Конформации олиго- и полипептидов

Книга во многом полемична. Так, в главе 18 рассматривается концепция Л.Б. Меклера о стереохимическом генетическом коде. Несмотря на то что прошло много лет с его первой публикации (а за ней были и другие), идеи Л.Б. Меклера, послужившие основанием для далеко идущих выводов, не получили прямого экспериментального развития. Излагая свой взгляд на причины такого положения, автор впервые дает критический анализ упомянутой концепции. В книге также ставятся под сомнение широко распространенные представления о роли водородных связей в формировании конформаций олиго- и полипептидов, отрицаются иерархичность структурной организации белков (от первичной структуры к вторичной, супервторичной, доменам и полной пространственной структуре) и целесообразность введения понятия "расплавленная глобула" для описания переходного состояния между нативным и денатурированным состоянием глобулярных белков. Несмотря на приводимую при этом весомую аргументацию, вряд ли перечисленные выводы будут легко приняты научной общественностью. Ответственный редактор надеется, что высказанные в томе положения будут замечены коллегами и вызовут дискуссию, которая пойдет на пользу науке. [c.5]

КОНФОРМАЦИИ ОЛИГО-И ПОЛИПЕПТИДОВ [c.93]

КОНФОРМАЦИИ олиго- и ПОЛИПЕПТИДОВ [c.379]

Недавно вышли из печати два превосходных обзора. Первый— большой обзор Рамачандрана и Сасисекхарана [19] — посвящен рассмотрению конформаций полипептидов и белков другой — Шерага [20] — посвящен исключительно расчетам конформаций олиго- и полипептидов. В этих обзорах детально рассмотрены достижения четырех теоретических групп, и потому задача автора в значительной мере облегчается. [c.94]

Критический анализ непрерывных потенциальных кривых невалентных взаимодействий в применении к полипептидам и полисахаридам содержится в работах индийской школы [37, 38] и в обзоре [19]. В расчетах конформаций олиго- и полипептидов использовались потенциалы Ликвори [5], Флори [6, 7, 39], Скотта и Шерага [40—42], Китайгородского [43, 44, 37] и Дашевского [45]. Укажем кратко методы, которые легли в основу оценки параметров потенциалов. [c.101]

Детальные описания указанных работ имеются в обзоре Рамачандрана и Сасисекхарана [16], посвященном рассмотрению конформаций пептидов и белков. Один из обзоров Шерага [17] охватывает расчеты конформаций олиго- и полипептидов, другой его обзор [18] посвящен анализу термодинамических свойств пептидов и белков в растворах и исследованию роли ближайших взаимодействий в определении нативной конформации белка. В обзоре автора [19, с. 93] рассмотрены более поздние достижения в расчетах конформаций пептидов и, в частности, работы,проведенные у нас в стране. [c.360]

В последующих главах рассматриваются результаты конформацион-1 0го анализа большой серии природных олигопептидов. Их пространст- енное строение практически полностью определяется взаимодействиями ежду близко расположенными в цепи остатками, и поэтому они представляют собой естественные объекты исследования средних взаимодействий. Здесь нельзя было ограничиться анализом единичных примеров в силу по крайней мере двух обстоятельств. Во-первых, изучение конформационных возможностей природных олигопептидов является, как станет ярно позднее, самым ответственным и сложным, но в то же время 1 иболее интересным этапом на пути к априорному расчету трехмерных структур белков. Очевидно, понимание пространственного строения и механизма спонтанной, быстрой и безошибочной укладки белковой последовательности в нативную конформацию невозможно без установления инципов пространственной организации эволюционно отобранных низко- лекулярных пептидов. Между природными олиго- и полипептидами нет четко очерченных границ, и количественная конформационная теория лее простых молекул является естественной составной частью конформационной теории более сложных соединений той же природы. Во-вторых, Й1ание пространственной организации и динамических конформационных свойств природных олигопептидов - гормонов, антибиотиков, токсинов и т.д. - необходимо -вакже для изучения молекулярных механизмов узнавания, действия и регуляции биосистем, выявления структурно-функциональных особенностей пептидов и белков. [c.233]

В регулярном полимере (например, поли-А) рибозно-фос-фатный стержень содержит уже пять независимых углов вращения, т. е. в дополнение к углам, рассмотренным Ромачанд-раном, необходимо включить еще и фь и фг. Эти углы появляются в динуклеозидфосфатах, и по этой причине разрешенные конформации полимера могут быть найдены из рассмотрения динуклеозидфосфатов (с аналогичной ситуацией мы встречаемся при исследовании олиго- и полипептидов — все основные закономерности следуют из анализа конформационных карт для дипептидов). [c.181]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология