Дуплексы гомологичные

Рис. 52. Структура Холидея или полухиаама — промежуточное соединение реакции гомологичной рекомбинации (Комплементарное спаривание цепей, принадлежащих разным дуплексам, обеспечивает взаимное узнавание гомологичных молекул)

ИЗ цепей ДНК дефектна (например, содержит тиминовый димер или АР-сайт), а комплементарная цепь не могла быть синтезирована из-за дефекта в матрице и поэтому напротив поврежденного участка остается незастроенная брешь (см. рис. 47). Единственный способ безошибочной репарации такого повреждения — это использовать в качестве эталона второй полученный при репликации дуплекс ДНК. т. е. использовать рекомбинацию для репарации повреждения. У Е.соН эту задачу способен выполнить Re A-белок вместе с ферментами репарации. Для НесА-белка одноцепочечный участок двуспиральной молекулы ДНК, содержащий повреждение, является излюбленным участком связывания. Связавшись с таким местом, Re A-6e-лок вовлекает его в рекомбинационное взаимодействие с гомологичным неповрежденным дуплексом, причем как разорванная, так и поврежденная цепи ДНК оказываются спаренными с неповрежденными комплементарными цепями, что позволяет их репарацию описанными в предыдущей главе репарационными системами (рис. 62). Таким путем осуществляется пострепликативная, или рекомбинационная, репарация. Аналогичным образом за счет рекомбинации происходит репарация двуцепочечных разрывов ДНК. [c.94]

Топоизомераза позволяет ранее не зацепленным иепям. принадлежащим двум гомологичным дуплексам, обвиться друг вокруг друга) [c.93]

Комплементарное спаривание цепей, принадлежащих разным дуплексам, обеспечивает взаимное узнавание гомологичных молекул) [c.85]

Если репликация ДНК произошла до того, как из ДНК были удалены дефекты, может возникнуть показанная иа рисунке ситуация, когда одна из цепей ДНК повреждена, а во второй имеется брешь, так как поврежденная цепь не может служить полноценной матрицей. Подобные повреждения могут быть исправлены лишь с привлечением гомологичного дуплекса) [c.94]

МИГРАЦИЯ ВЕТВИ. Способность одноцепочечной ДНК, частично спаренной с комплементарной цепью в двухцепочечной молекуле ДНК, продолжать комплементарное взаимодействие и вытеснять гомологичную цепь из дуплекса. [c.523]

Метод, позволяющий оценить степень общего сходства ДНК у различных организмов,-это гибридизация ДНК. Расплавленная (т.е. диссоциированная) ДНК, меченная радиоактивными изотопами, после фракционирования может взаимодействовать с ДНК другого вида. Гомологичные последовательности при этом гибридизуются с образованием двухцепочечных комплексов (дуплексов). Количество прореагировавшей таким образом ДНК позволяет оценить долю гомологичных участков в молекулах ДНК сравниваемых видов. Обычно при этом сперва удаляются фракции высокоповторяющейся ДНК, так что сравнивают лишь уникальные последовательности. [c.220]

Когда один и тот же геном служит и донором, и реципиентом при образовании коинтеграта (внутримолекулярная транспозиция), способность мобильных элементов вызывать перестройки в соседних участках ДНК приводит к другим мутационным эффектам. Все происходящие при этом события, включая делеции и инверсии, связаны с соединением одного или двух концов мобильного элемента с новыми последовательностями ДНК (рис. 10.13) детали этих процессов до конца не установлены. Наконец, гомологичная рекомбинация между двумя идентичными мобильными элементами, находящимися в дуплексе ДНК в одной ориентации, приводит к делеции расположенных между ними последовательностей. [c.236]

Пользуясь рис. 5-23, А, изобразите продукты перекрестной рекомбинации между гомологичными участками молекул, изображенных на рис. 5-23, Б. На этом рисунке ДНК-дуплекс изображен тонкой линией, а мишени для гомологичной рекомбинации-стрелками. [c.29]

Выделенные из дрожжей реплицированные линейные рекомбинантные молекулы (рис. 9.53, В) использовались в качестве векторов для клонирования самих теломер дрожжей. Один из необычных концов сначала удалили, расщепив дуплекс соответствующей рестриктирующей эндонуклеазой (рис. 9.53,/1- К отрезанному концу пришили рестрици-рованную дрожжевую ДНК. После трансфекции были отобраны клетки, содержащие молекулы, которые реплицировались в дрожжевых клетках как стабильные линейные ДНК (рис. 9.53, Г). Функциональные дрожжевые теломеры, вьщеленные путем субклонирования, использовали для определения числа копий этих последовательностей в геноме дрожжей. Оказалось, что на гаплоидный геном приходится 30-40 таких копий именно столько, сколько и должно быть при условии, что гомологичные сегменты находятся на каждом из концов всех 16 хромосом дрожжей. [c.214]

Если разрыв происходит в молекуле без вставки (слева), то возникает ситуация, неотличимая от репарации двуцепочечиой бреши, в результате вставка перемещается в молекулу ДНК, ранее ее ие имевшую. Если же разрыв происходит во вставке (справа), то репарация окажется невоз.можной до тех пор. пока экзонуклеазы не гидролизуют всю вставку и концы разрыва не окажутся гомологичными неразорвац.ному дуплексу. Таким образом, направление конверсии в сторону присутствия вставки или ее отсутствия задается тем, в какую нз двух рекомбинирующих молекул дик вносится инициирующий разрыв [c.97]

Эндонуклеаза производит двухцепочечный разрез в одной хроматиде- реципиенте . Разрез увеличивается до размера бреши, по-видимому, за счет действия экзонуклеаз. Экзонуклеаза (экзонуклеазы) разрушает одну из цепей с одной стороны от разреза, в результате чего образуется одноцепочечный З -конец. Свободный З -конец вторгается в гомологичную область другого, донорного дуплекса. Образование гетеродуплексной ДНК сопровождается появлением D-петли, в которой одна цепь донорного дуплекса вытесняется. Репарируюший синтез расширяет D-петлю при этом в качестве затравки используется свободный З -конец. В конечном счете D-петля достигает размера, соответствующего полной длине бреши реципиентной хроматиды. При достижении вытесняемой отдельной цепью удаленного конца пробела, компле- [c.446]

АССИМИЛЯЦИЯ ЦЕПИ. Способность КесА-белка обменивать одноцепочечную ДНК на гомологичную цепь из дуплекса за счет этого одноцепочечная нить входит в состав дуплекса. [c.519]

Если последовательности в дуплексе идентичны, то он называется гомологичным. Однако термин гомологичные часто используется применительно к сходным, но не идентичным сегментам ДНК. Часто для указания степени идентичности последовательностей применяют качественный показатель (например, высокая гомология означает высокую степень сходства). Количественная оценка гомологии применима в тех случаях, когда известны нуклеотидные последовательности. Так, говорят, что два сегмента ДНК гомологичны на 70% (имеют 70%-ное сходство), если 70% пар оснований (или нуклеотидных остатков) у них идентичны и коллинеарны. Такой подход вытекает из определения гомологичности хромосом, однако он отличается от принятого в биологической литературе по эволюции. Там гомология, как правило, означает, что морфологические структуры или последовательности имеют общего предка, и процентная гомология теряет смысл. Хотя последовательности ДНК, гомологичные на 70 и даже на 30%, скорее всего происходят от общей предковой последовательности ДНК, они могут быть и неродственными. Таким образом, термин процентная гомология , используемый в молекулярно-генетической литературе и в данной книге, двусмыслен. Термин процент сходства , которым мы также пользуемся, однозначен, но встречается в литературе довольно редко. [c.158]

Два гомологичных родительских дуплекса и два набора потенциально возможных продуктов их рекомбинации схематически-изображены на рис. 5-29. Изобразите сформированное родительскими дуплексами соединение Холлидея, которое могло бы давать указанные продукты рекомбинации. Пометьте левый конец каждой цепи в соединении Холлидея как 5 или 3, так чтобы было понятным его соотношение с родительскими и рекомбинантными дуплексами. Ответьте, какие цепи следует разрезать, чтобы получить каждый набор продуктов рекомбинации. Наконец, изобразите графически, как должны выглядеть эти продукты после одного цикла репликации. [c.31]

B. Неправильно. Это утверждение было бы верным для гесВСО-белка. Белок гесА нужен для спаривания гомологичных дуплексов. [c.296]

В. Эти результаты указывают на то, что гесВСО стимулирует гомологичную рекомбинацию в районе Хи-сайта, надрезая одну цепь, а затем выплавляя одноцепочечный ус . Эта одиночная цепь в присутствии гесА может быть использована для поиска гомологичной последовательности на другом дуплексе и тем самым для инициации образования межцепочечного обмена. [c.297]

Установление структурного родства между клонированным сегментом ДНК и гомологичной клеточной РНК с помощью специфичной к одноцепочечной ДНК нуклеазы 81. В приведенном примере смесь цитоплазматических молекул ро1у(А )-РНК отжигали с денатурированным препаратом радиоактивно меченной клонированной ДНК в условиях, благоприятствующих образованию дуплексов РНК-ДНК. С помощью нуклеазы 81 удаляли ту часть ДНК, которая не образует гетеродуп- [c.352]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология