Условия возникновения ионных взаимодействий в белках

УСЛОВИЯ ВОЗНИКНОВЕНИЯ ИОННЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ в БЕЛКАХ [c.268]

Вирусы, как известно, построены из отдельных макромолекул, удерживаемых вместе в результате возникновения между ними ионных и гидрофобных взаимодействий и водородных связей с помощью различных агентов, ослабляющих эти взаимодействия или же разрывающих водородные связи, вирусы можно разложить на составляющие их элементы. Кроме того, в растительных, бактериальных и животных клетках, инфицированных многими просто устроенными вирусами, наблюдается образование не только полных вирусных частиц, но также и вирусоподобных образований, не содержащих нуклеиновой кислоты. Следовательно, форма этих частиц, будь они палочковидные или изометрические, определяется отнюдь не нуклеиновой кислотой, а характером специфической агрегации белковых молекул (см. гл. VIII, разд. Б). Поэтому есть все основания думать, что в определенных условиях вирусные белки могут агрегировать с образованием вирусоподобных частиц даже in vitro. Впервые эта особенность была обнаружена у белков ВТМ, выделенных из инфицированных клеток [495] и из вирусных частиц [423]. [c.215]

Приготовление пробы. По мнению Дэвиса [281], включение исследуемой пробы в стартовый гель препятствует тепловой конвекции диффузии веществ, что приводит к более эффективному разделению. Однако некоторые белки повреждаются в результате полимеризации геля [1407] или под действием флуоресценции [975]. Кроме того, белки могут подавлять полимеризацию геля [570]. Если есть подозрение, что флуоресценция или персульфат (см. ниже) приводят к возникновению артефактов, вместо стартового геля желательно использовать суспензию сефадекса 0-200, гл1ицв рин, сахарозу или мочевину. В то же время эти материалы сам и способны при определенных условиях стать причиной артефактов. Так, сефадекс 0-200 может задерж1И1вать движение белков [173], а сахароза — взаимодействовать с 8-аминогруппой лизина [455] или боратом с образованием отрицательно заряженного комплекса. Поэтому присутствие сахарозы в боратном буфере может привести к эффекту усеченного конуса и боковому распространению белков в процессе электрофореза [759]. С другой стороны, мочевина вызывает диссоциацию белков на субъединицы, препятствует затвердению агарозы в агарозно-полиакриламидных гелях [574] и влияет на активность водородных ионов. [c.97]

Характерной чертой активации Л -белка является наличие медленной стадии, которая проявляется в виде лаг-периодов на графиках накопления продукта реакции. Исследователи, пытаясь установить природу медленной кинетики, приходят к заключению, что основной вклад в нее вносят медленные изменения конформации Л/-белка или способа взаимодействия его субъединиц. Так, работы, проведенные в лабораториях Джилмана [14, 15], Шрамма [88], Нир [10] и других, показали, что активация индивидуальных фракций Л -белка гуаниловыми нуклеотидами или фторидом растянута во времени на десятки минут. В ходе реконструкции с каталитическим белком лимитирующей стадией является как раз активация Л -белка, а не процесс взаимодействия Л -белка с каталитическим или следующие за этим конформационные изменения каталитического белка [10, 88, 113]. Исходя из такого предположения, Бирнбаумер считает [114], что аденилатциклазу можно отнести к гистерезисным ферментам [115]. Однако возможно, что и другие медленные процессы, такие, как вытеснение эндогенного ГДФ из комплекса с Л -белком в эритроцитах индюка [95, 109], тоже имеют значение для возникновения лаг-периодов. Здесь следует отметить, что медленная стадия обычно находится под контролем гормона [92—95, 107, 116, 117] и ионов Mg + [118]. В определенных условиях она появляется при активации -фермента под действием ГТФ [118]. Длительность лаг-периода может зависеть от химического строения активирующего нуклеотида [56, 119]. [c.107]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология