Миграция ветви

В зоне № 3 приготовление растворов приводит к довольно быстрому образованию смеси гидроокиси алюминия и полимеров типа [ А1(0Н)з] 0Н" и [А1(0Н)4] 0Н) "Г первый из которых образуется при наиболее низких значениях pH. Отрыв ионов ОН" от первого полимера, представляющего собой мелкие коллоидные частицы, приводит к постепенному накоплению гидроокиси алюминия и гидроксил-ионов. Миграция ветвей второго полимера вызывает его частичное превращение в первый полимер, что также способствует накоплению ионов ОН . [c.254]

Точка перекреста перемещается в результате миграции ветви [c.444]

Такой тип движения позволяет точке обмена в рекомбинационной промежуточной структуре перемещаться в любом направлении. Чтобы в естественных условиях поддерживалось образование протяженных областей гетеро дуплексной ДНК (более 1000 пар оснований), скорость миграции ветви должна быть, по-видимому, достаточно высокой. При вовлечении в реакцию двухцепочечных молекул могут оказаться необходимыми топологические перестройки либо спираль ДНК должна иметь возможность свободно вращаться, либо с помощью топоизомеразы должны сниматься топологические ограничения. [c.445]

Рис, 35.3. Миграция ветви может происходить в любом направлении, когда неспаренная одиночная цепь вытесняется спаренной цепью. [c.446]

МИГРАЦИЯ ВЕТВИ. Способность одноцепочечной ДНК, частично спаренной с комплементарной цепью в двухцепочечной молекуле ДНК, продолжать комплементарное взаимодействие и вытеснять гомологичную цепь из дуплекса. [c.523]

Следующий этап работы — выделение ДНК и выплавление новообразованных цепей путем инкубации ДНК при температуре, близкой к денатурирующей. При этом новообразованная ДНК размером от 100—200 п. н. до 4— 5 т. п. н. выплавляется из длинных цепей ДНК за счет миграции ветвей и образует более короткие двухцепочечные молекулы. При ультрацентрифугировании в сахарозном градиенте эти цепи можно отделить от основной [c.129]

A. Сравнивая время появления меченых фрагментов с картой рестрикции кольцевой ДНК на рис. 5-28, сделайте заключение, какой конец (5 или 3 ) (-)-цени линейной ДНК захватывает кольцевая (-Н)-цепь. Попытайтесь также определить направление миграции ветвей вдоль ( —)-цени. (Линейная двухцепочечная ДНК была разрезана по границе между фрагментами а и с, см. карту рестрикции на рис. 5-28, Б.) [c.31]

Б. Рассчитайте скорость миграции ветвей, принимая длину этой ДНК равной 7 т. н. н. [c.31]

Д. миграция ветвей (направленная миграция ветвей) [c.296]

A. Первый меченый рестрикционный фрагмент, который должен появиться после начала реакции, это фрагмент с, затем метка постепенно появляется и в других фрагментах, так что фрагмент а будет последним, который становится двухцепочечным. Поскольку спаривание происходит между антипараллельными цепями ДНК, этот порядок появления меченых фрагментов означает, что инвазия начинается с З -конца ( —)-цепи линейной ДНК и миграция ветвей продолжается в направлении 3 5 вдоль ( —)-цепи. [c.298]

В ходе миграции ветви при спаривании цепей, [c.106]

За счет этого процесса может пронсхолить удлинение (или укорочение) гетеродуплексного раПона. Так как реальные молекулы ДНК — зтоспнралн, то миграция ветви сопровождается вращением обеих рекомбинирующих молекул [c.87]

Re A-белок проводит замену одной цепи ДНК на другую в активном процессе, требующем гидролиза АТР и имеющем вполне определенную направленность перенос начинается с З -конца и продолжается в направлении 3 5. Другими словами, Re A-белок активно проводит однонитевую миграцию ветви. Более того, при наличии второго свободного конца РесА-белок способен обменивать цепи ДНК между двумя дуплексами, продвигая вдоль ДНК (миграция ветви) образовавшуюся таким образом структуру Холидея (рис. 59) [c.89]

Рис. 59. Направление миграции ветви под действием Re A-белка (Цепи ДНК перекосятся начиная с З -конца)

В зоне № 1 доминируют ионы АЮ [ ]. В зоне. № 2 в растворе сразу после приготовления в основном образуются полимеры состава (А1(0Н)4] (0Н) . " Эти полимеры являются ветвистыми и обладают симметрией Вили Вщ [ ]. Миграция ветвей полимера приводит к ностенен- [c.253]

Полимеры состава [А1(0Н)з],рН и [Al(OH)4lJOH) " 2 образуются в алюминатных растворах при отношениях 0Н AI меньше 4.4 сразу после смешения растворов едкого натра и А1(П1). Отрыв ОН от первого полимера, представляющего собой мелкие коллоидные частицы, и миграция ветвей второго полимера вызывают его частичное превращение в [А1(0Н)з],рН , что приводит к постепенному накоплению гидроокиси А1 (1П) и гидроксил-ионов, поэтому значение pH алюминатных растворов со временем увеличивается. [c.254]

Если в клетке произошла инициация генетического обмена, он продолжается, перемещаясь вдоль цепей ДНК. Такое явление получило название миграции ветви. Ветви в структуре ДНК могут включать либо отдельные, либо двойные цепи. На рис. 35.3 показан пример миграции одноцепочечной ветви. Точка ответвления может мигри- [c.445]

Рис. 35.2 Рекомбинация между двумя спаренными двухцепочечными молекулами ДНК может быть инициирована реци-прокным одноцепочечным обменом, расширяющимся в результате миграции ветви и разрешающимся путем разрезания.

Миграция ветви превращает эту структуру в молекулу с двумя рекомбинантными соединениями. В тех случаях, когда оба соединения разрешаются одним и тем же способом, например разрезанием внутренних цепей, происходит высвобождение исходных, не подвергавшихся крос-синговеру молекул. Если же два соединения разрешаются противоположным способом, т.е. в одном случае разрез вносится на внутреннюю цепь, а в другом-на внешнюю, происходит генетический кроссинговер. [c.446]

Мы знаем, что белок Re A необходим для того, чтобы инициировать ассимиляцию одной цепи, однако существование спонтанной миграции ветвей ставит вопрос [c.450]

В основе механизма активации Re A-белка, стимулирующего миграцию ветви, лежит его способность формировать нити. Этот белок может образовывать длинные нити с одноцепочечной ДНК. В присутствии нуклеотида-кофактора он способен полимеризоваться сам по себе или включать в нити двухцепочечные ДНК. Такие нити по длине превышают исходную молекулу ДНК, что, возможно, свидетельствует о ее раскручивании. Нити из Re A-молекул не образуются в присутствии АТР, однако могут сформироваться в присутствии негидролизуемых аналогов. [c.450]

Рис. 5-61. Два типа миграции ветвей наблюдаемые в эксперимеитах ш vitro. Спонтанно миграция идет в обоих направлениях, подчиняясь закону случая, поэтому реальное перемещение при этом очень невелико Миграция же с участием белка гесА идет с постоянной скоростью только в одном направлении, энергию для нее, очевидно, поставляет процесс поляризованной сборки белка гесА на одиночной цени ДНК, идущий в указанном

Рис. 7.12. Образование полухиазмы (А — В), миграция ветвей (Г), изомеризация полухиазмы (О, О ) и различные результаты разрешения полухиазмы в зависимости от характера разрывов (горизонтальная и вертикальная линии в зоне переброски гибридной ДНК на стадии О) и коррекции гетеродуплексов (Е, Е, Ж Ж ). В скобках — варианты изображения изомеров полухиазмы, показанной на стадии Г. Так же, как и на рис. 7.11, демонстрируются только две хроматиды из четырех — те, что вступают в рекомбинацию. Остальные пояснения — в тексте

Особого внимания в схеме Р. Холлидэя заслуживает способ образования гетеродуплексов. На рис. 7.12 показаны последовательные стадии образования полухиазмы А—В), которая затем может видоизменяться путем миграции вдоль конъюгирующих хроматид (молекул ДНК) на стадиях В, Г. Этот процесс получил название миграции ветвей полухиазмы. Зона переброски движется подобно застежке молния , удлиняя участки гетеродуплексов. При этом молекулы ДНК должны вращаться вокруг своих осей навстречу друг другу. Эксперименты с объемными молекулярными моделями показывают, что это возможно. Результаты тетрадного анализа у дрожжей, гетерозиготных по двум маркерам, между которыми известно расстояние, выраженное в числе пар нуклеотидов, показывают, что зона гибридной ДНК может распространяться на участки длиной около 1000 п. н. Об этом судят по способности к коконверсии мутаций, расположенных на таком расстоянии друг от друга. [c.164]

Белок гесА катализирует как начальный этап рекомбинации - спаривание, так и последующую миграцию ветвей у Е. соИ. Он способствует рекомбинации, связываясь с одноцепочечной ДНК и катализируя спаривание такой покрытой белком цепи с гомологичной двухцепочечной ДНК. Можно определить действие гесА по образованию кольцевых двухцепочечных ДНК в смеси из двухцепочечных линейных молекул ДНК и гомологичных им одноцепочечных кольцевых ДНК, как показано на рис. 5-27. Эта реакция протекает в два этапа сначала кольцевая ДНК спаривается с линейной молекулой на одном из ее концов, а затем точка ветвления продвигается по линейной двухцепочечной ДНК, пока от нее не отделится линейная одноцепочечная ДНК. [c.30]

Рис. 5-53. Влияние негомологичного участка цепи на миграцию ветвей, катализируемую белком гесА (ответ 5-34).

После того как образование синапсиса произошло, короткий участок гетеродуплекса, в котором начали спариваться цепи, принадлежащие двум разным молекулам ДНК, увеличивается за счет направляемой белком миграции ветви, которая также катализируется белком гесА Миграция ветви может происходить в любой точке там, где две одинаковые по своей последовательности одиночные цепи ДНЕ пытаются спариться с одной и той же комплементарной цепью, неспаренный участок одной цепи выгесняет спаренный участок другой, смещая таким образом точку ветвления, хотя само число спаренных оснований при этом не изменяется. Спонтанно миграция ветви идет с равной вероятностью в обоих направлениях и потому трудно сжидать, чтобы она [c.306]

В основе рекомбинации данного типа лежит гомологичное спаривание цепей, принадлежащих двум разным спиралям ДНК, поэтому скорее всего она произойдет в том месте, где такое спаривание возможно а priori и где гомологичность последовательностей достаточно велика, чтобы могла произойти миграция ветви в рамках структуры со скрестившимися цепями. Отсюда можно понять, почему общая, или гомологичная, рекомбинация происходит также между двумя повторами в пределах одной молекулы ДНК или между аллельными и неаллельными элементами одной и той же последовательности в двух разных хромосомах (рис. 2.53 и 2.54). [c.106]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология