Повторяющаяся сателлитная ДНК

Установлено, что высокоповторяющиеся последовательности в сателлитных ДНК обычно не транскрибируются Следует отметить, что сателлитные ДНК локализуются в области центромеры хромосомы (выполняет структурную функцию) Предполагается, что сателлитные ДНК произошли от мозаики последовательностей, состоящих из 9 пн в трех повторах [c.163]

Основная часть высокоповторяющейся ДНК генома часто может быть выделена как сателлитная ДНК. Когда имеется некоторая фракция высокоповторяющейся ДНК, которая в градиенте плотности не ведет себя как сателлитная, после выделения ее свойства часто оказываются такими же, как свойства сателлитной ДНК. Это означает, что она состоит из множества тандемных повторов, аномально ведущих себя при центрифугировании. Выделяемый таким способом материал иногда называют скрытой (криптической) сателлитной ДНК. Скрытая и явная сателлитные ДНК вместе обычно включают в себя все тандемно повторяющиеся блоки высокоповторяющейся ДНК. Когда в геноме имеется более одного типа высокоповторяющейся ДНК, каждому из них соответствует свой блок сателлита (хотя иногда различные блоки расположены рядом). [c.301]

Сателлитная ДНК членистоногих состоит из очень коротких идентичных повторов [c.302]

Сателлитная ДНК млекопитающих состоит из иерархически организованных повторов [c.302]

Некоторые рестриктазы по отношению к сателлитной ДНК ведут себя иначе. При обработке этими ферментами образуются последовательности одного и того же размера. Но они расщепляют только небольшую часть ДНК, скажем 5-10%. Из этого следует, что повторяющиеся единицы, имеющие такой специфический сайт рестрикции, сосредоточены в определенном участке сателлитной ДНК. По-видимому, все группы повторов в этом домене произошли от родоначальной последовательности (утратили его в результате мутации). [c.306]

Несмотря на то что фазирование возле фиксированных сайтов может быть обусловлено пограничным эффектом, могут также существовать фазированные ряды нуклеосом. В качестве примера назовем а-сателлитный хроматин африканской зеленой мартышки. Эта ДНК состоит из тандемно повторяющейся последовательности в 172 п.н. Длина повтора в нуклеосомах такая же, так что одна нуклеосома приходится на один сателлитный повтор. [c.378]

САТЕЛЛИТНАЯ ДНК. Состоит из большого числа тандемных повторов (идентичных или похожих) основной короткой последовательности. [c.526]

Эти данные вместе с результатами молекулярно-биологических исследований (см. ниже) позволяют сформулировать интегральную модель хромосомы она состоит из единственной двойной спирали ДНК, объединенной с гистонами в нуклеосомы. Некоторые районы этой двойной спирали представлены в основном повторяющимися последовательностями, высокоповторяющиеся копии сателлитной ДНК могут быть рассеяны по геному. Участки, богатые повторяющимися последовательностями (в первую очередь в центромерной области и во вторичных перетяжках), обнаруживают признаки конститутивного гетерохроматина. Заметим, однако, что преобладающими в молекуле ДНК являются все-таки уникальные последовательности длиной в 2 ООО (и больше) нуклеотидных пар. Они рассеяны между мало и умеренно повторяю- [c.120]

Умеренно повторяющиеся последовательности составляют от 10 до 50 % всего генетического аппарата у разных видов эукариот. Они рассеяны по геному, образуя отрезки длиной от нескольких сот до нескольких тысяч нуклеотидов. Сильно варьирует и степень их повторяемости. Одни семейства состоят из нескольких десятков, тогда как другие — из сотен тысяч членов. В отличие от сателлитной ДНК, которая инертна, умеренные повторы активно транскрибируются в клетке, т. е. на их матрице идет активный синтез РНК. [c.22]

В). Это значит, что многие единицы в тандемном повторе содержат сайт для НаеШ, но есть единицы, в которых он отсутствует. Клонирование длинных тандемных повторов сателлитной после- [c.191]

ДНК показало наличие в их составе тандемных повторов из нескольких нуклеотидов. Главная повторяющаяся единица сателлитных ДНК (базовая последовательность), как, например, у D. rnelanogasier, может быть достаточно простой, состоящей из пяти или семи нуклеотидов [c.189]

ААТАААС) и (AATAQA ) . Встречаются и более сложные повторяющиеся единицы Из 359 п.н. Базовая последовательность сателлитной ДНК повторяется многократно, на протяжении 10 тыс. п. н. и более. Таким образом, сателлитные ДНК образуют протяженные геномные блоки. Блоки, состоящие, например, из пяти и семи нуклеотидных тандемных повторов, могут в одной молекуле непосредственно прилегать друг к другу. [c.189]

Мини-сателлитная ДНК человека (Human minisatellite DNA) Некодирующая ДНК человека, обычно G -бо-гатая, содержащая тандемные повторы коротких (длиной 9-40 п.п.) сегментов. [c.553]

Ряд таких вариантов короткой повторяющейся единицы может сформировать более длинную, которая сама по себе тандемно повторяется с некоторыми изменениями. Таким образом, сателлитные ДНК млекопитаюпщх состоят из иерархически организованных повторяющихся единиц. Более длинные повторяющиеся единицы входят в состав последовательностей, ренатурирующих при проведении реассоциации. Их также можно обнаружить при расщеплении ДНК рестриктазами. [c.302]

Прямое определение нуклеотидной последовательности сателлитной ДНК может оказаться сложным. Можно попытаться сделать это, используя дискретный набор по-х ледовательностей, получаемых при расщеплении ДНК рестриктазами. Однако при наличии существенных различий между нуклеотидными последовательностями отдельных повторяющихся единиц в одном и том же положении разных повторов будут находиться разные нуклеотиды, поэтому при электрофорезе получится нечеткая картина. Если различия не слишком велики, скажем находятся в пределах 20%, то можно непосредственно выявить повторяющуюся единицу усредненного состава. [c.303]

Сателлитная ДНК мыши М. mus ulus расщепляется рестриктазами E oRII или Sau96I на ряд фрагментов, включая основной мономерный фрагмент, электрофоретическая подвижность которого соответствует длине 230-240 п. н. При исследовании этого фрагмента обнаруживается одна нуклеотидная последовательность длиной 234 п.н. Эта последовательность, по-видимому, повторяется с небольшими вариациями и составляет 60-70% сателлитной ДНК, расщепляемой с образованием мономерных фрагментов. Проанализируем эту последовательность с точки зрения составляющих ее следующих друг за другом повторяющихся единиц меньшего размера. [c.303]

Такие зонды были использованы для изучения фазирования сателлитных ДНК, тРНК, 58-ДНК, а также гистоновых генов. В этих случаях фазирование нуклеосом может иметь место только при условии простых взаимоотношений между длиной нуклеосомного повтора и длиной тандемно повторяющейся единицы. [c.378]

Лалджи Сингх и Кеннет Джоунс показали, что ДНК самок змеи содержит простую повторяющуюся последовательность, количество которой в ДНК самок гораздо больще, чем в ДНК самцов. Используя центрифугирование в градиенте s l, им удалось выделить фрагменты ДНК, содержащие эти повторы (и другие менее часто повторяющиеся последовательности, перемежающиеся с ними), идентифицировав их как минорную сателлитную ДНК по отнощению к основной фракции геномной ДНК. Когда эти фрагменты ДНК пометили радиоактивной меткой и гибридизовали с препаратом митотических хромосом самок змеи, положительный результат был получен только с W-хромосомой. Интересно, что эта сателлитная ДНК специфически связывается с ДНК особей гетерогаметного пола других рептилий, птиц и даже мыщей [c.278]

Анализ гибридизации ДНК из клеток человека показал, что примерно 70% одноцепочечных фрагментов гибридизуется очень медленно, т. е. так, как и следует ожидать в случае большого набора уникальных (неповторяющихся) последовательностей (полная гибридизация присходит в течение нескольких дней). Однако остальные 30% цепей ДНК гибридизуется гораздо быстрее. Эти цени содержат последовательности, которые многократно повторены в геноме, и, следовательно, могут относительно быстро найти своего партнера. Большая часть такой ДНК не кодирует белки, приблизительно одну ее треть составляют тандемно повторяющиеся сателлитные последовательности, остальные две трети приходятся на рассеянную по геном) повторяющуюся ДНК. Эти диснергированные повторы, но-видимому, произошли из транспозируемых элементов, размножившихся в нашем геноме и достигших исключительно высокой степени конийности. [c.242]

Большая часть быстро гибридизуюшихся цепей ДНК обычно состоит из очень длинных тандемных повторов одной короткой последовательности нуклеотидов (рис. 10-69). Повторяющаяся единица в подобной последовательности может быть представлена даже одним или двумя нуклеотидами, однако большинство повторов длиннее у млекопитающих они обычно составлены из вариантов одной короткой последовательности, организованной в повтор размером в несколько сот нуклеотидов. Такие тандемные повторы простой последовательности называются сателлитной ДНК, поскольку первая обнаруженная ДНК такого типа имела необычный нуклеотидный состав, что давало возможность отделить ее от тотальной клеточной ДНК в виде минорного компонента (или сателлита ). Обычно последовательности сателлитной ДНК не транскрибируются и чаще всего локализованы в гетерохроматине центромерных областей хромосом (см. разд. 10.3.8). У некоторых млекопитающих на долю сателлитной ДНК приходится 10% и более от всей [c.242]

Три класса ДНК хорошо выявляются на кривых ее ренатурации (рис.З), если откладывать на оси абсцисс логарифмы Со/, т. е. произведения концентрации ДНК (моль Р/л) на время (с), а по оси ординат — процент ре-натурированной ДНК. Например, у млекопитающих около 15 % ДНК ренатурирует в интервале oi от 10 до 10 (сателлитная ДНК), еще 10—20 % — в интервале Со/ от 10 до 10 (умеренные повторы) и остальные 70 % (уникальная ДНК) — в интервале от 10 до 10 , [c.22]

Если ДНК содержит понторы, после фрагментации соответствующие сегменты будут присутствовать в большей концентрации, чем сегменты с уникальными последовательностями. Поэтому ренатурация повторов будет идти быстрее, что учитывает множитель п в уравнении (23.67). Из рис. 23.20 видно, что poly (А U) и сателлитная ДНК мыши ренатурируют несравненно быстрее, чем другие ДНК. Если гомогенная ДНК содержит повторы с различной кратностью, удобно ввести так называемый параметр кинетической сложности, Х . Параметр кинетической сложности — это такая длина цепи ДНК, в которой содержится по одной копии каждого уникального участка всей последовательности. Для последовательности, в которой все повторы имеют одинаковую кратность, Х = Т/п. Уравнение (23.67) позволяет экспериментально определить Х при условии, что была проведена калибровка константы Atj. Для гомополимера = 1 для чередующейся последовательности типа d(AT) d(AT) Х = 2 для уникальной последовательности без повторов Х = Т. Изучение кинетики ренатурации позволяет получить определенную информацию о средней повторяемости последовательностей, если известен размер генома. [c.350]

Функция сконцентрированных в гетерохроматине разных типов повторов не выяснена или вскрыта далеко не до конца. К ним относятся так называемые сателлитные ДНК, содержащие повторы от нескольких нуклеотидных пар до сотен нуклеотидных пар, а также разные типы потенциально подвижных элементов. В гетерохроматин помещены также жизненно важные для каждой клетки тандемно повторяющиеся гены, кодирующие рибосомные РНК. Вряд ли можно дать исчерпывающий ответ на вопрос, почему рибосомные гены и подвижные (или когда-то бывшие подвижными) элементы сконцентрированы в гетерохроматине. Характер распределения сгруппированных подвижных элементов по гетерохроматиновым районам хромосом дрозофилы одинаков в разных линиях и, следовательно, скорее всего рисунок их распределения поддерживается отбором (Pimpinelli et al., 1995). Образование таких кластеров подвижных элементов в гетерохроматине отражает процессы эволюции генома. [c.16]

Смотреть страницы где упоминается термин Повторяющаяся сателлитная ДНК: [c.51] [c.57] [c.58] [c.191] [c.164] [c.299] [c.308] [c.163] [c.882] [c.265] [c.522] [c.302] [c.303] [c.305] [c.305] [c.307] [c.475] [c.188] [c.21] [c.24] [c.25] [c.99] [c.20] [c.57]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология