молекулы (например, Ь и к), могут соединиться друг с другом, образуя другую гетерологическую связь. Возможно образование и третьей гетерологической связи, с1, между двумя другими участками поверхностей субъединиц. Если контакты aj, bk и l достаточно прочны (т. е. если площади комплементарных поверхностей субъединиц достаточно велики, а сами поверхности высококомплементарны), то могут образовываться чрезвычайно прочные структуры из микротрубочек (например, жгутики у эукариот, рис. 1-5). Когда взаимодействия не столь сильны, то образуются часто обнаруживаемые в клетках лабильные структуры из микротрубочек, которые возникают и вновь распадаются. [c.273]

Если геометрия молекул соответствует схеме, показанной на рис. 4-6,Л, то к димеру может легко пристроиться третья субъединица и замкнуть кольцо с образованием тримера. В зависимости от геометрии субъединиц кольцо может быть меньшим (димер) или большим (тетрамер, пентамер и т. д.). Связь, в которой участвуют различные участки (а и /) субъединицы, иногда называют гетерологической [33]. Для образования замкнутого кольца, состоящего из нескольких субъеди- [c.270]

Изучение регуляции экспрессии генов гт имеет свою специфику, выражающуюся в том, что, как уже отмечалось, исследуемая проблема в основном решается применением методов генной инженерии — клонирования соответствующих генов. Учитывая тот факт, что таксономическая принадлежность реци-пиентных штаммов (в подавляющем большинстве случаев щтаммов Е. oli) и штаммов — источников донорной (клонируемой) ДНК зачастую отличается (см. разд. 5, часть II), экспрессия генов гш в таких случаях представляет вариант гетерологической экспрессии. Поэтому при интерпретации полученных результатов следует не упускать из виду, что формулируемые выводы относятся к регуляции экспрессии именно в новом для генов гт хозяине, а не к исходным клеткам (природном источнике клонированных генов). В связи с этим исследуемая проблема вынужденно во многом сводится к вопросам гетерологической, а учитывая специфику систем RM, и скоординированной экспрессии генов гт, что, понятно, не всегда отражает процессы происходящие в природном продуценте клонированных геиов. Эти замечания, очевидно, не относятся к переносу генов гт между штаммами одного вида. [c.104]

Неудача клонирования может быть связана и с отсутствием экспрессии клонированных генов rm. Гены рестрикции— модификации выявлены в самых различных таксонах (см. разд. 2, часть I). Клонирование их осуществляется практически исключительно в кишечную палочку. Имеющиеся сведения свидетельствуют, что в Е. oli удается клонировать гены rm из представителей таксонов генетически довольно отдаленных от кишечной палочки. Однако, вопрос о том все ли эти гены экспрессируются с собственных промоторов пока до конца де исследован. Методическое решение проблемы экспрессии видится в реализации нескольких подходов. В первую очередь следует обратить внимание на то, что большое число рестриктаз выявлено в штаммах, относящихся к семейству Enteroba teria-сеа (см. гл. 2, часть I) в которое входит и Е. oli. Учитывая большое генетическое родство между представителями энтеробактерий, следует предположить и меньшую вероятность получения отрицательных результатов по клонированию в кишечную палочку за счет барьера гетерологической экспрессии. [c.189]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология