Джерниган

В конце 1970-х и в 1980-е годы исследования подобного плана [40-46] не претерпели существенных изменений и не внесли новых идей в решение проблемы свертывания и структурной организации нативного белка. Для иллюстрации рассмотрим кратко результаты анализа процесса сборки белковой цепи бычьего панкреатического трштсинового ингибитора, полученные С.Миязавой и Р. Джерниганом [46]. Авторы представили белковую последовательность в виде цепочки жестких сфер, совмещенных с атомами С и СР аминокислотных остатков. Конформационными параметрами считались двугранные углы ф, у, которым разрешалось принимать дискретные значения через каждые 10°. Межостаточные взаимодействия учитывались исключительно между теми парами остатков, которые в кристаллической структуре трипсинового ингибитора образуют близкие контакты. При оценке взаимодействия между двумя остатками энергия принималась равной -2,2 ккал/моль, если расстояние между соответствующими атомами СР в нативной конформации белка находилось в интервале 2,4-6,5 А когда расстояние было < 2,4 А, энергия считалась бесконечно большой, а > 6,5 А - равной нулю. Следовательно, притяжение друг к другу могли испытывать только те остатки (жесткие сферы) атомы СР которых сближены в реальной трехмерной структуре. Для [c.488]

Теоретические расчеты проведены согласно методам, разработанным Флори 9] и Джерниганом [13], и основаны на двух основных концепциях поворотно-изомерной модели гибкости цепи и взаимозависимости потенциалов вращения связей. [c.373]

Для расчета ( ) были использованы точные математические методы Флори [9] и Флори и Джернигана [13 , применимые к цепям любой длины. Метод расчета очень близок к методу, использованному Леонардом, Джерниганом и Флори [8[ для расчета ( ) а,со-дибромалканов. При это.м использовались статистические веса различных пар связей, углы вращения ф , валентные углы 3 и скалярные значения и векторов [c.374]

ВЫЧИСЛИТЬ инварианты а и у для любой молекулы алкана и, следовательно, степень деполяризации для релеевской линии или полосы. Сравнение вычисленной таким образом степени деполяризации с найденными экспериментально значениями позволяет проверить корректность предполагаемой структуры молекулы. Хотя значение концепции поляризуемости связей ранее подвергалось сомнению [299], она имела определенный успех и в последнее время привлекает внимание исследователей. В обзоре Лефевра [300] критически рассмотрены некоторые аспекты этой модели. Джерниган и Флори [301] рассчитали степень деполяризации для линий н-алканов и установили, что согласие между рассчитанными и экспериментальными значениями анизотропии оставляет желать лучшего. Вероятно, эти расхождения обусловлены в основном ограниченной точностью эксперимента, а не противоречивостью концепции поляризуемости связи существенную роль может играть также влияние внутреннего поля [302], создаваемого соседними молекулами. [c.326]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология