Сайты рестрикции симметричные

Ферменты, используемые для получения рекомбинантных молекул,— рестриктазы II типа. Основной характеристикой таких рестриктаз является то, что у них сайты узнавания и места рестрикции совпадают. Обычно рестриктаза II типа узнает определенную последовательность на ДНК и гидролизует ее внутри последовательности сайта рестрикции. Сайты рестрикции рестриктаз II типа представлены симметричными при повороте на 180° последовательностями — палиндромами [c.26]

Одна из наиболее часто возникающих проблем при анализе биологических текстов - поиск гомологий. И это понятно, поскольку схожесть текстов позволяет делать выводы об их эволюционной и/или функциональной близости. Здесь можно привести пример обнаруженной гомологии между определенными типами онкогенов и клеточными генами (НаЬагго et а1., 1984), что привело к возникновению нового направления исследований. Гомологии между последовательностями часто используют для реконструкции эволюционных деревьев. Такие важные аспекты анализа биологических текстов, как поиск повторов, палиндромов, симметричных участков, сайтов рестрикции, также связаны с проблемой поиска гомологий. Анализ гомологий необходим также при подготовке и проведении целого ряда экспериментальных работ, в частности при синтезе олигонуклеотидных зондов для поиска клонов в клонотеке, стыковке фрагментов нуклеотидных последовательностей при секвенировании протяженных участков ДНК или целых геномов и др. [c.11]

В приведенных примерах сайты расщепления совпадают с сайтами узнавания. Такие сайты называют еще сайтами рестрикции. Когда они представлены палиндромами, то на разных нитях ДНК гидролизуются связи, расположенные либо симметрично относительно центра палиндрома, либо в самом центре. Это позволяет предыдущие примеры записать в краткой форме 5 -С4ААТТС-3, 5 -СТССа4С-3 и 5 - iGGG-3, причем знаки 5 и З могуг опускаться. Знак 4 указывает на положение гидролизуемых связей, которое определяет число нуклеотидных звеньев в выступающих концах. Примеры возможных вариантов строения концов у фрагментов рестрицированной ДНК представлены в табл. 6.1. [c.167]

В этой работе использовался остроумный прием, позволяющий избежать образования побочных продуктов. Он заключался в синтезе симметричных димеров целевых блоков-д)ш-лексов. Центром симметрии в каждом сл)Д1ае выступали участки узнавания рестриктаз, имеющиеся в последовательности синтетического фрагмента. Это позволило устранить возможность образования неправильных комплексов благодаря запланированным самокомп-лементарным последовательностям половинных сайтов эндонуклеаз рестрикции. Целевые блоки-интермедиаты получали путем гидролиза соответствующими рестриктазами. [c.63]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология