Кодоны-синонимы

Г.К. называют вырожденным, поскольку 61 кодон кодирует всего 20 аминокислот. Поэтому почти каждой аминокислоте соответствует более чем один кодон. Вырожден-ность Г. к. неравномерна для аргинина, серина и лейцина она шестикратна (т.е. для каждой из этих аминокислот имеется по шесть кодонов), тогда как для мн. др. аминокислот (тирозина, гистидина, фенилаланина и др.) лишь двукратна. Две аминокислоты (метионин н триптофан) представлены единств, кодонами. Кодоны-синонимы почти всегда отличаются друг от друга по последнему из трех нуклеотидов, тогда как первые два совпадают. Т. обр., код аминокислоты определяется в осн. первыми двумя буквами . Вырожденность Г. к. имеет важное значение для повышения устойчивости генетич. информации. [c.519]

От 20 до 50 ( ) различных видов молекул s-PHK — по числу смысловых кодонов или групп эквивалентных кодонов синонимов), соответствующих отдельным аминокислотам. Такой фонд молекул s-PHK представляет собой, по существу, генетический словарь , обеспечивающий переход от полинуклеотида к полипептиду в соответствии с кодом. [c.521]

Таким образом, два вида бактерий, ДНК которых содержит одну и ту же информацию о последовательности аминокислот в белках, могут отличаться по содержанию [Г] + в ДНК на 33% только за счет исключительного использования того или иного из кодонов-синонимов. Разницу в содержании [Г] + [Ц] у бактерий более 33% следует относить на счет различной первичной структуры кодируемых белков. Как видно из табл. 27, более частое использование пролина, аргинина, аланина и глицина для построения белков соответствует более высокому содержанию [Г] + [Ц], тогда как в белках бактерий с более низким содержанием [Г]- -[Ц] следует ожидать более частой встречаемости фенилаланина, метионина, аспарагина, тирозина, изолейцина и лизина. Исследование суммарного аминокислотного состава белков разных видов бактерий подтвердило, что различное содержание [Г] + [Ц] в их ДНК может быть частично объяснено подобными различиями в первичной структуре белков. [c.441]

Генетический код изображен на рис. 4.5. Отчетливо видно, что код-вырожденный 20 аминокислот представлены 61 кодоном. Почти каждой аминокислоте соответствует несколько кодонов-синонимов. Число кодонов для одной аминокислоты достаточно хорошо отражает частоту встречаемости данной аминокислоты в белках. Как видно на рис. 4.6, такая корреляция наблюдается для всех аминокислот, за исключением аргинина. [c.60]

Шестьдесят один кодон соответствует аминокислотам, и все аминокислоты, за исключением триптофана и метионина, кодируются несколькими кодонами. Кодоны-синонимы обычно образуют группы, в которых два первых основания в кодоне являются общими, а третье-варьирует. Три кодона вызывают терминацию (ТЕРМ). Порядок оснований в кодоне записан, как обычно, в направлении от 5 -конца к З -концу. [c.60]

Вырожден ли код Для кодирования 20 аминокислот достаточно 20 триплетных кодонов. Существуют ли кодоны-синонимы или остальные 44 кодона просто не имеют смысла [c.393]

На основании таблицы генетического кода можно построить последовательность из 30 нуклеотидов, определяющую последовательность 10 рассматриваемых аминокислот в лизоциме дикого типа с учетом того, что каждую данную аминокислоту может кодировать любой из ее кодонов-синонимов. Необходимо помнить, что порядок, в котором следует соединять кодоны при построении этой последовательности, будет зависеть от того, на каком из двух концов (3 - или 5 -) отрезка полинуклеотидной цепи находится кодон, определяющий аминоконцевую аминокислоту фрагмента белка лизоцима. Построенная нуклеотидная последовательность должна удовлетворять еще одному условию чтобы в случае выпадения (или включения) одного нуклеотида в кодоне левого серина и включения (выпадения) одного нуклеотида в кодоне левого аланина возникала новая гуклео- [c.446]

Это условие резко ограничивает свободу выбора вариантов при построении полинуклеотидной последовательности оно не только позволяет выбрать, какой из кодонов-синонимов должен быть взят для каждой аминокислоты, но и указывает, в каком порядке должны быть расположены кодоны этот порядок должен соответствовать направлению трансляции информационной РНК от 5 - к З -концу. Это условие, кроме того, однозначно указывает, что две мутации сдвига фазы считывания представляют собой выпадение А из серинового кодона АГУ и включение Г между Г и Ц аланинового кодона ГЦ-. Еаинственно возможная нуклеотидная последовательность, которую можно построить с учетом этих условий, а также последовательность, возникающая в результате двух мутаций сдвига фазы считывания, представлены на фиг. 220. [c.447]

После того как из первых опытов по расшифровке кода стало ясно, что код содержит кодоны-синонимы (например, как это видно из табл. 26, лейцин кодируется как УзЦ, так и УгП, возник вопрос, как происходит декодирование таких кодонов в ходе сборки полипептидов. Поскольку незадолго до этого в опытах по фракционированию экстрактов тРНК (подобных представленным на фиг. 208) было показано, что одной аминокислоте могут соответствовать несколько разных типов тРНК, казалось наиболее вероятным, что для каждого кодона существует соответствующая ему тРНК, несущая комплементарный антикодон. [c.447]

Гипотеза неоднозначного соответствия объясняет, почему кодоны-синонимы находятся в одном квадрате кодовой таблицы. Согласно этой гипотезе, не может быть такой тРНК, которая узнавала бы только кодон, имеющий в третьем положении Ц или А. В соответствии с этим кодон типа ХУЦ должен быть синонимом кодона ХУУ. Поэтому, даже несмотря на то, что эта гипотеза допускает исключительное соответствие антикодона с V в третьем положении кодону с У в третьем положении, т. е. допускает существование тРНК, способной узнавать только кодон ХУУ, этот кодон не может определять аминокислоту, отличную от той, которая определяется кодоном ХУЦ. Аналогично кодон типа XYA должен иметь одно значение либо с ХУГ, либо с ХУУ и с ХУЦ. В этом случае, однако, исключительное соответствие антикодона с Ц в третьем положении кодону с Г в третьем положении указывает на существование тРНК, способной узнавать только кодон типа ХУГ следовательно, вполне возможно, что ХУГ может быть единственным кодоном для какой-нибудь аминокислоты. [c.449]

Был получен Pho мутант Е. oti (дефектный по щелочной фосфатазе), содержащий ат-мутацию гене Phok. Из этого мутанта был получен набор Pho ревертантов, у которых восстановленне активности щелочной фосфатазы не было связано с действием супрессоров. Анализ аминокислотной последовательности белка щелочной фосфатазы этих ревертантов показал, что они содержат различные аминокислотные замены, показанные на схеме в том месте полипептидной цепи, где в белке дикого-типа находится остаток триптофана. Для каждой аминокислоты указаны ее кодоны-синонимы подчеркнуты те из них, которые связаны с УАГ одиночной заменой основания. Очевидно, что УАГ является единственным триплетом, из которого в результате одиночных замен может возникнуть хотя бы по одному кодону для каждой из семи аминокислот, обнаруженных в ревертантах. [c.456]

Прямое доказательство универсальности кода было получено при сравнении последовательностей ДНК с со-ответствуюшими белковыми последовательностями. Оказалось, что во всех бактериальных и эукариотических геномах используются одни и те же наборы кодовых значений. Однако состав оснований различных геномов сильно варьирует в противоположность относительному постоянству аминокислотного состава белков. Можно думать поэтому, что различные виды используют различающиеся характерные наборы кодонов-синонимов. Действительно, наблюдаемое постоянство аминокислотного состава можно объяснить только вырожденностью генетического кода. [c.62]

Обьгано акцепторами для одной и той же аминокислоты служат несколько разных тРПК (изоакцеп-торные тРПК) (рис. 3.30), имеющих разные антикодоны, что позволяет им спариваться с кодонами-синонимами. Отчасти этим объясняется и вырожденно сть кода, т.е. способность разных анти кодонов детерминировать одну и ту же аминокислоту. [c.138]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология