Скотта и Шераги потенциалы

Основная проблема при использовании потенциальных функций заключается в выборе эмпирических параметров, в наибольшей мере соответствующих исследуемым объектам, поскольку универсальных параметров нет. Равновесные расстояния берутся прямо из кристаллографических данных. Дж. Хендриксон [83] и Г. Шерага и соавт. [84] разработали два способа определения параметров А, В иС в функциях "6-ехр" и "6-12". Параметр А вычисляется по уравнению Слэтера-Кирквуда, а В - из условий минимума функции С/вцв при равновесном расстоянии. Другим возможным путем определения значений эмпирического параметра В является его оценка по данным рассеяния молекулярных пучков, а параметра Л - из условия (ЬU JЪr)r=r = О- Параметр С в функции Букингема во всех случаях предполагается одинаковым (4,6 А ). Наиболее обоснованными и хорошо себя зарекомендовавшими в расчетной практике пептидов следует признать значения параметров А к В, предложенные Р. Скоттом и Г. Шерагой [85] для потенциала Леннарда-Джонса. Для потенциала 114 [c.114]

Как мы видели на примере универсального потенциала (2.25), основную роль играет выбор равновесного расстояния Го- Если удастся его выбрать удачно, то останется найти два параметра для потенциала 6-ехр и один параметр —для потенциала 6—12. Учитывая, что в кристалле ближайшие атомы, принадлежащие разным молекулам, находятся, как правило, на расстояниях, меньших равновесных, Скотт и Шерага [ПО, 111], а также Флори с сотр. [133] нашли г о, увеличив на 0,2 А средние межмолекулярные контакты, полученные Бонди (вероятно, эта разница должна составлять 0,3—0,4 А). [c.110]

Основываясь на идее Скотта и Шерага, Абрахам и Парри 1158] провели недавно расчеты барьеров внутреннего вращения и разностей энергий поворотных изомеров галогензамещенных этана. Кроме невалентных взаимодействий, для которых использовались потенциалы, практически совпадающие с потенциалами [ПО], и торсионного потенциала с Uo, равным 2,65 ккал/моль, учитывались и электростатические взаимодействия в монопольном приближении, т. е. (см. выражение 2.21) [c.118]

На рис. 1.3 сопоставлены потенциальные кривые энергий невалентных взаимодействий атомов азота, отвечающих разным потенциалам, а при совпадении потенциалов - разным наборам эмпирических параметров. Тем не менее, как видно из рисунка, различия между кривыми невелики. Потенциал Букингема с параметрами Д. Бранта и П. Флори (Р) [86] по сравнению с потенциалом Леннарда-Джонса с параметрами Р. Скотта и Г. Шераги (5) [85] имеет более глубокий минимум и более крутой подъем энергии при г < гд. Минимум потенциала А.И. Китайгородского К) [75] отличается самым большим значением равновесного расстояния /д, а потенциал А. Ликвори и соавт. I) [87] - медленным подъемом энергии в [c.115]

Перейдем теперь к свернутым формам с водородными связями типа 3, характерным только для трипептидов. В работе [101] (а также и [99]) было показано, что если трипептид Ала-Ала замкнуть водородной связью типа 3, то он сможет существовать в одной из четырех выгодных конформаций, оптимальные геометрические параметры которых приведены в табл. 4 (потенциалы Дашевского, торсиоиная энергия и парциальные заряды Скотта и Шерага, е = 4, потенциал водородной связи работы [56], В=А). Последняя из этих конформаций менее вероятна из-за большой энергии отталкивания несвязанных атомов. [c.131]

J —универсальный потенциал Китайгородского [44] 2 — потенциал Вильямса П15] 5 потенциал Полтева и Сухорукова l 14] 4 — потенциал Дашевского 1119] 5 — потенциал Бартелла Е120] 6 — потенциал Скотта и Шерага [111] 7 — потенциал Рамачандрана — Флори [121] 8, 9 — потенциалы Абрахамсона [68] с разными членами притяжения. [c.104]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология