Правильная инициация трансляции

Г. Правильная инициация трансляции [c.116]

При исследовании позиционно-зависимой статистики последовательности в выборке должны быть правильно выровнены друг относительно друга. Основанием для выравнивания в первую очередь является экспериментальная информация о сигнале, такая как место инициации транскрипции или трансляции, участок ДНК, защищаемый связанным с на-белком от действия нуклеаз, два места разрезания РНК при вырезании из нее нитрона (одно соответствует 5 концу интрона, а другое 3 концу) и т.д. В некоторых случаях выравнивание практически однозначно следует из экспериментальных данных, в других случаях его приходится искать с помощью программ. [c.122]

Поскольку генетический код универсален, возможность такой экспрессии определяется лишь наличием в изучаемом гене сигналов инициации и терминации транскрипции и трансляции, правильно узнаваемых прокариотической клеткой. [c.157]

Имеются три рамки считывания , при которых может осуществляться перевод последовательных нуклеотидных триплетов мРНК в аминокислоты. Правильная инициация трансляции чрезвычайно важна для точной расшифровки генетического кода. Выбор рамки считывания зависит от того, какое сочетание из трех последовательных нуклеотидов выбрано в качестве первого кодона. Ниже приведены три возможные рамки считывания для последовательности ОиАСОиААОиААОиАиООАСОиА [c.116]

При проверке, так же как и при обучении программ, необходимо уделять самое пристальное внимание формированию выборок сайтов и несайтов. Для обучения программ и получения чисел, характеризующих качество распознавания, необходимо выбирать правильное соотношение сайтов и несайтов. Что означает ошибка 37%, полученная в работе Голованова Действительно ли взяв 100 белок-кодирующих последовательностей и применив к ним программу распознавания RBS, мы у 37 из них получим неправильное место инициации трансляции [c.151]

И виде предшественников с сигнальной последовательностью иа ЫНу-конце полипептидной цепи, которая отщепляется в процессе их выхода из клетки. Правильный процесс отн епления сигнальных последовательностей в бактериальной клетке не всегда возможен, Поэтому мы вынуждены ввести в конструкцию перед тf)yктypпыlvI геном кодон инициации трансляции (метиониновый кодон). [c.101]

SD-последовательность мРНК служит сигналом для взаимодействия рибосом с мРНК и обеспечивает инициацию трансляции с правильного AUG-кодона. Она представляет собой короткую последовательность нуклеотидов, обогащенную пуриновыми основаниями, и расположена за 4-9 нуклеотидов перед AUG-кодоном [c.112]

К наиболее полезным для анализа модификациям в структуре гена относятся замена одного нуклеотида или группы нуклеотидов, делеции или вставки нескольких нуклеотидов или протяженных участков ДНК и перестройки внутри гена. Ниже мы обсудим, каким образом эти модификации используются для идентификации регуляторных последовательностей, которые обеспечивают правильную экспрессию гена и отвечают за его тканеспецифичную и зависящую от времени регуляцию. Кроме того, изучение новых генов, образующихся при слиянии частей различных генов, очень облегчает идентификацию последовательностей, ответственных за правильную экспрессию. Например, слияние промотора SV40 и различных его производных с последовательностями, кодирующими легко идентифицируемые бактериальные или эукариотические клеточные белки, позволяет выяснить, какие последовательности промотора обеспечивают правильную инициацию, эффективность и регуляцию транскрипции гена SV40. Аналогичные химерные гены, содержащие, например, промоторы генов инсулина или эластазы, слитые с областью, кодирующей Т-антиген SV40, позволяют идентифицировать элементы, ограничивающие экспрессию генов инсулина или эластазы исключительно Р-клетками островков Лангерганса или ацинарными клетками соответственно. Для применения методов обратной генетики необходимо, чтобы существовал один или лучше несколько способов определения фенотипического проявления измененного гена. Соответствующие бесклеточные системы, с помощью которых можно определять эффективность транскрипции нормальных и модифицированных генов, а также изучать процессинг или трансляцию РНК, дают прекрасную возможность для анализа функции генов и последствий отдельных изменений в них. Трансфицируя нормальные и модифицированные гены с помощью [c.20]

Обьгано аминокислотной последовательности кодируемой полипептидной цепи соответствует только одна из рамок. Следовательно, должен существовать какой-то способ инициации трансляции с правильной рамкой считывания. У всех организмов, изученных к настоящему времени,- бактерий, вирусов и эукариот—правильная рамка считывания определяется с помощью механизма, распознающего специфический кодон, который детерминирует концевую аминокислоту синтезируемого белка. Почти всегда таким кодоном является триплет AUG, отвечающий метионину. Поэтому образую-пщйся полипептид неизменно содержит на N-конце метионин, но при последующем удалении аминоконцевой последовательности на N-конце конечного белкового продукта оказывается аминокислота, находящаяся изначально внутри синтезированной полипептидной последовательности. В рассмотренном выше примере кодон AUG, с которого может начаться транскрипция, содержит рамка считывания 3. [c.116]

Чтобы получить какой-то белковый продукт, необходимо обеспечить правильную транскрипцию кодирующего его гена и трансляцию соответствующей мРНК. Для инициации транскрипции в нужном сайте необходим промотор, а для ее остановки - терминирующий кодон. Клонированный ген часто бывает лишен таких сигнальных последовательностей, и для его экспрессии в прокариотической клетке-хозяине нужно обеспечить и то, и другое. Кроме того, поскольку для решения большинства биотехнологических задач белок должен образовываться в больших количествах, необходимо использовать промотор, который позволял бы получить высокий уровень транскрипции (сильный промотор) и распознавался РНК-полимеразой хозяйской клетки. Постоянная транскрипция клонированного гена истощает энергетические ресурсы хозяйской клетки, поэтому нужно использовать промоторы, работу которых можно регулировать либо с помощью специфических низкомолекулярных соединений, либо изменением температуры. [c.130]

Так как генетический код триплетен и универсален (табл. 2.2), то любая непрерывная кодирующая последовательность может быть экспрессирована в клетках Е. oli в виде полипептида, являющегося цепочкой аминокислотных остатков (табл. 2.3). Однако организация сигналов инициации транскрипции и трансляции в эукариотических и прокариотических генах в подавляющем большинстве случаев существенно различается (см. 4.1). Поэтому для достижения правильной экспрессии эукариотического гена в клетках Е. oli необходимо поместить кодирующую последовательность этого гена под бактериальные сигналы экспрессии генов. [c.122]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология