Уридин фосфат расщепление

Под действием пиримидил-РНК-азы расщепляются фосфодиэфирные связи, образованные производными уридина и цитидина, а также фосфодиэфиры некоторых редких компонентов РНК, в частности псевдоуридина, 5,6-дигидроуридина и риботимидина . Вопрос о влиянии пр ироды пиримидинового кольца нуклеозида на скорость реакции, катализируемой пиримидил-РНК-азой, рассмотрен в обзоре Витцеля °2 (см. также При расщеплении РНК под действием пиримидил-РНК-азы образуется смесь З -фосфатов пиримидиннуклеозидов и олигонуклеотидов, терминированных остатком пиримидин-З -фосфата. Скорость ферментативной реакции сильно зависит от природы отщепляющегося остатка и конформации полинуклеотида (см. стр. 291) можно осуществить специфическое частичное расщепление полинуклеотидов в условиях, когда скорость процесса уменьшена. [c.70]

Скорость расщепления урацильного ядра максимальна при pH 10, при дальнейшем возрастании pH скорость реакции уменьшается (см. рис. 7.3). Расщепление цикла представляет собой реакцию второго порядка, которая, поскольку обычно используются большие избытки гидроксиламина, может быть приближенно представлена как реакция первого порядка по уридину со скоростью, пропорциональной концентрации гидроксиламина в реакционной среде. При pH 10 для 10 М раствора гидроксиламина величина константы скорости реакции расщепления составляет примерно 1 ч (при 37°С) °. Скорость модификации цитозинового ядра в этих условиях значительно ниже к моменту, когда с 6 М раствором гидроксиламина реагирует 95% уридина, цитидин модифицируетсявсего лишь примерно на 8% . Таким образом, при pH 10 (в сравнительно мягких условиях) реакция с гидроксиламином довольно специфична по отношению к уридину (из обычных нуклеозидов). Конечными продуктами реакции уридина и его фосфатов с гидроксиламином является оксазолон-5 LXX (аналог пиразолона-5) и оксим рибозы LXXI или рибозофосфата, получающийся из промежуточно образующейся рибозилмочевины за счет обменной реакции с гидроксиламином Реакция протекает, вероятно, по механизму, аналогичному реакции с гидразином, и [c.468]

Существенно, что последняя реакция деструкции неспецифична и наблюдается для всех нуклеозид-2 (3 )-фосфатов. Быстрее всего разрушается уридин-2 (3 )-фосфат за 100 ч при pH 7 и 50° С исчезает 79% исходного нуклеотида. В тех л<е условиях цитидин-2 (3 )-фосфат расщепляется на 53% гуанозин-2 (3 )-фосфат — на 25% и аденозин-2 (3 )-фосфат — на 6%- Вследствие этого применение периодатного окисления для специфического расщепления остатков псевдоуридина в тРНК не представляется возможным [c.611]

Панкреатич. Р. отличается от многих белков высокой стабильностью — она способна выдерживать непродолжительное кипячение в кислой среде. Оптимум активности фермента лежит при pH 7,7. Панкреатич. Р. специфически расщепляет рибонуклеиновую к-ту и нек-рые синтетич. полирибонуклеотиды, не действуя на дезоксирибонуклеиновую к-ту. Под действием панкреатич. Р. подвергаются расщеплению не все фосфодиэфирные связи в молекуле рибонуклеиновой к-ты, а только связи между остатком фосфорной к-ты, соединенным с 3 -гидроксилом рибозы пиримидинового нуклеотида (уридина или цитидина) и 5 -гидроксилом соседнего пуринового или пиримидинового нуклеотида. Катализируемая панкреатич. Р. реакция протекает в две стадии на первой стадии происходит разрыв связи между 3 -фосфатом пиримидинового нуклеотида и 5 -гидроксилом соседнего нуклеотида с переносом освобождающейся связи остатка фосфорной к-ты на 2 - гидроксил пиримидинового нуклеотида, в результате чего образуется циклич. 2, З -нуклеотид. На второй стадии фосфатная группа из положения 2 циклич. нуклеотида переносится на воду, в результате чего образуется З -нуклеотид. Сум- [c.337]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология