Уридин расщепление

Деструкция оснований особенно широко используется в ряду пиримидиновых производных. Наиболее важными и широко применяемыми реакциями этого типа являются расщепление пиримидиновых оснований в составе нуклеозидов н нуклеотидов а также РНК и ДНК гидразином и расщепление производных уридина (как мономерных, так и в составе РНК) ° гидроксиламином (об условиях проведения и механизме этих реакций см. гл. 7, [c.506]

При облучении разбавленных водных растворов урацила (10 М) основным продуктом фотолиза является фотогидрат. Уридин и уридиловая кислота образуют практически только фотогидрат, оротовая кислота — только фотодимер. Увеличение концентрации соединения, применение более длинноволнового излучения (270—280 ммк) и удаление из раствора кислорода повышают выход фотодимера. Увеличение длины волны не сказывается на выходе фотогидрата, поскольку квантовый выход гидратации не зависит от X (см. рис. 12.9), однако увеличивает выход фотодимера, так как при этом уменьщается его расщепление на мономерные компоненты. Ингибирующее влияние кислорода на выход фотодимеров производных урацила иллюстрируется данными, представленными в табл. 12.7. В присутствии кислорода повыщается относительный выход фотогидрата (см. также °). [c.642]

Под действием пиримидил-РНК-азы расщепляются фосфодиэфирные связи, образованные производными уридина и цитидина, а также фосфодиэфиры некоторых редких компонентов РНК, в частности псевдоуридина, 5,6-дигидроуридина и риботимидина . Вопрос о влиянии пр ироды пиримидинового кольца нуклеозида на скорость реакции, катализируемой пиримидил-РНК-азой, рассмотрен в обзоре Витцеля °2 (см. также При расщеплении РНК под действием пиримидил-РНК-азы образуется смесь З -фосфатов пиримидиннуклеозидов и олигонуклеотидов, терминированных остатком пиримидин-З -фосфата. Скорость ферментативной реакции сильно зависит от природы отщепляющегося остатка и конформации полинуклеотида (см. стр. 291) можно осуществить специфическое частичное расщепление полинуклеотидов в условиях, когда скорость процесса уменьшена. [c.70]

Модификапия полинуклеотидов карбодиимидом приводит к существенному изменению их способности расщепляться нуклеазами. Динуклеотиды, содержащие остаток модифицированного уридина, устойчивы к действию панкреатической пиримидил-РНК-азы Это позволяет осуществить специфическое химико-ферментативное расщепление РНК по остаткам цитидиловой кислоты si [c.385]

Окисление до Ы-окисей аденозина и цитидина протекает быстро в слабокислой среде. Оптимум pH для реакции ж-хлорпербензой-ной кислоты с аденозином находится при pH 5,5, а с цитидином — при pH 6,0 скорости реакции с обоими нуклеозидами близки З2э. Другие основные компоненты нуклеиновых кислот в этих условиях не подвергаются окислению . Напротив, в слабощелочной среде гуанозин, уридин и тимидин взаимодействует с перекисью водорода и перкислотами с расщеплением гетероциклического ядра (см. стр. 478). Взаимодействие редких компонентов РНК с перкислотами не изучалось. [c.389]

Наличие в молекуле уридина при атоме N-3 алкильного заместителя в заметной степени облегчает раскрытие пиримидинового цикла под действием щелочей Нестойки в щелочной среде и другие 1,3-дизамещенные урацильные производные . Строение продуктов щелочного расщепления неизвестно, отмечено лишь, что при этом образуются производные мочевины . З-Ы-Алкилцитидины в противоположность З-М-алкилуридинам довольно устойчивы к действию щелочей Сравнительно легко (0,3 н. КОН, 40° С, 30 ч) расщепляется пиримидиновый цикл в молекуле N-3-окиси цитидина XLII [c.455]

Скорость расщепления урацильного ядра максимальна при pH 10, при дальнейшем возрастании pH скорость реакции уменьшается (см. рис. 7.3). Расщепление цикла представляет собой реакцию второго порядка, которая, поскольку обычно используются большие избытки гидроксиламина, может быть приближенно представлена как реакция первого порядка по уридину со скоростью, пропорциональной концентрации гидроксиламина в реакционной среде. При pH 10 для 10 М раствора гидроксиламина величина константы скорости реакции расщепления составляет примерно 1 ч (при 37°С) °. Скорость модификации цитозинового ядра в этих условиях значительно ниже к моменту, когда с 6 М раствором гидроксиламина реагирует 95% уридина, цитидин модифицируетсявсего лишь примерно на 8% . Таким образом, при pH 10 (в сравнительно мягких условиях) реакция с гидроксиламином довольно специфична по отношению к уридину (из обычных нуклеозидов). Конечными продуктами реакции уридина и его фосфатов с гидроксиламином является оксазолон-5 LXX (аналог пиразолона-5) и оксим рибозы LXXI или рибозофосфата, получающийся из промежуточно образующейся рибозилмочевины за счет обменной реакции с гидроксиламином Реакция протекает, вероятно, по механизму, аналогичному реакции с гидразином, и [c.468]

Олиго-и полинуклеотиды. Как уже отмечалось выше, первичным продуктом ацетилирования нуклеотидов является смешанный ангидрид нуклеотида и уксусной кислоты, внутримолекулярный алко-голиз которого может приводить в случае олигорибонуклеотидов к изомеризации или расщеплению фосфодиэфирной связи. Хотя нуклеофильность фосфодиэфиров значительно ниже, чем у моноэфиров, опасность таких побочных процессов при ацилировании олигорибонуклеотидов вполне реальна. На примере урндилил-(3 —>5 )-уридина было показано" , что при действии уксусного ангидрида в пиридине происходит расщепление динуклеозидфосфата на 30%, а оставшийся продукт содержит 21% (2 — 5 )-изомера при ацетилировании в присутствии НС1 расщепление проходит на 50%, а изомеризация на 43%. Вместе с тем при проведении реакции в присутствии триэтиламина или тетраэтиламмонийацетата количественное ацетилирование гидроксильных групп не сопровождается сколько-нибудь заметной изомеризацией или деградацией фосфодиэфирной связи. Такие условия были успешно применены для защиты гидроксильных групп в динуклеозидфосфатах- 2, од- [c.516]

Существенно, что последняя реакция деструкции неспецифична и наблюдается для всех нуклеозид-2 (3 )-фосфатов. Быстрее всего разрушается уридин-2 (3 )-фосфат за 100 ч при pH 7 и 50° С исчезает 79% исходного нуклеотида. В тех л<е условиях цитидин-2 (3 )-фосфат расщепляется на 53% гуанозин-2 (3 )-фосфат — на 25% и аденозин-2 (3 )-фосфат — на 6%- Вследствие этого применение периодатного окисления для специфического расщепления остатков псевдоуридина в тРНК не представляется возможным [c.611]

В отличие от фотогидрата фотодимер урацила стабилен в кислой среде, относительно стабилен в разбавленной щелочи при комнатной температуре и быстро деградирует при повышенной температуре. Фотодимер уридилил-(3 - 5 )-уридина UpU при pH 9,3 претерпевает обратимое расщепление одного из урацильных ядер, по-видимому, по связи N-3—С-4 Фотодимеры уридиловых кислот [c.640]

Панкреатич. Р. отличается от многих белков высокой стабильностью — она способна выдерживать непродолжительное кипячение в кислой среде. Оптимум активности фермента лежит при pH 7,7. Панкреатич. Р. специфически расщепляет рибонуклеиновую к-ту и нек-рые синтетич. полирибонуклеотиды, не действуя на дезоксирибонуклеиновую к-ту. Под действием панкреатич. Р. подвергаются расщеплению не все фосфодиэфирные связи в молекуле рибонуклеиновой к-ты, а только связи между остатком фосфорной к-ты, соединенным с 3 -гидроксилом рибозы пиримидинового нуклеотида (уридина или цитидина) и 5 -гидроксилом соседнего пуринового или пиримидинового нуклеотида. Катализируемая панкреатич. Р. реакция протекает в две стадии на первой стадии происходит разрыв связи между 3 -фосфатом пиримидинового нуклеотида и 5 -гидроксилом соседнего нуклеотида с переносом освобождающейся связи остатка фосфорной к-ты на 2 - гидроксил пиримидинового нуклеотида, в результате чего образуется циклич. 2, З -нуклеотид. На второй стадии фосфатная группа из положения 2 циклич. нуклеотида переносится на воду, в результате чего образуется З -нуклеотид. Сум- [c.337]

Углеводный фрагмент аденозина и гуанозина оставался неиден-тифицированным до 1911 г., когда Левин к Джекобе выделили его в кристаллической форме и охарактеризовали как О-рибозу, в то время еще не известную [18]. Значительные трудности возникли при исследовании уридина и цитидина, так как для расщепления гликозидной связи в этих соединениях требуются очень жесткие условия, при которых освободившийся сахар расщепляется далее. Однако если эти нуклеозиды предварительно прогидрировать, то образующийся гликозил-4,5-дигидропиримидин удается далее прогидролнзовать разбавленной кислотой до О-рибозы кроме того, было найдено, что одновременный гидролиз и окисление уридина бромистоводородной кислотой и бромом дает О-рибоновую кислоту [19]. Гуланд с сотрудниками [20] подтвердил наличие [c.16]

Расщепление пиримидинового кольца в нуклеозидах может быть осуществлено различными способами. При действии на уридин гидразингидрата получается пиразолон и рибозилмочевина ранее уже говорилось о неустойчивости пиримидинового кольца в 4,5-дигидронуклеозидах по отношению к щелочи. [c.44]

Изучено действие водного гидроксиламина на РНК вируса табачной мозаики [219]. Пуриновые нуклеозиды не затрагиваются, но уридин быстро и в мягких условиях (pH 10) распадается до 5-изооксазолона и рибозилмочевины при дальнейшем действии гидроксиламина из рибозилмочевины образуются мочевина и оксим рибозы. При щелочном pH цитидин реагирует очень медленно, но при pH 6 цитидиновые остатки в РНК реагируют примерно в 30 раз быстрее уридиновых и превращаются, по-видимому, в производные уридин-6-оксима [219, 220]. Таким образом, оказывается возможным довольно специфическое изменение или удаление оснований без особого вреда для целостности цепи РНК. Удаление остатков урацила из полинуклеотидной цепи предотвращает таким образом расщепление цепи в этих точках панкреатической рибонуклеазой [221]. При обработке рибосомальной РНК из Е. соИ гидроксиламином при pH 10 образуется продукт, из которого при переваривании [c.403]

Возвращаясь к полимерным нуклеиновым кислотам, мы констатируем, что как ДНК, так и РНК являются длинными линейными неразветвленными цепями с фосфорной кислотой и сахаром в цепи главных валентностей. Анализ полинуклеотидной цепи возможен в настоящее время только путем полного расщепления на мономерные звенья и хроматографии нуклеотидов, составляющих цепь. Методы ступенчатого гидролиза цепи, начиная с конца, которые позволили бы определить порядок чередования нуклеотидов в цепи, разработаны еще недостаточно. Так как химические формулы полинуклеотидных цепей сложны, то мы будем пользоваться для их изображения сокращенными транскрипциями. Принято обозначатьнуклеозидыбуквами А, Г, Т, Ц, У (аденозин, гуанозин, тимидин, цитидин, уридин), связующую фосфорную кислоту буквой р. Отсюда полинуклеотидную цепь можно изобразить формулой [c.206]

При последующей хроматографии на бумаге в системе к-пропанол - аммиак - вода было показано, что одна из последних фракций содержит два компонента. Более быстро движущийся компонент в результате комбинированного расщепления панкреатической РНК-азой и фосфомоноэстеразой (РМЕ) дает 2 моля цитидина и 1 моль уридина, а также 1 моль динуклеозидмонофосфата ApG, идентифицированного хроматографией на бумаге в системе изопропанол - аммиак-вода. Поскольку этот олигонуклеотид образуется в результате Ti-РНК-азного гидролиза и, следовательно, имеет на [c.57]

Донорами мононуклеотидного остатка оказался АДФ-фен в реакциях с нуклеозидами. В результате атаки АДФ-фен гидроксильной группой уридина происходит специфическое расщепление ангидрида с переносом мононуклеотидного остатка на гидроксильную группу рибозы и образуется межнуклеотидная связь [c.388]

Путь превращения производных пиримидина — цитозин, урацил и тимин, освобождаюпгихся при распаде нуклеиновых кислот, остается еще во многом неизученным. Установлено, что цитидин с помощью цитидии-дезаминазы, содержащейся в тканях животных, дезаминируется с образованием уридина. Дезаминируется как рибо-, так и дезоксирибоцитиднн. Азот производных пиримидина превращается в мочевину. Из этого следует, что пиримидиновое ядро в организме подвергается расщеплению. Расщепление пиримидинового ядра в тимине приводит к образованию [c.441]

Смотреть страницы где упоминается термин Уридин расщепление: [c.114] [c.117] [c.59] [c.72] [c.78] [c.335] [c.337] [c.363] [c.468] [c.480] [c.636] [c.208] [c.209] [c.311] [c.378] [c.630] [c.361] [c.362] [c.364] [c.508] [c.91] [c.102] [c.91] [c.93]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология