Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ИЗ ФИКСИРОВАННЫХ ТКАНЕЙ

    Выделение риккетсий на культуре ткани. Клинический материал в объеме 0,5 мл смешивают с таким же количеством среды для культуры ткани и сразу же вносят в ячейки специальных планшетов или контейнеры, где предварительно выраш,ивают монослой соответствуюш,ей культуры клеток. Планшет центрифугируют в течение 1 ч при 700 g, после чего инокулюм удаляют, тщательно промывают ячейки с монослоем фосфатным буфером, вносят в них среду МЕМ с 10 % телячьей сыворотки крови и инкубируют при 34 °С в атмосфере 5 % СОз. Через 48 и 72 ч культуральную жидкость сливают, монослой промывают, фиксируют и окрашивают соответствующими люминесцирующими сыворотками (прямая РИФ) для обнаружения возбудителя в клетках монослоя. При люминесцентной микроскопии обнаружение четырех и более характерно светящихся микроорганизмов расценивается как положительный результат. Идентификацию выделенных риккетсий проводят также методом ПЦР с амплификацией генов, специфичных для риккетсий (например, гена цит-ратсинтазы, белка 17 кДа, ОтрВ — для определения родовой принадлежности, белка ОтрЛ — для выявления риккетсий сыпного тифа). [c.236]


Рис. 36.5. Блоттинг-перенос. По методу Саузерна тотальную ДНК, выделенную из культуры клеток или ткани, обрабатывают одной или несколькими рестриктазами и полученную смесь фрагментов подвергают электрофорезу в агарозном или полиакриламидном геле. ДНК, несущая отрицательный заряд, мигрирует к аноду. Небольшие фрагменты двигаются быстрее крупных. После окончания электрофореза разделенные фрагменты ДНК подвергают мягкой денатурации, инкубируя гель в растворе щелочи. На следующем этапе гель накладывают на нитроцеллюлозный фильтр. Фрагменты ДНК переносят на нитроцеллюлозу с помощью методических приемов, разработанных Саузерном, и фиксируют полученную нитроцеллюлозную реплику тепловой обработкой. Далее реплику инкубируют с меченым кДНК-зондом, гибридизую-щимся с соответствующим комплементарным фрагментом ДНК на нитроцеллюлозном фильтре. После интенсивной промывки фильтр помещают на рентгеновскую пленку. Фиксируемые на радиоавтографе сигналы соответствуют расположению фрагментов ДНК, комплементарных последовательности зонда. Метод Нозерн-блот (для анализа РНК) принципиально не отличается от метода переноса по Саузерну (Саузерн-блог анализа). Тотальную РНК подвергают электрофорезу. Сама процедура переноса РНК из геля на фильтр несколько отличается от метода Саузерна, поскольку молекулы РНК менее стабильны, чем молекулы ДНК. Метод Вестерн-блот применяется для выявления определенных белков с помощью Рис. 36.5. Блоттинг-перенос. По <a href="/info/1338361">методу Саузерна</a> тотальную ДНК, выделенную из культуры клеток или ткани, обрабатывают одной или несколькими рестриктазами и <a href="/info/157936">полученную смесь</a> фрагментов подвергают электрофорезу в агарозном или <a href="/info/105837">полиакриламидном геле</a>. ДНК, несущая <a href="/info/17611">отрицательный заряд</a>, мигрирует к аноду. Небольшие фрагменты <a href="/info/1796849">двигаются быстрее</a> крупных. <a href="/info/1092680">После окончания</a> <a href="/info/1339061">электрофореза разделенные фрагменты</a> ДНК подвергают мягкой денатурации, инкубируя гель в <a href="/info/122345">растворе щелочи</a>. На следующем этапе гель накладывают на <a href="/info/611044">нитроцеллюлозный фильтр</a>. Фрагменты ДНК переносят на нитроцеллюлозу с <a href="/info/572789">помощью методических</a> приемов, разработанных Саузерном, и фиксируют <a href="/info/1815996">полученную нитроцеллюлозную</a> реплику <a href="/info/431544">тепловой обработкой</a>. Далее реплику инкубируют с меченым кДНК-зондом, гибридизую-щимся с соответствующим <a href="/info/490410">комплементарным фрагментом</a> ДНК на <a href="/info/611044">нитроцеллюлозном фильтре</a>. После <a href="/info/1587091">интенсивной промывки фильтр</a> помещают на <a href="/info/140144">рентгеновскую пленку</a>. Фиксируемые на радиоавтографе сигналы <a href="/info/1284698">соответствуют расположению</a> фрагментов ДНК, <a href="/info/283297">комплементарных последовательности</a> зонда. Метод Нозерн-блот (для анализа РНК) принципиально не отличается от <a href="/info/30433">метода переноса</a> по Саузерну (Саузерн-блог анализа). Тотальную РНК подвергают электрофорезу. Сама процедура переноса РНК из геля на фильтр несколько отличается от <a href="/info/1338361">метода Саузерна</a>, поскольку молекулы РНК менее стабильны, чем молекулы ДНК. <a href="/info/1393097">Метод Вестерн</a>-блот применяется для выявления <a href="/info/102583">определенных белков</a> с помощью
    Ход работы. Крысу декапитируют, фиксируют на препаровальном столике и вскрывают брюшную полость. При помощи канюли, соединенной резиновой трубкой с делительной воронкой, заполненной охлажденной средой пер-фузионного раствора, печень перфузируют до полного удаления видимых следов крови в вытекающей из печени жидкости. Затем извлекают печень, вырезают участки соединительной ткани и после просушивания на фильтровальной бумаге измельчают материал ножницами и пропускают через размельчитель типа поршневой мясорубки. Полученную массу взвешивают и смешивают с пятикратным (по массе) избытком среды выделения. Материал гомогенизируют путем многократного перемещения тефлонового пестика сверху вниз и наоборот. [c.156]



Смотреть страницы где упоминается термин ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ИЗ ФИКСИРОВАННЫХ ТКАНЕЙ: [c.292]    [c.69]    [c.132]   
Смотреть главы в:

Подготовка биологического материала лдя молекулярно-генетических идентификационных исследований при массовом поступлении неопознанных тел -> ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ИЗ ФИКСИРОВАННЫХ ТКАНЕЙ




ПОИСК







© 2024 chem21.info Реклама на сайте