Фактор терминации

В случае использования эукариотических 80S рибосом для трансляции в бесклеточной системе все соответствующие белковые факторы должны быть также эукариотического происхождения. Это два фактора элонгации EF-1 и EF-2 (вместо EF-Тц, ЕР-Т и EF-G), многочисленный набор факторов инициации (eIF-1, eIF-2, eIF-3, eIF-4A, eIF-4B, eIF-4 , eIF-4D, eIF-4E, eIF-4F, eIF-5) и один высокомолекулярный фактор терминации (eRF). Для инициации в эукариотических системах требуется также АТФ. [c.58]

Взаимодействуя с, терминирующим кодоном и рибосомой, факторы терминации (RF-1 и RF-2 прокариот или RF эукариот) как бы имитируют посадку аминоацил-тРНК в А-участок транслирующей рибосомы. Однако вместо последующей атаки сложноэфирной связи пептидил-тРНК аминогруппой аминоацил-тРНК имеет место атака той же связи молекулой воды. В обоих случаях реакцию переноса пептидильного остатка либо на аминогруппу, либо на воду катализирует пептидилтрансферазный центр рибосомы (см. ниже). [c.267]

Фактор инициации IF-2 и фактор терминации RF тоже конкурируют как с EF-Tu, так и с EF-G за место посадки. Их взаимодействие с рибосомой также зависит от присутствия белка L7 / L12 [c.147]

БЕЛКОВЫЕ ФАКТОРЫ ТЕРМИНАЦИИ [c.266]

Белковые факторы терминации [c.303]

Рибосомный участок связывания факторов терминации [c.303]

Факторы терминации Факторы терминации [c.512]

Факторы терминации. См. Рилизинг-факторы. [c.1020]

Факторы терминации и освобождения [c.55]

Не совсем ясно, зачем нужны два стоп-кодона и два фактора терминации, однако высказывалось предположение, что-это своего рода предохранительное приспособление, обеспечивающее надежность прекращения трансляции. Известно, что в-некоторых случаях оба кодона располагаются последовательно,, но сигналом об освобождении синтезированного полипептида может служить любой из них. Были получены антисыворотки,, специфичные в отнощении факторов RF-1 и RF-2. Если в среде присутствует одна из антисывороток, то синтез белка заканчивается нормально и белок освобождается, в присутствии же-обеих антисывороток синтезированный белок не отделяется or рибосомы. [c.59]

Мн. терминаторы узнаются РНК-полимеразой только с помощью белковых факторов терминации. Из них наиб, изучен фактор р Е. oli-олигомерный белок с мол. м. 46 тыс. Фактор р присоединяется к определенным участкам синтезируемой РНК (не имеющим протяженных двухспиральных структур) до того, как РНК-полимераза достигает терминатора. Предполагается, что фактор р передвигается вдоль РНК вслед за РНК-полимеразой, используя для этого энергшо гидролиза нуклеозидтрифосфатов, и способствует диссоциации гибрида РНК с матричной нитью ДНК. [c.620]

В нормальных условиях сигналом терминации синтеза белка служат присутствующие в мРНК стоп-кодоны UAPu или UPuA. Они не кодируют никакую из аминокислот, а указывают на завершение синтеза белка, который должен покинуть рибосому. Стоп-кодоны действуют совместно со специфическими факторами терминации и освобождения законченной полипептидной цепи [681, 703, 2888, 4170]. [c.60]

Когда рибосома достигнет терминирующего кодона мРНК, синтез полипептида прекращается. В присутствии терминирующего кодона рибосома не связывает какой-либо аминоацил-тРНК, а вместо них в дело вступают специальные белки, называемые факторами терминации. Под их действием синтезированный полипептид освобождается из рибосомы. Эта стадия называется терминацией трансляции. После терминации рибосома может либо сойти с мРНК, либо продолжать скользить вдоль нее, не транслируя. [c.56]

Преждевременная терминация белкового синтеза, вызываемая нонсенс-мутацией, может быть супрессирована благодаря тому, что в тРНК возникают изменения, позволяющие ей узнать терминирующий кодон как смысловой. В нормальной клетке терминирующий кодон узнается только фактором терминации. Следовательно, мутация в гене тРНК, приводящая к узнаванию терминирующего кодона, придает новое свойство трансляционной системе. Как показано на рис. 7.11, благодаря этому восстанавливается способность включать аминокислоту в ответ на мутантный кодон. В результате синтезируется белок нужной длины. Если аминокислота, включенная в результате супрессии, отличается от аминокислоты, которая исходно присутствовала в белке дикого типа, то его активность может быть частично снижена. [c.98]

В эукариотах ик тся единственный фактор терминации, называемый RF. Его мономер1тая форма имеет молекулярную массу около 50000—60000 дальтон, но, по-видимому, он обычно присутствует в виде димера с молекулярной массой около 120000 дальтон. RF способен узнавать все три терминирующих кодона (UAA, UAG и UGA), взаимодействует с ГТФ и вместе с рибосомой проявляет ГТФазную активность. [c.267]

Проблема специфического фактор - кодонового взаимодействия, вместо кодон-антикодонового взаимодействия, очень интересна. Поразительно, что белок тоже узнает именно триплет нуклеотидов, и узнавание имеет такую же высокую степень специфичности. Более того, при наличии супрессорной тРНК, комплементарной терминирующему кодону, аминоацил-тРНК и фактор терминации равноправно конкурируют за посадку в А-участок рибосомы. Использование различных модифицированных нуклеотидных остатков в терминирующих кодонах указывает на то, что специфичность RF в узнавании кодона очень напоминает специфичность Уотсон — Криковского спаривания оснований, включая Криковское неоднозначное спаривание ( wobble ). Безусловно, структура белкового антикодона представляет собой очень интригующую и важную задачу, в том числе для решения общих проблем белок-нуклеинового узнавания. [c.267]

Функционирование факторов терминации, так же как факторов элонгации и одного из факторов инициации, зависит от ГТФ. Для эукариотических систем это показано достаточно четко ГТФ, так же как и его нерасщепляемый аналог, стимулирует кодонзависимое связывание RF с рибосомой, с другой стороны, RF на рибосоме обладает ГТФазной активностью, которая, видимо, нужна для расщепления ГТФ с целью освобождения RF с терминировавшей рибосомы. Для прокариотов имеются следующие факты 1) RF-3 имеет сродство к ГТФ и к ГДФ 2) RF-3 в присутствии рибосомы обладает [c.267]

Возможно, что кодонзависимое связывание фактора терминации каким-то образом делает пептидилтрансферазный центр рибосомы просто доступным для воды, которая является для него хорошим субстратом в результате перенос пептида происходит на воду, гем более что конкурирующая аминогруппа аминоацил-тРНК в данной ситуации отсутствует. Например, это могло бы быть достигнуто в результате некоторого раздвигания рибосомных субчастиц или легкого раскрывания (разрыхления) больщой субчастицы, несущей пептидилтрансферазный центр. Однако пока нельзя исключать и другую альтернативу, предполагающую непосредственное участие либо какой-то нуклеофильной группы белка RF в атаке сложноэфирной связи и промежуточном кратковременном акцептировании пептида, либо RF-фиксированной молекулы воды как специфического акцептора. [c.269]

Наконец, в E. oli два белка катализируют на рибосоме гидролитическое отщепление полипептидной цепи от пептидил-тРНК. Эти белки проявляют специфичность по отношению к терминирующим кодонам RF-I осуществляет катализ, если терминирующими кодонами являются UAA и UAG, а RF-2 узнает кодоны UAA и UGA, Есть еще один фактор терминации — RF-3, который не имеет собственной каталитической активности, но стимулирует действие факторов RF-I и RF-2. В клетках млекопитающих известен единственный RF-фактор, который узнает все три терминирующих кодона. [c.423]

После заверщения синтеза полипептидной цепи, о котором сигнализирует терминирующий кодон мРИК, происходит высвобождение полипептида из рибосомы при участии особых рилизинг -факторов (от англ. release - высвобождать), или факторов терминации. [c.929]

Рнлизинг-факторы (факторы терминации). Входящие в состав цитозоля факторы белковой природы, необходимые для высвобождения готовой полипептидной цепи из рибосомы. [c.1018]

Фактор р функционирует только в процессе терминации. Это белок с мол. массой 55000 дальтон. Активной формой, по-видимому, является тетрамер. In vitro фактор проявляет две активности. Он функционирует в качестве фактора терминации, причем он требуется в каталитических количествах. Обычно максимальная активность проявляется, когда концентрация фактора составляет 10% от количества РНК-полимеразы. Фактор обладает также РНК-зависимой ЫТРазной активностью, необходимой для терминации. [c.166]

Полипептидный синтез по данной матрице продолжается до тех пор, пока в А-участке не окажется терминаторный кодон мРНК. Обычно терминация трансляции может задаваться тремя различными кодонами-UAA, UAG и UGA. Последовательность оснований в этих кодонах узнается специализированными белковыми факторами терминации. У Е. oli имеются два таких белка-RFl и RF2 первый узнает кодоны [c.47]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология