Интроны группы

Рис. 9-87. Два известных класса самосплайсирующихся интронов. У интронов группы I для инициации сплайсинга с определенным сайтом связывается свободный G-нуклеотид (см. рис. 3-19), а у интронов группы II используется особым образом активированный А-нуклеотид Эти две группы интронов изображены таким образом, чтобы были видны их общие свойства. В обоих случаях ускорение реакции определяется белками, но в катализе участвует и РНК, входящая в состав интрона. Механизм, используемый нитронами группы II, приводит к образованию лассо-подобных структур и напоминает реакцию, катализируемую сплайсосомой (ср. рис. 9-82). (Но Т.К e h, ell 44 207-210, 1986.)

Таблица 8.5. Консервативные элементы, присутствующие во многих интронах группы I

Сплайсинг интронов группы II. 2 -гидроксильная группа остатка А осуществляет нуклеофильную атаку на остаток С и инициирует расщепление в 5 -сайте сплайсинга. Далее З -гидроксильная группа 5 -зкзона вступает в реакцию с фосфатной группой З -экзона. завершая процесс сплайсинга с высвобождением молекулы РНК. имеющей форму лассо. [c.112]

Особые типы интронов группа II. Интроны группы II распространены менее широко, чем интроны группы I. Они обнаружены в двух митохондриальных генах дрожжей, кодирующих одну из субъединиц цитохромоксвдазы и цитохром Ь интересно, что в этих генах присутствуют также интроны группы I. Интроны группы II не содержат канонических [c.108]

Возможно, такой механизм самосплайсинга, который реализуется в случае интрона гена рРНК Tetrahymena, характерен и для других интронов группы I. Все они содержат четыре одинаковые консервативные последовательности, обозначаемые [c.109]

А, В, 9L и 2, а также две неконсервативные, но комплементарные последовательности, обозначаемые 9R и 9R (табл. 8.5 и рис. 8.75). Эти шесть элементов всегда расположены в интроне в одном и том же порядке 5 -9R -A-B-9L-9R-2-3. Кроме того, большинство интронов группы 1 содержат последовательность. которая функционирует как некий внутренний гид . Как известно, мутации, блокирующие сплайсинг, встречаются в ряде генов мРНК и рРНК митохондрий. Такие мутации, как правило, мешают спариванию оснований. Например, способность к сплайсингу, утраченную в результате изменений в одной из двух последовательностей, 9R или 9R, можно восстановить, индуцировав компенсирующие изменения в другой последовательности. Каталитические или ферментоподобные свойства [c.109]

Самосплайсинг интронов группы I на примере интрона рРНК Tetrahymena thermophila. Интроны выделены точками, а важные реакционные группы-серым цветом. В изолированном виде получены все указанные соединения, кроме первого продукта расщепления, заключенного в квадратные скобки. Числа длина сегментов РНК. [c.111]

Еще один тип самосплайсинга. Интроны группы [c.112]

II про-мРНК митохондрий дрожжей также имеют консервативные последовательности, а возможно, и специфическую вторичную структуру, но она отличается от структуры интронов группы I. Интроны этого типа также способны к самовырезанию, но об особенностях их вторичной и третичной структуры и соответственно о молекулярных деталях сплайсинга известно меньше. Очевидны две особенности механизма сплайсинга 1) в отличие от самосплайсинга интронов группы I для сплайсинга интронов группы II не нужен нуклеозид-инициатор 2) в результате сплайсинга образуется структура типа лассо (рис. 8.76). [c.112]

Каким образом интрон группы II вырезает сам себя и чем обусловлено образование нового РНК-продукта, имеющего форму лассо Как и в случае интронов группы I, этот процесс, по-видимому, протекает при участии трансэтерификации на первой стадии происходит расщепление 5 -сайта сплайсинга, а на второй - расщепление З -сайта сплайсин- [c.112]

Хлоропластные интроны, по-видимому, аналогичны или интронам группы I, или интронам группы II (разд. 8.5. в). Можно предположить, что при сплайсинге используются сходные механизмы. В большинстве хлоропластных интронов протяженные открытые рамки считывания отсутствуют. Впрочем, такая рамка длиной 509 кодонов обнаружена в интроне гена лизиновой тРНК в хлоропластах табака и в интроне гена 23S-pPHK у С. reinhardii. В соответствующих белковых продуктах имеются участки, гомологичные участкам матураз, кодируемым митохондриальными интронами дрожжей. Таким образом, интроны как хлоропластных, так и митохондриальных ДНК могут содержать функциональные сегменты. [c.225]

Л. Главное различие между самосплайсирующимися интронам групп I и II состоит в том, что у интронов группы I атакующи нуклеотид свободен, а у интронов группы II он входит в сося интронной последовательности. [c.148]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология