Изолейцил-РНК-синтетаза

Это значит, что здесь фермент получает второй шанс дискриминировать аминоацильные остатки, теперь уже в виде их сложноэфирных производных, и в случае чужого остатка активирует молекулу воды, которая атакует сложноэфирную связь. Показано, что в активации такого гидролиза валил-тРНК изолейцил-тРНК-синтетазой существенную роль играет свободный З -гидроксил рибозы тРНК. [c.46]

По своей сути аффинная хроматография — идеальный метод для изучения взаимодействий в биохимических процессах. Иммобилизованная лейцил-тРНК-синтетаза использована как для выделения изолейцил-тРНК, так и для изучения взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой [10]. Взаимодействия пептидов с белками [12] и нуклеотидов с аминокислотами и пептидами [20] [c.17]

Затем изолейцил-тРНК-синтетаза начинает все сначала и образует правильный интермедиат изолейцил-АМР, который в свою очередь превращается в правильную изолейцил-тРНК Изолейцин ч- АТР Изолейцил-АМР + + РР, [c.933]

Таким образом, аминоацил-тРНК-синтетазы действительно играют важнейшую роль в процессе трансляции генетической информации, связывая определенные аминокислоты с соответствующими антикодонами. Кроме того, благодаря дополнительным контролирующим и корректирующим функциям эти ферменты обеспечивают высокую точность трансляции, всякий раз подвергая соответствие между антикодоном и аминокислотой по крайней мере еще одной дополнительной проверке. Так, если в приведенном выше примере частота ошибочной активации аминокислоты при действии изолейцил-тРНК-синтетазы составляет [c.42]

Другой интересный пример механизм отстройки изолейцил-тРНК синтетазы от вали-иа. На первый взгляд, он не согласуется с теорией, поскольку на первом этапе избирательность невелика, а на втором — гораздо выше, хотя по вьппеупомянутой теории он должен быть значительно ниже. Оказалось, что на втором этапе используются стерический механизм отбора (а ые qDaвнитeльпo маленькая ДДС метиленовой группы) он устроен так, что именно маленький валин легко отщепляется от аденилата и вываливается в раствор, а большой Пе должен для этого раздвинуть бе товый каркас, чгго требует активаций, как мы знаем, 7 ккал/моль (механизм был назван молекулярным ситом ). [c.43]

Рис. 4.12. Титрование активных центров изолейцил-тРНК—синтетазы с использованием только 10 мкг (100 пмоль) фермента (0,1 мл 1 мкМ раствора фермента). Последовательность реакций такова

Прочному связыванию метиленовых групп изолейцил- и ва-лил-тРНК—синтетазами способствует еще один фактор. В том случае, когда валин занимает центр связывания изолей-цил-тРНК—синтетазы, в образующемся комплексе остается незаполненная полость, которая была бы занята добавочной метиленовой группой изолейцина в случае его присоединения к ферменту. Ранее указывалось, что энергия дисперсионного взаимодействия метиленовой группы в кристаллическом углеводороде составляет 8,4 кДж-моль (2 ккал-моль ). Поскольку плотность упаковки белков такая же, как и плотность упаковки кристаллов [23], наличие полости добавляет к энергии гидрофобной связи метиленовой группы еще 8,4 кДж-моль . [c.288]

Гораздо труднее различить субстраты в реакциях, протекающих с участием аминоацил-тРНК—синтетаз — ферментов, которые должны с высокой точностью выбрать нужную аминокислоту. Два примера такого рода — конкуренция между валином и изолейцином за активный центр изолейцил-тРНК—синтетазы и между треонином и валином за активный центр ва-лил-тРНК—синтетазы (рис. 11.1). [c.329]

Рис. 11.1. Полость в активном центре изолейцил-тРНК — синтетазы способна связывать валин, поскольку она связывает больший по размеру изолейцин. Активный центр валил-тРНК — синтетазы не может отторгнуть треонин, так как он изостеричен валину.

Наиболее сложен процесс распознавания изолейцила и валина таким ферментом, как изолейцил-тРНК—синтетаза. Дело в том, что в Е.соИ содержание валина в пять раз превышает [c.337]

Урацил удаляется из молекулы ДНК с помощью урацилглико-зидазы, которая отщепляет это основание от сахарного кольца. Механизм действия данного фермента аналогичен механизму действия изолейцил-тРНК—синтетазы, гидролизующей Уа1-тРНК" . В обоих случаях гидролитический центр слишком мал, чтобы вместить субстрат, содержащий дополнительную метильную группу, благодаря чему этот субстрат остается неповрежденным. Коррекция при синтезе ДНК осуществляется [c.340]

Смотреть страницы где упоминается термин Изолейцил-РНК-синтетаза: [c.43] [c.345] [c.933] [c.933] [c.226] [c.491] [c.238] [c.42] [c.42] [c.42] [c.42] [c.42] [c.42] [c.100] [c.41] [c.282] [c.284] [c.336] [c.337] [c.338] [c.342] [c.141]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология