Инициаторные кодоны

Следует заметить, что соответствующая аминокислотная последовательность (начиная с AUG-инициаторного кодона слева) такова [c.177]

Все описанные механизмы позволяют обеспечить инициацию именно на том кодоне, на котором необходимо. Ведь инициаторные кодоны составляют всего 20 % от всех кодонов AUG в геноме. [c.73]

Первая выборка содержала 40, а вторая зб последовательностей. Для выборки промоторов брались участки последовательностей от -I00 до точки инициации транскрипции. Последовательности сайтов инициации трансляции содержали по so нуклеотидов к 5 - и 3 - концу мРНК от инициаторного кодона. [c.232]

Для РНК фага MS2 была установлена полная последовательность всех 3569 нуклеотидов [118]. Некоторые участии этой последовательности показаны на, рис. 15-19. 5 -конец (средняя часть структуры, изображенной в верхнем левом углу) все еще несет трифосфатную группу инициаторного GTP. После ряда шпилек следует защищенный рибосомой участок [119а], который начинается инициаторным кодоном GUG. Этот факт служит прямым доводом в пользу того, что GUG, так же как и AUG, играет роль биологически важного инициаторного кодона. Нуклеотидная последовательность, расположенная вслед за инициаторным кодоном, в точности кодирует почти полностью установленную аминокислотную последовательность вирусного белка. Терминирующий кодон UAG обведен на рисунке рамкой. Вслед за ним расположена короткая межгенная область, включающая одну сторону шпильки, на конце которой расположен инициаторный кодон AUG для следующего гена. Далее расположена последовательность нуклеотидов, точно соот-в <ггву рщ я эцсрериментально установленной последовательности ами- [c.242]

Другим интересным примером использования рибосом для защиты нуклеиновой кислоты от ферментативного гидролиза могут служить опыты с одноцепочечной ДНК бактериофага ФХ174 [121]. В этом случае рибосомы защищали последовательность нуклеотидов, в состав которой входил инициаторный кодон ATG. Этот кодон и следующие за ним семь других кодонов соответствовали известной N-концевой ам1и-нокислотной последовательности детерминируемого геном G белка шипов этого бактериофага. [c.244]

У эукариот рибосомная 40S частица, несущая ряд факторов инициации и метионил-тРНКр, связывается преимущественно с 5 -концом цепи мРНК (как правило, кэпирован-ным), а затем скользит по цепи в направлении к З -концу без Т., потребляя АТФ, пока не натолкнется на триплет AUG, спаривающийся с антикодоном тРНКр и служащий инициаторным кодоном. [c.620]

Хорошим примером полицистронной мРНК является РНК малого РНК-содержащего бактериального вируса (фага) MS2. Фаг MS2 — сферический он имеет диаметр 2,5 нм и молекулярную массу 3,6 10 дальтон. Фаг построен из 180 субъединиц белка оболочки с молекулярной массой 14700 дальтон каждая, одной молекулы так называемого А-белка с молекулярной массой 38000 дальтон и одной молекулы РНК с молекулярной массой 10 дальтон. После попадания фага в клетку Е. соИ (а также в бесклеточной системе трансляции) эта РНК служит матрицей для белка оболочки, А-белка и субъединицы РНК-репликазы с молекулярной массой 62000 дальтон, которая в состав фага не входит. Схема расположения соответствующих цистронов вдоль цепи этой мРНК дана на рис. 6. Цепь начинается с G, имеющего трифосфат на своем 5 -гидроксиле. Далее следует длинная некодирующая нуклеотидная последовательность. Общая длина 5 -концевой некодирующей последовательности 129 остатков в ней встречаются триплеты AUG и GUG, которые, однако, не являются инициаторными. Первый инициаторный кодон, GUG, начинает кодирующую последовательность А-белка (А-цистрон). А-цистрон имеет длину 1179 остатков и заканчивается терминаторным кодоном UAG. Затем идет некодирующая вставка длиной 26 остатков. Следующая кодирующая последовательность начинается с AUG и имеет длину 390 остатков это —цистрон белка оболочки (С-цистрон). Он оканчивается терминаторным кодоном UAA, и за ним непосредственно следует второй терминаторный кодон UAG. Последовательность длиной 36 остатков отделяет С-цистрон от S-цистрона, кодирующего субъединицу РНК-синте-тазы. S-цистрон начинается с AUG, имеет длину 1635 остатков и заканчивается UAG. За ним через один остаток (т. е. не в фазе) имеется еще один терминаторный триплет UGA. З -концевая некодирующая последовательность имеет общую длину 174 остатка и заканчивается аденозином со свободной г/мс-гликольной группиров- [c.20]

В связи с рассмотрением РНК фага MS2, следует указать также на другой способ размещения разных кодирующих последовательностей в одной мРНК. Дело в том, что MS2 РНК кодирует еще и четвертый белок, названный белком лизиса, или L-белком (он, повидимому, участвует в лизисе хозяйской клетки на завершающей фазе инфекции). Этот белок закодирован участком РНК, начинающимся в конце С-цистрона, захватывающим всю 36-нуклеотидную вставку между С-цистроном и S-цистроном и заканчивающимся в пределах S-цистрона рамка считывания этого перекрывающегося L-цистрона сдвинута вправо на один остаток (+1 сдвиг), так что никакие его участки не транслируются при синтезе С-белка и S-белка. L-цистрон имеет свой инициаторный кодон AUG, не в фазе с кодонами С-цистрона, и, соответственно, свой терминаторный кодон UAA, не в фазе с кодонами S-цистрона. Эта ситуация изображена на рис. 7. Использование перекрывающихся кодирующих последовательностей в пределах одной мРНК встречается, однако, не часто и свойственно, по-видимому, в основном вирусным системам, где экономия места для размещения цистронов играет особенно важную роль. [c.21]

Рис. 10. Схема вероятной вторичной структуры (двуспиральной шпильки) участка РНК фага MS2, содержащего инициаторный кодон AUG цистрона белка оболочки фага (по J. А. Steitz, Nature, 1969, v. 224, p. 957 -964)

Рибосома начинает читать мРНК со строго определенной точки ее последовательности, а именно с той, с которой начинается ее кодирующая часть. Как уже отмечалось, эта точка вовсе не есть самый крайний 5 -концевой нуклеотид мРНК, а как правило, расположена на определенном удалении, иногда значительном, от начала полинуклеотидной цепи. Рибосома должна каким-то образом узнать начальную точку считывания, связаться с ней, и только тогда начать трансляцию. Комплекс событий, обеспечивающих процесс начала трансляции, обозначается как стадия инициации. В инициации принимают участие специальный инициаторный кодон, инициаторная тРНК и белки, называемые факторами инициации. [c.56]

Встреча рибосомы с новым инициаторным кодоном, либо на другой цепи мРНК, либо на этой же по направлению к З -концу от терминирующего кодона, приведет к новой инициации. Таким образом, [c.56]

Биосинтез белка начинается тогда, когда 305-субъединица образует тройной комплекс с мРНК, используя инициаторный кодон AUG, и с особой молекулой тРНК. Последняя должна быть заряжена метионином и затем формилирована по аминогруппе этой аминокислоты (Л/-формил-Ме1-тРНК г). Затем присоединяется большая субъединица рибосомы (а также другие белковые факторы) и образуется инициаторный комплекс. [c.208]

При исследовании генетического кода в опытах in vivo также были получены доказательства универсальности кода, однако в последние годы выявлены некоторые особенности его в митохондриях животных, включая клетки человека. Генетический код цитоплазмы отличается от такового митохондрий 4 кодонами. Два кодона АУГ, который обычно является инициаторным кодоном, кодирует также метионин в цепи, и УГА, являющийся нонсенс-кодоном, кодирует в митохондриях триптофан. Кодоны АГА и АГГ являются для митохондрий скорее терминирующими, а не кодирующими аргинин. В результате для считывания генетического кода митохондрий требуется меньше разных тРНК, в то время как цитоплазматическая система трансляции обладает полным набором тРНК. [c.522]

Рис. 6.13. Внутрицепочечное спаривание в молекуле мРНК, препятствующее эффективной трансляции. GGGGG - сайт связывания рибосомы, AUG (красные буквы) - инициаторный кодон, AG- AU-GAU-UUA-иии - несколько первых кодонов. Обратите внимание, что кроме обычных для мРНК пар A-U и G- иногда образуются пары G U.

Генетический код однозначен, т. е. каждый кодон кодирует только одну аминокислоту. Исключение составляют только инициаторные кодоны АУГ и ГУ Г. В начале трансляции они кодируют включение фор-милметионина, а находясь внутри цепи, АУГ кодирует метионин, а ГУГ — валин. [c.366]

В митохондриях также обнаружены две тРНК, распознающие кодон AUG, причем так же, как и в бактериях, у инициирующей тРНК метионин формилирован. Изменения в специфичности узнавания, по-видимому, позволяют AUA, а иногда AU и AUU также использоваться в качестве инициаторных кодонов в митохондриях млекопитающих. [c.74]

Понятие генетический код часто упоминалось в гл. И, поскольку оно лежит в основе представления о механизме биосинтеза белка. Современные знания о генетическом коде накапливались параллельно с детальным изучением молекулярных основ процессов транскрипции и мутагенеза. Эти вопросы, к решению каждого из которых исследователи подходили незавимимым путем, в действительности тесно связаны между собой. Мы уже отмечали, что основными знаками генетического кода служат нуклеотидные триплеты, считываемые последовательно без перекрывания от 5 - к З -концу цепи мРНК. Трансляция начинается со специализированного инициаторного кодона AUG, который определяет рамку считывания последующих кодонов, и продолжается до тех пор, пока не встретится терминаторный кодон. Этот процесс сопровождается сборкой полипептида с фиксированной аминокислотной послейова-тельностью. Синтез полипептида ведется в направлении от N-конца к С-концу. [c.67]

Другим довольно неожиданным фактом оказался наблюдаемый в клетках, зараженных фХ174, синтез дополнительного белка А. Функция этого белка неизвестна, однако известно, что его аминокислотная последовательность совпадает с С-концевой половиной последовательности белка, кодируемого геном А. Белок А считывается с мРНК-тран-скрипта гена А, который содержит дополнительный внутренний сайт связывания с рибосомой, расположенный (как показано на рис. 12.6) на подходящем расстоянии от триплета AUG, который таким образом может выступать в роли дополнительного инициаторного кодона. Синтез белка А происходит с использованием в качестве матрицы той же мРНК в той же рамке считывания, что и для белка А. [c.90]

Бесклеточная система синтеза белка Внегенная супрессорная мутация Внутригенная супрессорная мутация Вырожденность кода Генетический код Инициаторный кодон Кодон [c.101]

Рис. 6.17. Система слияния на основе гена GUS Л — строение основного вектора рБ1 101 для слияния с геном GUS. Приведен пример его использования с двумя промоторными последовательностями растений. 5 — нуклеотидная последовательность области слияния в полилинкере векторов, предназначенных для слияния с геном GUS. Инициаторные кодоны GUS выделены жирным шрифтом. Рестрикционные сайты ВатШ подчеркнуты.

Олигонуклеотид 5 -GATTT A GGGTTGGGGTTT T-3 весьма удобен для определения последовательностей нуклеотидов в областях соединения гена GUS методом затравочного синтеза.-Данный олигонуклеотид, содержащий 22 нуклеотида, комплементарен участку кодирующей цепи гена GUS, который оканчивается через 14 п. н. после А инициаторного кодона ATG. При слиянии генов эту затравку можно успешно применять для определения нуклеотидной последовательности обеих цепей в мини-препаратах ДНК. Такой олигонуклеотид можно использовать и для анализа химерных транскриптов методом затравочного синтеза [6]. [c.366]

Количество рестриктазы PaeR7 в клетках значительно превышает таковое метилазы [3701. В связи с тем, что эти гены входят в состав оперона и предположительно котранскриби-руется уровень их экспрессии вряд ли контролируется механизмами транскрипции. Поэтому причину наблюдаемого явления следует искать в разнице эффективности трансляции сравниваемых генов. Действительно перед геном m не имеется последовательности SD, которая наблюдается на расстоянии 3—9 нп от инициаторного кодона гена эндонуклеазы. Кроме того не исключено, что наличие в составе метилазного гена редко используемого инициаторного кодона GTG, вместо обычного ATG, сказывается на эффективности трансляции соответствующей иРНК. [c.108]

Смотреть страницы где упоминается термин Инициаторные кодоны: [c.302] [c.204] [c.620] [c.620] [c.620] [c.18] [c.19] [c.20] [c.20] [c.23] [c.24] [c.227] [c.302] [c.303] [c.531] [c.190] [c.127] [c.286] [c.76] [c.102] [c.102] [c.367] [c.72] [c.72] [c.73] [c.108]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология