Нуклеиновые кислоты силы, стабилизирующие структуру

Нуклеиновые кислоты образованы нуклеотидами, связанными фос-фодиэфирными группами через группы в положениях 3 и 5. Такая структура имеет большое число вращательных степеней свободы. Для закручивания структуры представляют интерес 5 точек сахарофосфатного остова и две внутренние точки молекулы нуклеотида (точки 2 и 3, в которых возможны эндо- и экзо-положения сахара). Последнее обстоятельство связано с возможностью вращения связи сахар—фосфат (син и ангт) в нуклеотиде. Рассмотрим возникающие конфигуращ1и с точки зрения энергетической выгодности. Стабилизирующими факторами двойной спирали являются электростатические силы отталкивания между фосфатными группами, гидрофобное взаимодействие между основаниями (стэкинг-взаимодействие) и водородные связи между комплементарными основаниями. Именно эти факторы должны определять углы вращения сахаров и оснований, а также всю структуру синтезируемых олиго- и полинуклеотидов. [c.190]

Спиральное строение, по-видимому, является общим типом вторичной структуры, причем не только в случае природных макромолекул (биополимеров), таких, как протеины или нуклеиновые кислоты, но также в случае синтетических полимеров (например, полимеров олефинов) и даже в случае неорганических полимеров (например, волокнистой модификации серы). Спирали, привлекаемые для рассмотрения индивидуальных типов соединений, значительно отличаются как в отношении геометрических параметров (величина витка, диаметр и т. д.), так и в отношении характера межатомных сил, стабилизирующих их. [c.107]

Силы, стабилизирующие вторичную структуру РНК. Для определения ста бильности спиралей нуклеиновых кислот биологи вначале использовали, можно сказать, визуальный, статистический метод - оценивали на глаь содержание G- и A-U пар в спирале. Это казалось вполне подходило для качественных выводов, однако в 1963 г. Чемберлен с соавт. ( hamberiir. et al., 1963) четко показали на синтетических полимерах влияние последовательности оснований на стабильность. Энтальпия спирали, имеющей, например, две G- пары, будет очень сильно разнится в зависимости от того, являются ли эти пары ближайшими соседями или между ними расположена A-U пара. Чтобы объяснить этот результат, надо учесть так называемые вертикальные или стэкинг-взаимодействия. [c.192]

Как ведут себя нуклеиновые кислоты в водных растворах Какого типа упорядоченные структуры они образуют и как объяснить наблюдаемые физические и химические свойства на основании этих структур Как происходит переход нуклеиновых кислот из одного состояния в другое Этим вопросам посвящены данная и две следующие главы. Ясно, что без ответа на них нельзя до конца понять, как нуклеиновые кислоты выполняют важнейшую функцию хранения и передачи гинетической информации. Основу для объяснения некоторых сложных особенностей поведения нуклеиновых кислот дают предыдущие главы. В гл. 3 рассмотрены структурные и химические аспекты. Гл. 6 посвящена силам, стабилизирующим конформации нуклеиновых кислот. В гл. 7—12 описаны в общих чертах те методы, которыми можно исследовать конформационные свойства биополимеров в растворе. Теперь мы подытожим всю эту информацию и проанализируем некоторые свойства природных нуклеиновых кислот и соответствующих модельных систем. При этом наше внимание будет сосредоточено на поведении их в растворе, поскольку это именно те условия, в которых нуклеиновые кислоты функционируют в клетке. [c.239]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология