Цитидин фосфат конформация

Сравним теперь конформацию цепи — Сз —Оз —Р—О—Н в молекулах аденозин-З -фосфата [31] и цитидин-З -фосфата [14] (рис. 7). Ориентация связей О3 —Рз и О/—Н в обоих [c.176]

Двугранный угол Сз —О3 — Р—О т в аденозин-З -фосфате равен—77° (гош), а в цитидин-3 -фосфате 4-171° транс). Таким образом, конформацию можно в первом случае представить как гош-гош, а во втором — как гош-транс. Оказалось, что структура всех фосфатных групп описывается одной 3 этих двух конформаций [31]. [c.176]

Рис. 7 [31]. Конформация ри-бофосфатных остатков а — цитидин-З -фосфат б — аденозин-З -фосфат

Под действием пиримидил-РНК-азы расщепляются фосфодиэфирные связи, образованные производными уридина и цитидина, а также фосфодиэфиры некоторых редких компонентов РНК, в частности псевдоуридина, 5,6-дигидроуридина и риботимидина . Вопрос о влиянии пр ироды пиримидинового кольца нуклеозида на скорость реакции, катализируемой пиримидил-РНК-азой, рассмотрен в обзоре Витцеля °2 (см. также При расщеплении РНК под действием пиримидил-РНК-азы образуется смесь З -фосфатов пиримидиннуклеозидов и олигонуклеотидов, терминированных остатком пиримидин-З -фосфата. Скорость ферментативной реакции сильно зависит от природы отщепляющегося остатка и конформации полинуклеотида (см. стр. 291) можно осуществить специфическое частичное расщепление полинуклеотидов в условиях, когда скорость процесса уменьшена. [c.70]

Экспериментальные данные, полученные с помощью рентгеноструктурного анализа, показывают, что остаток рибозы в нуклеозидах и нуклеотидах имеет обычно конформацию V . Такая конформация углеводного остатка была, например, показана рентгеноструктурным исследованием кристаллов цитидина уридина уридин-5 -фосфата аденозина и комплекса аденозин-5-бромуридин 5. Более точные рентгеноструктурные исследования (табл. 2.3) показывают, что наряду со значительным отклонением (0,5—0,6 А) З -углеродного атома остатка рибозы от плоскости кольца, соседний (С-2 ) углеродный атом также выведен из этой плоскости на 0,10—0,15 А в ту же самую или противоположную сторону. Остаток рибозы, таким образом, имеет при этом конформацию, промежуточную между идеализированными конформациями, рассмотренными выше. Так, конформация остатка рибозы в аденозин-З -фосфате является промежуточной между конформа-циями V и V (ближе к первой), а в аденозин-б -фосфате — между конформациями и Тг> [c.131]

В ряде случаев, однако, доказано существование и других конформаций рибозного остатка. Так, в случае цитидин-З -фосфата остаток сахара имеет конформацию, промежуточную между и Ту (ближе к первой), а для 5-бромуридина— конформацию Уг. [c.131]

Эти данные показывают, что конформацию 2 -дезоксиаденозина следует считать промежуточной между Уу- и Гу-конформациями конформацию тимидин-5 -фосфата — близкой к конформации аде-нозин-З -фосфата (промежуточная между У и У -конформация-ми), а 5-фтор-2 -дезоксиуридина — к конформации цитидин-З -фос-фата (промежуточная между У - и Гз -конформациями). В других исследованиях остатку 2 -дезоксирибозы приписана У -конфор-мация она обнаружена в 5-бром-2 -дезоксиуридине 5-иод-2 -дез-оксиуридине 2 и нуклеозидах, входящих в комплекс 2 -дезоксигуа-нозина с 5-бром-2 -дезоксицитидином [c.133]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология